Aptamer is a promising therapeutic modality, offering strong target affinity and target versatility. In the previous studies, DNA aptamers with potent thrombin inhibitory activity, M08s-1 and its bivalent derivatives, have been developed as novel anticoagulant agents. Among them, the heterobivalent aptamer Pse08-29 exhibits the most potent ex vivo anticoagulant activity, surpassing the approved drug argatroban. However, its long oligonucleotide chains composed of 106 nucleotides may hinder its drug development due to limited chemical synthetic efficiency. Here, a segmented form of Pse08-29 com
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ligands of high specificity and selectivity have been selected for biological molecules of interest including nicotinic acetylcholine receptor (nAChR) using combinatorial libraries of nucleic acids. The nAChR belongs to a group of structurally related proteins that regulate signal transmission between ~ 1012 cells of the mammalian nervous system. It is inhibited by both therapeutic agents and abused drugs, including cocaine. A mechanism-based approach to alleviating noncompetitive inhibition of the mucle-type nAChR, including Torpedo, resulted in the selection of very short DNA aptamers only s
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We recently reported that some adenosine binding aptamers can also bind caffeine and theophylline with around 20-fold lower affinities. This discovery led to the current work to examine the cross-binding of adenosine to theophylline aptamers. For the DNA aptamer for theophylline, cross-binding to adenosine was observed, and the affinity was 18 to 38-fold lower for adenosine based on assays using isothermal titration calorimetry and ThT fluorescence spectroscopy. The binding complexes were characterized using NMR spectroscopy, and both adenosine and theophylline showed an overall similar bindin
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aptamers are powerful tools for detecting and analyzing biomolecules that consist of proteins or nucleic acids. However, their application to aptamers against viroids-highly structured self-replicating RNAs-has not yet been explored. In this study, a magnetic bead- and high-throughput sequencing-based SELEX (MB-HTS-SELEX) protocol for selecting potential aptamers against potato spindle tuber viroid (PSTVd) is presented. Full-length biotinylated-PSTVd RNA was transcribed in vitro, immobilized on streptavidin-coated magnetic beads, and incubated with a library of ~3.32 × 1014 molecules of random
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Zoonotic diseases have become a significant public health concern due to their capacity to cross species barriers and cause widespread outbreaks. Conventional diagnostic and therapeutic strategies often lack the specificity, sensitivity, and rapid adaptability required for effective disease management. Therefore, aptamers, single-stranded oligonucleotides, have emerged as powerful tools in detection and therapeutics. This review elucidates the role of aptamer-based technologies in diagnosing and treating bacterial, viral, and parasitic zoonoses, including Leptospira, Helicobacter pylori, rabie
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Therapeutic drug monitoring of mycophenolic acid (MPA), the active metabolite of the immunosuppressant mycophenolate mofetil (MMF), is clinically important due to its narrow therapeutic window. In this work, a library-immobilized SELEX strategy was employed to isolate DNA aptamers capable of recognizing both MPA and MMF. Among the selected candidates, a dual-recognition aptamer (MPA-1) exhibited specific binding toward MPA and MMF, with dissociation constants (Kd) of 13.7 µM and 5.5 µM, respectively, as determined by a thioflavin T (ThT) fluorescence assay. Consistent binding affinities were o
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aptamers are single-stranded synthetic oligonucleotides that bind noncovalently to targets with high affinity and selectivity. They are generated through an in vitro selection process known as Systematic Evolution of Ligands by Exponential Enrichment. Aptamers show significant promise in cancer diagnostics and therapeutics due to their specificity, versatility, and tunable biochemical properties. Aptamers can be used to target cellular biomarkers, which are detectable molecules that can indicate specific physiological states of cells, organs, and organisms, making them valuable indicators for
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Expanding the chemical repertoire of canonical nucleotides is key to unlocking the full functional potential of aptamers for diagnostic use. Herein, click-systematic evolution of ligands by exponential enrichment (SELEX) is employed to generate chemically modified DNA aptamers, termed clickmers, that target the SARS-CoV-2 spike (CoV2-S) glycoprotein. Two independent split-combine selection strategies yield distinct clickmer families functionalized with benzofuran or indole moieties. Lead candidates (BF1 and N2) demonstrate nanomolar affinity for wild-type CoV2-S and maintain binding to multipl
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We report a targeted prodrug delivery platform that can deliver a cytostatic nucleobase analog with high drug loading. We chose fluorouracil (5FU), a drug used to treat various cancers, whose active metabolite 5-fluorodeoxyuridine monophosphate (5-FdUMP) is the antineoplastic agent. We use terminal deoxynucleotidyl transferase (TdT) to polymerize 5-fluorodeoxyuridine triphosphate (5-FdUTP) onto the 3'-end of an aptamer. We find that (i) addition of hydrophobic, unnatural nucleotides at the 3'-end of the 5-FdU polynucleotide by TdT leads to their spontaneous self-assembly into nuclease resistan
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
With the rapid advancement of molecular biology and biosensing technologies, precise molecular profiling of cancers based on their molecular characteristics has become an urgent need to guide individualized treatment. Molecular profiling of bladder cancer is therefore of critical importance for diagnosis, treatment, and prognosis monitoring, providing a key direction for precise medicine. Here, we developed a novel strategy for multi-parameter precise molecular profiling of bladder cancer based on an aptamer probe package. A series of high specificity and affinity aptamers against bladder canc
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RNA aptamers are often used as ligand-recognition modules in engineered RNA systems, but integration into larger RNA constructs can influence stability and ligand binding. As a result, aptamer sequences may need to be adapted to new environments while preserving essential properties. Here, we examine this sequence editability problem for the theophylline RNA aptamer. Starting from the experimentally determined structure, we introduced targeted mutations in peripheral structural elements while leaving the recognition site unchanged. The native aptamer, mutated variants, a Mg2+-depleted system,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Despite various methods for detecting and treating SARS-CoV-2, affordable and easily applicable solutions are still needed. Aptamers can potentially fill this gap. Here, we establish a workflow to identify aptamers that bind to the spike proteins of SARS-CoV-2, a process applicable to other targets as well. The spike protein is crucial for the virus's entry into host cells. The aptamer development process for the spike protein's receptor binding domain (RBD) begins with splitting the SARS-CoV-2's genome into 40 nucleotide-long sequences, predicting their two-dimensional structure, and sorting
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
An approach for the agnostic identification and validation of aptamers for the prediction of a medical state from plasma analysis is presented in application to a key risk factor for Alzheimer's disease. brain amyloid deposition. This method involved the use of a newly designed aptamer library with sixteen random nucleotides interspersed with fixed sequences called a Neomer library. The Neomer library approach enables the direct application of the same starting library on multiple plasma samples, without the requirement for pre-enrichment associated with the traditional approach. Eight aptamer
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aptamers are perfect tools to study the interaction of small ligands with RNA. To study the mode of interaction of tetracycline with RNA, we isolated aptamers with high affinity to this antibiotic via in vitro selection. One of the selected aptamers, cb28, which has a comparable affinity to tetracycline as the small ribosomal subunit, was characterised in more detail. Cb28 binds only to typical tetracyclines, while atypical tetracyclines are not recognised. The hydroxyl group at position 6 is an essential determinant for recognition, while modifications at positions 4, 5 and 7 do not interfere
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Efficient evaluation of aptamer candidates after systematic evolution of ligands by exponential enrichment (SELEX) remains limited by the time and cost required for direct kinetic characterization. We developed a centrifugal microspin filtration (MSF)-based MSF-koff assay for retention-based, dissociation-sensitive pre-screening of aptamer candidates. Repeated washing preferentially removes rapidly dissociating aptamers from target-immobilized magnetic beads, and the retained aptamers are quantified by quantitative polymerase chain reaction and expressed as Wash 0-normalized retention (W0-NRT)
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Increasing trends in the incidence rate and death rate in hematological disorders, specifically hematological malignancies, indicate the need for advancements in therapeutic approaches. Various hematological disorders include hemophilia, leukemia, lymphoma, myeloma, thrombocytopenia, sickle cell anemia, thalassemia, polycythemia vera, and aplastic anemia. Chemotherapy, cytoreductive therapy, and monoclonal antibodies are typically used for the treatment of hematological disorders. Stem cell transplantation is also performed for this purpose. However, these conventional therapeutic approaches e
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aptamers are promising affinity ligands with considerable applications, such as biosensors, disease diagnosis, therapy, etc. Characterization of aptamer-target binding is important in aptamer selection and aptamer applications. Microscale thermophoresis (MST) is an emerging optical technique for molecular interactions, which monitors fluorescence responses of fluorescent molecules in a microscopic temperature gradient. Harnessing merits in trace sample consumption, high speed, free separation, free immobilization, and ratiometric analysis, MST draws intense wide attention. MST is often applied
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Animal diseases often have significant consequences due to the unclear and time-consuming diagnosis process. Furthermore, the emergence of new viral infections and drug-resistant pathogens has further complicated the diagnosis and treatment of viral diseases. Aptamers, which are obtained through systematic evolution of ligands by exponential enrichment (SELEX) technology, provide a promising solution as they enable specific identification and binding to targets, facilitating pathogen detection and the development of novel therapeutics. This review presented an overview of aptasensors for anima
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Aiming at complete excision of cholesteatoma during trympanomastoidectomy and therefore reducing the risk of recurrence, intraoperative imaging techniques are required to assist the visualization of cholesteatoma residue. Galectin-7 has been demonstrated to be a biomarker for cholesteatoma matrix and used for intraoperatively identifying the excision margins.
METHODS: A galectin-7-targeted DNA-aptamer library was generated for labeling the cholesteatoma matrix using cell-systematic evolution of ligands by an exponential enrichment technique. The binding characteristics of the identif
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The abuse of ribavirin, an antiviral drug, in poultry breeding can cause quality degradation and drug resistance. So it is of great importance to establish a simple and effective method for detecting ribavirin in foods. In this work, aptamers that could especially bind to ribavirin with high affinity were obtained by the Capture-SELEX method. After 15 rounds of enrichment, ssDNA library pool was enriched and then analyzed by high-throughput sequencing. The seven most enriched sequences were selected as candidate aptamers for affinity and specificity characterization. Among the candidate aptame
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования