MOTIVATION: Repetitive DNA sequences, besides having a variety of regulatory functions, are one of the principal causes of genomic instability. Understanding their origin and evolution is of fundamental importance for genome studies. The identification of repeats and their units helps in deducing the intra-genomic dynamics as an important feature of comparative genomics. A major difficulty in identification of repeats arises from the fact that the repeat units can be either exact or imperfect, in tandem or dispersed, and of unspecified length.
RESULTS: The Spectral Repeat Finder program circu
Сравнительное исследованиеОценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАВалидационное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Rotaviruses are major pathogens of childhood acute gastroenteritis, dominated by rotavirus A (RVA). Outbreaks caused by human rotavirus C (RVC) are rarely reported, and relevant genomic data remain scarce. This genomic investigation of an RVC outbreak improves our understanding of viral diversity and transmission dynamics.
METHODS: We performed epidemiological surveys, nucleic acid testing and whole-genome sequencing (WGS) on specimens from a 2025 RVC-associated gastroenteritis outbreak at a Chinese boarding high school. Sequence alignment, phylogenetic and molecular tracing analy
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The genes coding for two metalloproteases, EcH-I and EcH-II, have been cloned from an Echis pyramidum leakeyi venom gland cDNA library. The cDNA sequences predict two zymogen molecules with strong amino acid sequence similarity and the same domain structure present in other members of the viper metalloprotease/disintegrin gene family. EcH-I and EcH-II contain pro-protein, enzyme and disintegrin domains. Analysis of the cDNAs coding for EcH-I, EcH-II, jararhagin, trigramin and Ht-e reveals a strong similarity, particularly in the untranslated regions and regions coding for the pro-peptide. Comp
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gene regulation by steroid hormones is mediated by binding of the hormone ligand to the corresponding receptor that triggers a complex set of interactions of the hormone receptors with each other, with DNA in chromatin, and with a variety of other proteins. In this review we attempt to summarize what is known about these interactions using as the main example the regulation of mouse mammary tumor virus transcription by glucocorticoids and progestins. We describe in some detail the interaction of monomers and homodimers of the steroid receptors with their recognition sequences, and the molecula
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rat hepatocellular carcinomas and normal liver have been screened for mRNA sequences which are more abundant in the carcinomas than in livers. The screen was done by differential colony hybridization of a cDNA library constructed from the mRNA of a primary tumor induced by diethylnitrosamine (DEN). One cDNA was isolated which hybridizes to a 900 nucleotide mRNA present in abundance in six chemically induced rat hepatomas (both primary and transplantable), but is not detectable in normal adult or fetal (17 day) liver. The nucleotide sequence of this cDNA is identical to that reported by Suguoka
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The 7.5-kb plasmid of Chlamydia trachomatis, trachoma biovar, was mapped for restriction enzyme sites and sequenced. The complete nucleotide sequence, the first reported for any chlamydial plasmid, revealed nine open reading frames which could code for polypeptides greater than 10 kDa. These putative polypeptides contain 35-47% hydrophobic amino acid residues. Two putative polypeptides of 30 kDa are highly basic and one of 23 kDa is acidic. A region composed of four 22-bp repeats, AT-rich clusters, an inverted repeat, and a 30-kDa basic protein is similar in organization to the origins of repl
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Autoantibodies to type VII collagen are associated with the blistering diseases epidermolysis bullosa acquisita and bullous systemic lupus erythematosus. We showed previously that these autoantibodies recognize epitopes within the noncollagenous (NC1) region of type VII collagen. That region is composed of fibronectin type III homology units that may contribute to intermolecular cross-linking and basement membrane adhesion functions of type VII collagen. In this study, we defined the specific amino acid sequences recognized by these autoantibodies. By fusion protein analysis, sera from patient
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We have cloned and sequenced the putative human tyrosinase pseudogene, which shares more than 98% nucleotide homology with exon 4 and exon 5 of the human tyrosinase gene including their flanking introns. Because of such a high homology, both the tyrosinase gene and its pseudogene could be amplified from genomic DNA by polymerase chain reaction. The nucleotide sequences presented thus enable us to discriminate the tyrosinase gene from its related sequences and are invaluable for a gene diagnosis of oculocutaneous albinism.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Previously the human nucleotide excision repair gene ERCC3 was shown to be responsible for a rare combination of the autosomal recessive DNA repair disorders xeroderma pigmentosum (complementation group B) and Cockayne's syndrome (complementation group C). The human and mouse ERCC3 proteins contain several sequence motifs suggesting that it is a nucleic acid or chromatin binding helicase. To study the significance of these domains and the overall evolutionary conservation of the gene, the homolog from Drosophila melanogaster was isolated by low stringency hybridizations using two flanking prob
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Japanese Red Cross has been conducting a nucleic acid amplification test (NAT) screening for hepatitis B virus (HBV), hepatitis C virus and human immunodeficiency virus 1 among blood donors since July 1 1999. The first case of HBV genotype H was found and reported in Japan. Serological markers of HBV were not detected in this NAT-positive donation. It may be that the positive donation was in the serological window period at the early stage of infection. The complete genome of 3215 nt was sequenced, and the sequence had 99.3 % homology with the strain from Los Angeles, USA (LSA2523). Here,
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The mouse genome contains at least three copies of sequences homologous to the "paired box", a conserved domain in several Drosophila segmentation genes of the pair-rule and segment polarity classes. Overlapping phages were isolated from two different genomic libraries using the Drosophila gooseberry distal paired box as a probe. The hybridizing sequences are highly homologous to the conserved Drosophila paired box sequences. A single 3.1 kb Pax 1 (paired box gene) transcript was detected during embryonic development, whereas no transcripts were detected in adult tissues. Detailed in situ hybr
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We determined the nucleotide sequence of the gene encoding staphylococcal enterotoxin A (entA). The gene, composed of 771 base pairs, encodes an enterotoxin A precursor of 257 amino acid residues. A 24-residue N-terminal hydrophobic leader sequence is apparently processed, yielding the mature form of staphylococcal enterotoxin A (Mr, 27,100). Mature enterotoxin A has 82, 72, 74, and 34 amino acid residues in common with staphylococcal enterotoxins B and C1, type A streptococcal exotoxin, and toxic shock syndrome toxin 1, respectively. This level of homology was determined to be significant bas
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A type C retrovirus (designated HTLV) recently isolated from a cell line derived from a lymph node and later from peripheral blood of a person with cutaneous T-cell lymphoma (mycosis fungoides) was characterized by nucleic acid hybridization experiments. HTLV [3H]cDNA hybridized 90% to its own 70S RNA with kinetics consistent with the genetic complexity of other retroviruses, but it did not hybridize substantially to RNA or proviral DNA from any animal retroviruses (types B, C, and D), including those from nonhuman primates. Conversely, [3H]cDNA from other retroviruses did not hybridize to RNA
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To obtain the information on the genetic control of toxin production in the botulism causative agents, the oligonucleotides were synthesized as the molecular probes by translation of the amino acid sequence of the botulinic type A neurotoxin. The optimal conditions for hybridization of botulinic DNA with the synthetic DNA probes were determined and the probes specificity was demonstrated. The DNA fragments homologous to the probes used were shown to belong to bacterial genome, but not to bacteriophage one.
Аннотация на английскомСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Zhonghua shi yan he lin chuang bing du xue za zhi = Zhonghua shiyan he linchuang bingduxue zazhi = Chinese journal of experimental and clinical virology2007chi
OBJECTIVE: To investigate the etiology of the outbreak of viral encephalitis in Jinan area in 2003.
METHODS: Virus-specific nucleic acid fragments were amplified by random PCR and RT-PCR using specific primers to enterovirus. After sequencing, the gene sequence was handled by the program BLAST for homologous analysis and the software Clustal W 1.82 for multiple sequence alignment to identify the etiology and its genotype.
RESULTS: Five strains were isolated from clinical specimens. A gene fragment for one strain was acquired using random PCR, which was highly homologous to enterovirus. Then,
Аннотация на английскомСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The purification and partial sequencing of two phospholipase A2 toxins from the venom of Kenyan E. carinatus leakeyi is described. The two proteins exhibit sequence homology with other toxic phospholipases. Both have a molecular weight in the region of 16,000 and are purified to homogeneity from crude venom by a single high performance liquid chromatography. The role of these proteins in the toxicity of the venom remains to be established.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Cysticercosis and hydatidosis seriously affect human health and are responsible for considerable economic loss in animal husbandry in non-developed and developed countries. S3Pvac and EG95 are the only field trial-tested vaccine candidates against cysticercosis and hydatidosis, respectively. S3Pvac is composed of three peptides (KETc1, GK1 and KETc12), originally identified in a Taenia crassiceps cDNA library. S3Pvac synthetically and recombinantly expressed is effective against experimentally and naturally acquired cysticercosis.
METHODOLOGY/PRINCIPAL FINDINGS: In this study, the
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Irreversible and unspecific inhibitors of MAO were the first modern antidepressants, but after an initial success they fell into discredit due to adverse side effects. In the past two decades interest in MAO inhibitors has been renewed because of progress in basic research, a milestone being the finding that there are two subtypes of MAO, MAO-A and MAO-B. These are distinct proteins with high amino acid homology, coded by separate genes both located on the short arm of the human chromosome X. The enzyme subforms show different substrate specificities in vitro and different distributions within
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA relatedness among 28 putative strains of Streptomyces ipomoea from geographically diverse locations and the type strain, NRRL B-12321, was determined spectrophotometrically. The data confirm that these 28 strains are not closely related genetically to the plant-pathogenic species Streptomyces scabies (39% DNA relatedness) or Streptomyces acidiscabies (17% DNA relatedness) or any other major blue-spored Streptomyces species (less than 30% DNA relatedness). Of the 29 strains examined, 4 could be clearly distinguished from S. ipomoea on the basis of morphological criteria, i.e., they had gray
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mucopolysaccharidosis IIID results from the deficiency of N-acetylglucosamine 6-sulfatase activity. A Nubian goat with this lysosomal storage disease has been identified. As a first step in developing this animal model for testing treatment methods, we cloned and sequenced the caprine N-acetylglucosamine 6-sulfatase cDNA coding region. Overall there is 88% nucleotide homology between the goat and human sequence and 94% homology of the deduced amino acid sequence. The human and two ruminant species differ by the presence of an imperfect trinucleotide (CCG) repeat in the ruminant signal sequence
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования