Ribonuclease T2, nuclease S1, and snake venom phosphodiesterase were used as a structural probe for investigation of the interaction between Escherichia coli tRNAfMet and methionyl-tRNA synthetase, and the cleavage sites were analyzed by a rapid sequencing gel electrophoresis of 5'-32P-labeled tRNA. Both endonucleases cleaved the D-loop of synthetase-bound tRNA much more extensively than that of the free tRNA. Positions of A14, G15, A22, and G23 in the D-loop and C35 in the anticodon of the synthetase-bound tRNA were more susceptible to RNase T2. The synthetase-bound tRNA was predominantly cle
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Our recent findings suggest that enzymatic hydrolysis of the intradimer phosphodiester bond may constitute the initial step in the repair of UV light-induced cyclobutane pyrimidine dimers in human cells. To examine the susceptibility of this phosphodiester linkage to enzyme-mediated hydrolysis, the trinucleotide d-Tp-TpT was UV-irradiated and the two isomeric compounds containing a cis-syn-cyclobutane dimer were isolated by high performance liquid chromatography and treated with various deoxyribonucleases. Snake venom phosphodiesterase hydrolyzed only the 3'-phosphodiester group in the 5'-isom
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nerve growth factor (NGF) produced by telencephalic neurons provides critical trophic support for cholinergic neurons of the basal forebrain. In situ hybridization and nuclease protection analyses demonstrate that limbic seizures dramatically increase the amount of messenger RNA for NGF in the neurons of the hippocampal dentate gyrus within 1 hour of seizure onset and in broadly distributed neocortical and olfactory forebrain neurons some hours later. The increased messenger RNA species is indistinguishable from messenger RNA for transcript B of the beta subunit of NGF from mouse submandibular
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We describe physicochemical and enzymatic properties of 5' bridging phosphorothioester linkages at specific sites in DNA oligonucleotides. The susceptibility to hydrolysis at various pH values is examined and no measurable hydrolysis is observed at pH 5-9 after 4 days at 25 degrees C. The abilities of three 3'- and 5'-exonuclease enzymes to hydrolyze the DNA past this linkage are examined and it is found that the linkage causes significant pauses at the sulfur linkage for T4 DNA polymerase and calf spleen phosphodiesterase, but not for snake venom phosphodiesterase. Restriction endonuclease (N
СтатьяПоддержка правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
8,5'-cyclopurine-2'-deoxynucleosides in DNA are repaired by nucleotide-excision repair, and act as strong blocks to DNA polymerases, RNA polymerase II and transcription factor binding. Thus, it is important to accurately determine the level of these lesions in DNA. There is controversy in the literature regarding the ability of different enzymes to release these compounds from oligodeoxynucleotides or DNA. We used liquid chromatography/mass spectrometry (LC/MS) to investigate the ability of several enzymes to release (5'S)-8,5'-cyclo-2'-deoxyadenosine [(5'S)-cdA] from dinucleotides and oligode
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
2'-O-Methyloligoribonucleotides, deoxyoligonucleotides and 2'-O-methyl/deoxy gapmers were synthesized using solid phase phosphoramidite chemistry employing the 2-(4-nitrophenyl)ethyl (npe) protection strategy. Melting temperatures of the synthesized oligonucleotides as well as their stability against degradation by several different nucleases were determined. 2'-O-Methyloligoribonucleotides showed the highest melting temperatures (Tm's) whereas 2'-O-methyl/deoxy gapmers revealed either slightly higher or surprizingly no thermal stabilities compared with their deoxy analogs when using self-comp
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The distribution of basic fibroblast growth factor (bFGF) mRNA in normal rat forebrain, and the influence of recurrent seizure activity on the expression of this mRNA, was evaluated using in situ hybridization and S1 nuclease protection techniques. In the untreated adult rat, hybridization of 35S-labeled bFGF cRNA densely labeled neurons in a few discrete areas including the tenia tecta, indusium gresium, and hippocampal stratum pyramidale of regions CA2 and rostromedial CA1. Neurons in the prosubiculum and rostromedial dentate gyrus stratum granulosum were lightly labeled. In addition, a diff
СтатьяПоддержка правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Yeast Rad1-Rad10 (XPF-ERCC1 in mammals) incises UV, oxidation, and cross-linking agent-induced DNA lesions, and contributes to multiple DNA repair pathways. To determine how Rad1-Rad10 catalyzes inter-strand crosslink repair (ICLR), we examined sensitivity to ICLs from yeast deleted for SAW1 and SLX4, which encode proteins that interact physically with Rad1-Rad10 and bind stalled replication forks. Saw1, Slx1, and Slx4 are critical for replication-coupled ICLR in mus81 deficient cells. Two rad1 mutations that disrupt interactions between Rpa1 and Rad1-Rad10 selectively disable non-nucleotide e
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Cas9 endonuclease can be programmed by guide RNA to introduce sequence-specific breaks in genomic DNA. Thus, Cas9-based approaches present a range of novel options for genome manipulation and precision editing. African trypanosomes are parasites that cause lethal human and animal diseases. They also serve as models for studies on eukaryotic biology, including 'divergent' biology. Genome modification, exploiting the native homologous recombination machinery, has been important for studies on trypanosomes but often requires multiple rounds of transfection using selectable markers that integr
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Highly purified DNA obtained from calf thymus nuclei was found to cleave after reaction with a chelating agent and subsequent dialysis against 0.01 M phosphate. During the cleavage release of proteineous material into the dialysate was observed. By means of anion exchange resin column chromatography, this material was separated into 9 main fractions. Two of these fractions P1 and P5) were found to contain the amino acids phosphoserine, asp, thr, ser, glu, gly, ala, val, ile, leu, and arg, as well as metal ion complexes of phosphoserine. The complexes were dissociated by Chelex 100 treatment. T
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Huntington's disease (HD) is a currently incurable and, ultimately, fatal neurodegenerative disorder caused by a CAG trinucleotide repeat expansion within exon 1 of the huntingtin (HTT) gene, which results in the production of a mutant protein that forms inclusions and selectively destroys neurons in the striatum and other adjacent structures. The RNA-guided Cas9 endonuclease from CRISPR-Cas9 systems is a versatile technology for inducing DNA double-strand breaks that can stimulate the introduction of frameshift-inducing mutations and permanently disable mutant gene function. Here, we show tha
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A new sensitive 32P-postlabeling assay for DNA adducts has been developed in which DNA is hydrolyzed initially by nuclease P1 and prostatic acid phosphatase instead of micrococcal nuclease and spleen phosphodiesterase as employed in previous postlabeling procedures. When DNA containing bulky adducts, X1, X2, .....Xn, is digested with nuclease P1 at pH 5, normal nucleotides are released as 5'-monophosphates, pN, while adducts are excised as 5'-phosphorylated dinucleotides, pXipN, because internucleotide linkages on the 3' side of X resist attack by nuclease P1. Addition of prostatic acid phosph
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chronic viral infections remain a major public health issue affecting millions of people worldwide. Highly active antiviral treatments have significantly improved prognosis and infection-related morbidity and mortality but have failed to eliminate persistent viral forms. Therefore, new strategies to either eradicate or control these viral reservoirs are paramount to allow patients to stop antiretroviral therapy and realize a cure. Viral genome disruption based on gene editing by programmable endonucleases is one promising curative gene therapy approach. Recent findings on RNA-guided human immu
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We studied the effects of deoxyribonucleases on the detection of 5-bromo-2-deoxyuridine (BrdUrd) by anti-BrdUrd monoclonal antibodies (mAbs). After DNase I treatment, BrdUrd was detected in cells fixed on slides with the anti-BrdUrd mAbs, B44 and BMC9318. The level of detection related to the degree of DNA digestion. DNA digestion of 25-75% resulted in levels of staining comparable to control preparations in which DNA was denatured by heating with formamide. Staining with the mAbs of DNase I-treated cells was abolished with S1 nuclease, a single-stranded DNA-specific nuclease. When exonuclease
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Expression of the metallothionein gene is known to be induced by glucocorticoids in a variety of cells. Here we show that in human cell lines containing functional progesterone receptors, the endogenous metallothionein-IIA (hMTIIA) gene is inducible by the synthetic progestins R5020 and medroxy-progesterone acetate. That this effect reflects a direct interaction with the metallothionein gene is supported by our finding that the partially purified progesterone receptor binds to the promoter region of the gene in vitro. The limits of the DNase I footprint and the guanine residues protected in me
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
ERCC1-XPF is a heterodimeric protein complexinvolved in nucleotide excision repair and recombinational processes. Like its homologous complex in Saccharomyces cerevisiae , Rad10-Rad1, it acts as a structure-specific DNA endonuclease, cleaving at duplex-single-stranded DNA junctions. In repair, ERCC1-XPF and Rad10-Rad1 make an incision on the the 5'-side of the lesion. No humans with a defect in the ERCC1 subunit of this protein complex have been identified and ERCC1-deficient mice suffer from severe developmental problems and signs of premature aging on top of a repair-deficient phenotype. Xer
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Replication-initiating HUH-endonucleases (reps) are enzymes that form covalent bonds with single-stranded DNA (ssDNA) in a sequence-specific manner to initiate rolling circle replication in plasmids and viruses. These nucleases have been co-opted for use in biotechnology as sequence-directed protein-ssDNA bioconjugation fusion partners dubbed 'HUH-tags'. Here, we describe the engineering and in vitro characterization of a series of laboratory evolved HUH-tag derivatives of PCV2 called E1 and E2. E2 is capable of forming robust covalent bonds with unmodified RNA substrates in a sequence-specifi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The in vivo transcription start sites of the nah and sal operons of the NAH7 plasmid were determined by S1 nuclease mapping and the nucleotide sequence surrounding these transcription start sites was determined. Since expression of both of these operons is coordinately controlled by the product of the transcriptional activator gene nahR, the sequences were compared to locate potential sites involved in common regulation. In the 100-base-pair region preceding transcription start sites of both operons, three regions of extensive homology were found and may be involved in nahR-mediated transcript
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The synthesis of oligodeoxynucleotides (ODNs) containing 5-[N-[2-[N,N-bis(2-aminoethyl)amino]ethyl]-carbamoyl]-2'-deoxyuridine (BAE) and 5-[N-[3-[N,N-bis(3-aminopropyl)amino]propyl]carbamoyl]-2'- deoxyuridine (BAP) is described. The thermal stabilities of duplexes containing these ODNs and either the complementary DNA or RNA strand and of triplexes consisting of these ODNs and the target duplex were studied by thermal denaturation. ODNs containing BAE or BAP stabilize duplex formation with either the complementary DNA or RNA strands but destabilize triplex formation with the target duplex. Fur
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We studied the mechanism of POMC gene expression in human nonpituitary tumors that is responsible for the ectopic ACTH syndrome. All tumors contained a 1200-nucleotide (nt) POMC mRNA species identical to that in normal and tumoral pituitaries. In two of six nonpituitary tumors, equivalent amounts of a larger, ca. 1450-nt POMC mRNA species were also present. S1 mapping studies with probes encompassing the three exons of the gene revealed that this larger POMC mRNA species was 5' extended; the other regions were identical to that in the 1200-nt POMC mRNA. In order to analyze the 5'-end of the la
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.