Уникальные публикации PubMed, Europe PMC и Crossref, сохранённые в библиотеке. Одна статья учитывается один раз, даже если получена из нескольких источников. Личные исследования и документы команд не публикуются.
Идёт проверка счётчикаДоступно в поиске—
Публикации, уже подготовленные для быстрого поиска. Остальная библиотека подключается в фоне.
Переведено на русский—
Готовые переводы среди доступных в поиске публикаций. Автоматический медицинский перевод и проверка специалистом учитываются отдельно.
Полные тексты—
Найденные полные тексты среди доступных в поиске публикаций. Доступность определяется первоисточником и условиями использования.
Оригиналов на русском—
Русскоязычные оригиналы доступны без ожидания перевода. Ниже — языки остальных оригиналов; для них готовится медицинский перевод на русский.
Пополняем библиотеку по диагнозам—Проверяем состояние обновлений
Для каждого диагноза из справочника МКБ-10 ищем связанные публикации в научных базах и добавляем их в библиотеку. Числа ниже — диагнозы, а не статьи.
Если сбор прервался, тема требует повторной попытки. Уже сохранённые статьи остаются в библиотеке.
Нажмите на показатель для подробностей. Показатели поиска обновляются автоматически; размер всей библиотеки сверяется отдельно. Время последней проверки указано явно.
Результаты поиска
19061 публикаций
Поиск: 438 мс
Публикации на разных языках · PubMed, Europe PMC и данные издателей через Crossref · 5637 с найденным полным текстом
BACKGROUND: Protoplasts have been widely utilized in tissue culture, single-cell RNA sequencing, and transient gene expression analyses. However, the primary challenge in their preparation lies in the efficient removal of rigid cell walls to obtain high-quality plant cells. The aim of this study is to establish an effective method for protoplast isolation from saffron (Crocus sativus L.), thereby accelerating advances in molecular biology research in this species.
RESULT: Tissue-specific protoplasts were successfully isolated from apical buds, petals, leaves, and roots of saffron, with yields
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study maps the cellular landscape of the principal genes (EDN1, EDN2, EDN3, EDNRA, EDNRB, ECE1, and ECE2) in the endothelin signaling pathway using published single cell/nucleus RNA sequencing data, comparing cellular expression in healthy fetal, healthy adult, or diseased adult human hearts. EDN1 was the most abundantly expressed gene, principally localized to endothelial cells from all three conditions. EDN2 and EDN3 expression was only detectable in epicardial mesothelial cells forming the outer layer of the heart, important for cardiac development. EDNRA was expressed in contractile c
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A subset of patients with mycosis fungoides (MF) progress to the tumor stage, which correlates with a worse clinical outcome. The molecular events driving this progression are not well-understood. To identify the key molecular drivers, we performed gene expression profiling (GEP) using NanoString. Ten formalin-fixed/paraffin-embedded skin biopsies from six patients (six non-tumor and four tumor MF) were included; non-tumor and tumor samples were available in three patients. Laser capture/single cell microdissection of epidermotropic MF cells was used for non-tumor cases. We found that the RNA
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A complex and gradual process, the epithelial-mesenchymal transition (EMT) occurs both during embryonic development and tumor progression. Cells undergo a transition from an epithelial to a mesenchymal state throughout this process. More and more evidence points to EMT as a cause of increased metastatic spread of prostate cancer (PCa), along with stemness enhancement and therapy resistance. Here, we used bioinformatic methods to analyze gene expression microarray data, single-cell RNA sequencing, oncogenes, and tumor suppressor genes (TSGs) in order to reconstruct the network of differentially
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Infection by (re-)emerging RNA arboviruses including Chikungunya virus (CHIKV) and Mayaro virus primarily cause acute febrile disease and transient polyarthralgia. However, in a significant subset of infected individuals, debilitating arthralgia persists for weeks over months up to years. The underlying immunopathogenesis of chronification of arthralgia upon primary RNA-viral infection remains unclear. Here, we analysed cell-intrinsic responses to ex vivo arthritogenic alphaviral infection of primary human synovial fibroblasts isolated from knee joints, one the most affected joint types during
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The issue of male fertility is becoming increasingly common due to genetic differences inherited over generations. Gene expression and evaluation of non-coding RNA (ncRNA), crucial for sperm development, are significant factors. This gene expression can affect sperm motility and, consequently, fertility. Understanding the intricate protein interactions that play essential roles in sperm differentiation and development is vital. This knowledge could lead to more effective treatments and interventions for male infertility.
MATERIALS AND METHODS: Our research aim to identify new and
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Several studies described single nucleotide polymorphisms (SNPs) on pattern recognition receptor (PRR) such as toll-like receptors (TLRs), dendritic cell-associated C-type lectin-1 (Dectin-1/CLEC7A) genes of patients with invasive fungal infections (IFIs) caused by Candida and Aspergillus. We screened TLR4, Dectin-1 and PTX3 polymorphisms in a Turkish population with invasive aspergillosis (IA) underlying haematological malignancies.
METHODS: In this case-control study, a cohort of 59 patients with haematological malignancies were included. There were 26 IA patients assigned by th
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Perturbation screens hold the potential to systematically map regulatory processes at single-cell resolution, yet modeling and predicting transcriptome-wide responses to perturbations remains a major computational challenge. Existing methods often underperform simple baselines, fail to disentangle measurement noise from biological signal, and provide limited insight into the causal structure governing cellular responses. Here, we present the latent causal diffusion (LCD), a generative model that frames single-cell gene expression as a stationary diffusion process observed under measurement noi
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Predicting single-cell transcriptional responses to perturbations is central to dissecting gene regulation and accelerating therapeutic design, yet the field lacks a rigorous, task-spanning assessment of model behavior. We present a large-scale benchmark of 13 representative methods and baselines across 25 datasets spanning diverse perturbation modalities and species, including two primary immune-cell drug-response resources. We evaluated three core tasks-generalization to unseen single-gene perturbations, prediction of combinatorial interactions, and transfer across cell types-using 24 metric
СтатьяСравнительное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) is a widely used technique for characterizing individual cells and studying gene expression at the single-cell level. Clustering plays a vital role in grouping similar cells together for various downstream analyses. However, the high sparsity and dimensionality of large scRNA-seq data pose challenges to clustering performance. Although several deep learning-based clustering algorithms have been proposed, most existing clustering methods have limitations in capturing the precise distribution types of the data or fully utilizing the relationships between ce
СтатьяПоддержка правительства СШАПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
There is a wealth of software that utilizes single-cell RNA-seq (scRNA-seq) data to deconvolve spatial transcriptomic spots, which currently are not yet at single-cell resolution. Here we provide protocols for implementing Seurat and Giotto packages to elucidate cell-type distribution in our example human ureter scRNA-seq dataset. We also describe how to create a stand-alone interactive web application using Seurat libraries to visualize and share our results. For complete details on the use and execution of this protocol, please refer to Fink et al. (2022).1.
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MOTIVATION: Understanding complex cellular neighborhoods has provided new insights into tissue biology. Accurate neighborhood identification is crucial, yet existing methods often focus on hard assignment and do not generate cell-specific neighborhood profiles at single-cell level.
RESULTS: We developed hoodscanR, a Bioconductor package identifying and analyzing cellular neighborhoods in spatial data. The central output of hoodscanR is a cell-level neighborhood probability profile, which represents partial membership of each cell across multiple annotation-defined neighborhoods. This probabil
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Identification of new cell subtypes in single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) data is critically crucial in accurately understanding the mechanisms of disease occurrence and development, which provides unprecedented insights into the development of therapeutic strategies, however, despite the abundance of existing methods, most heavily rely on the reference with the fixed cell labels, which fail to uncover new cell subtypes. Herein, we propose Subtypist, a fully data-driven multiscale iterative algorithm for cell subtype identification in scRNA-seq data without relying on external prior refere
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Phylogenetic methods are emerging as a useful tool to understand cancer evolutionary dynamics, including tumor structure, heterogeneity, and progression. Most currently used approaches utilize either bulk whole genome sequencing or single-cell DNA sequencing and are based on calling copy number alterations and single nucleotide variants (SNVs). Single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) is commonly applied to explore differential gene expression of cancer cells throughout tumor progression. The method exacerbates the single-cell sequencing problem of low yield per cell with uneven expression level
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sepsis has a high mortality rate, yet the cellular heterogeneity and transcriptional regulatory programs associated with divergent clinical outcomes remain incompletely understood. Here, we integrated two peripheral blood single-cell RNA-seq cohorts to explore prognosis-associated immune remodeling patterns in sepsis. Using reference-based annotation, pySCENIC-inferred regulon activity, pathway enrichment, and CellChat based ligand-receptor inference, we observed broad differences in cell composition, transcriptional programs, and intercellular communication between survivors and non-survivors
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spatial transcriptomics platforms such as 10x Visium capture whole-transcriptome expression but at spot-level resolution where each measurement aggregates multiple cells. Existing computational deconvolution methods require external scRNA-seq references, and the growing set of morphology-guided methods (iStar, SpaHDmap, GHIST, Thor, PRTS) each requires per-dataset model training or paired subcellular spatial data. Here we present SpatialCell AI, the first framework to combine training-free operation, reference-free expression integration, and per-cell output granularity for spatial transcripto
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Burn injuries are prevalent and have a significant effect on patients' quality of life and healthcare costs. Current treatment modalities, such as wound care and surgical interventions, often face challenges due to complications like infection and inadequate healing.
METHODS: This study adopted single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) to investigate the cellular landscape of the burn microenvironment. After rigorous quality control filtering, 9,248 cells were retained for analysis. Using UMAP dimensionality reduction, these cells were annotated into 14 subpopulations, including Neutrop
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Single-Cell Pediatric Cancer Atlas (ScPCA) Portal is a resource for uniformly processed single-cell and single-nucleus RNA sequencing (RNA-seq) data and de-identified metadata from pediatric tumor samples. Originally comprising data from 10 projects funded by Alex's Lemonade Stand Foundation (ALSF), the Portal currently contains summarized gene expression data for over 700 samples across 55 cancer types from ALSF-funded and community-contributed datasets. Downloads include expression data as SingleCellExperiment or AnnData objects containing raw and normalized counts, principal-component a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The advent of single-cell genomics has revealed profound cellular heterogeneity, yet transcriptomic profiling alone often fails to show the functional proteomic state of a cell. Cellular indexing of transcriptomes and epitopes by sequencing (CITE-seq) emerged to bridge this critical gap, enabling the simultaneous quantification of RNA and surface protein expression within individual cells. This transformative technology leverages oligonucleotide-conjugated antibodies to assess protein abundance using a panel of marker-specific tags, which are cocaptured with cellular messenger RNA in single-ce
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Acute-on-chronic liver failure (ACLF) is a clinical syndrome characterized by acute deterioration of liver function on the basis of chronic liver disease, primarily manifested as liver and/or extrahepatic organ failure. Due to its rapid progression and poor prognosis, ACLF poses a serious threat to the patient's life. The pathogenesis process of ACLF is extremely complex, with overactivation and dysregulation of the immune system playing key roles in disease development. The high heterogeneity and complexity of immune cells have limited systematic understanding of the disease mechanisms and hi
СтатьяОбзорАннотация на английскомПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.