Mouse Nkx2-5 gene is essential for early heart development and it is regulated by a complex array of regulatory modules. In order to establish an efficient in vivo system for mapping the Nkx2-5 genomic locus for regulatory regions, we developed improved homologous recombination technology for use in Escherichia coli and then knocked an IRES-hrGFP reporter gene into Nkx2-5 gene in a 120 kb Nkx2-5 bacterial artificial chromosome (BAC) clone. We employed the recombination genes redalpha and redbeta under the pBAD promoter, which was specifically induced by the addition of L-arabinose. Recombinati
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Wolbachia endosymbiotic bacteria are widespread in filarial nematodes and are directly involved in the immune response of the host. In addition, antibiotics which disrupt Wolbachia interfere with filarial nematode development thus, Wolbachia provide an excellent target for control of filariasis. A 63.1 kb bacterial artificial chromosome insert, from the Wolbachia endosymbiont of the human filarial parasite Brugia malayi, has been sequenced using the New England Biolabs Inc. Genome Priming System() transposition kit in conjunction with primer walking methods. The bacterial artificial chromosome
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: The root barks of Periploca sepium Bge. (P. sepium) has been used in traditional Chinese medicine for healing wounds and treating rheumatoid arthritis. However, toxicity in high-doses was often diagnosed by the presence of many glycosides. The potential mutagenicity of P. sepium was investigated both in vitro and in vivo.
METHODS: This was examined by the bacterial reverse mutation (Ames) test using Escherichia coli WP2uvrA and Salmonella typhimurium strains, such as TA98, TA100, TA1535, and TA1537. Chromosomal aberrations were investigated using Chinese hamster lung cells, and th
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Using a rapid and reliable system based on Tn7-mediated site-specific transposition, we have successfully constructed a recombinant Oka varicella vaccine (vOka) expressing the mumps virus (MuV) fusion protein (F). The backbone of the vector was our previously reported vOka-BAC (bacterial artificial chromosome) genome. We inserted the transposon Tn7 attachment sequence, LacZalpha-mini-attTn7, into the region between ORF12 and ORF13 to generate a vOka-BAC-Tn genome. The MuV-F expressing cassette was transposed into the vOka-BAC genome at the mini-attTn7 transposition site. MuV-F protein was expr
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The cloning of herpesviruses as bacterial artificial chromosomes (BACs) has revolutionized the study of herpesvirus biology, allowing rapid and precise manipulation of viral genomes. Several clinical strains of human cytomegalovirus (HCMV) have been cloned as BACs; however, no low-passage strains of murine CMV (MCMV), which provide a model mimicking these isolates, have been cloned. Here, the low-passage G4 strain of was BAC cloned. G4 carries an m157 gene that does not ligate the natural killer (NK) cell-activating receptor, Ly49H, meaning that unlike laboratory strains of MCMV, this virus re
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Infectious bacterial artificial chromosomes (BACs) of herpesviruses are powerful tools for genetic manipulation. However, the presence of BAC vector sequence in the viral genomes often causes genetic and phenotypic alterations. While the excision of the BAC vector cassette can be achieved by homologous recombination between extra duplicate viral sequences or loxP site-mediated recombination, these methods either are inefficient or leave a loxP site mark in the viral genome. Here we describe the use of viral intrinsic repeat sequences, which are commonly present in herpesviral genomes, to excis
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Commonly used antibiotics exert their effects predominantly on rapidly growing bacterial cells; yet, the growth dynamics taking place during infection in a complex host environment remain largely unknown. Hence, a means to measure in situ bacterial growth rate is essential to predict the outcome of antibacterial treatment. We have recently validated chromosome replication as a readout of in situ bacterial growth rate during Escherichia coli infection in the mouse peritonitis model. By the use of two complementary methods (quantitative PCR and fluorescence microscopy) for differential genome or
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
As there is increasing evidence that aberrant defensin expression is related to susceptibility for infectious disease and inflammatory disorders, we sought to determine if copy number of the beta-defensin gene cluster located on chromosome 8p23.1 (DEFB107, 106, 105, 104, 103, DEFB4 and SPAG11), that shows copy number variation as a block, was associated with susceptibility to otitis media (OM). The gene DEFB103 within this complex encodes human beta defensin-3 (hBD-3), an antimicrobial peptide (AP) expressed by epithelial cells that line the mammalian airway, important for defense of mucosal s
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Caspase-8, the proximal enzyme in the death-induction pathway of the TNF/nerve growth factor receptor family, is activated upon juxtaposition of its molecules within the receptor complexes and is then self-processed. Caspase-8 also contributes to the regulation of cell survival and growth, but little is known about the similarities or the differences between the mechanisms of these nonapoptotic functions and of the enzyme's apoptotic activity. In this study, we report that in bacterial artificial chromosome-transgenic mice, in which the aspartate residue upstream of the initial self-processing
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The gene responsible for progressive myoclonus epilepsy of the Unverricht-Lundborg type (EPM1) is located on human chromosome 21q22.3 in a region defined by recombination breakpoints and linkage disequilibrium. As part of an effort to clone the EPM1 gene on the basis of its chromosomal location, we have constructed a 753-kb bacterial clone contig that encompasses the region containing the gene. Because DNA markers from the region did not identify intact yeast artificial chromosome (YAC) clones after screening several libraries, we built the contig from cosmid clones and used bacterial artifici
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Bovine herpesvirus 4 (BoHV-4) is a gammaherpesvirus with a Worldwide distribution in cattle and is often isolated from the uterus of animals with postpartum metritis or pelvic inflammatory disease. Virus strain adaptation to an organ, tissue or cell type is an important issue for the pathogenesis of disease. To explore the mechanistic role of viral strain variation for uterine disease, the present study aimed to develop a tool enabling precise genetic discrimination between strains of BoHV-4 and to easily manipulate the viral genome.
METHODS: A strain of BoHV-4 was isolated from t
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Manipulating viral genomes is an essential technique in reverse genetics and recombinant vaccine development. A strategy for manipulating large viral genomes involves introducing their entire genome into bacterial artificial chromosomes and employing Escherichia coli genetic tools. For sequence manipulation on bacterial artificial chromosomes (bacterial artificial chromosomes recombineering), a well-established method that relies on the Escherichia coli strain GS1783, and the template plasmid, pEPKan-S, is often used. This method, known as markerless DNA manipulation, allows for the generation
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The genome of Protochlamydia amoebophila UWE25, a Parachlamydia-related endosymbiont of free-living amoebae, was recently published, providing the opportunity to search for genomic islands (GIs).
RESULTS: On the residual cumulative G+C content curve, a G+C-rich 19-kb region was observed. This sequence is part of a 100-kb chromosome region, containing 100 highly co-oriented ORFs, flanked by two 17-bp direct repeats. Two identical gly-tRNA genes in tandem are present at the proximal end of this genetic element. Several mobility genes encoding transposases and bacteriophage-related p
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Here we report the isolation, characterization and chromosome localization of a subtracted cDNA (CBS-1) isolated from the human ocular ciliary body which encodes a novel protein. As is deduced from the nucleotide sequence of the cDNA, CBS-1 contains an open reading frame consisting of 182 amino acids, with a molecular weight of 19.5kDa. CBS-1 shares significant nucleotide and amino acid sequence identities (residues 51 to 182) with a hypothetical 15.5kDa protein in the ANSA-GAP intergenic region (yeaA) of Escherichia coli, and the carboxyl terminal region of pilB, a transcription factor involv
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Although bacterial cells typically contain a single chromosome, some species are naturally polyploid and carry multiple copies of their chromosome. Polyploid chromosomes can be identical or heterogeneous, the latter giving rise to bacterial heterozygosity. Although the benefits of heterozygosity are well studied in eukaryotes, its consequences in bacteria are less understood. Here, we examine this question in the context of antibiotic resistance to understand how bacterial genomic heterozygosity affects bacterial survival. Using a cell-wall-deficient model system in the actinomycete Kitasatosp
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The origins of several antibiotic resistance genes have been traced to intrinsic genes present in bacterial chromosomes. The aphA1 gene, which confers resistance to the aminoglycosides kanamycin and neomycin, is commonly found in diverse Gram-negative bacterial pathogens, and is associated with several different mobile genetic elements. However, its origin had not been identified.
OBJECTIVES: To determine whether the aphA1-containing segments in novel compound and pseudo-compound transposons found in three historic plasmids, pIE545, R478 and Rts1, are found in the chromosome of a
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bacterial genomes contain a plethora of secondary replicons of divergent size. Circular replicons must carry a system for resolving dimeric forms, resulting from recombination between sister copies. These systems use site-specific recombinases. Among these, the XerCD recombinase resolves dimers of chromosomes and certain plasmids, using different modes of regulation. We have analyzed the dimer resolution functions in enterobacterial secondary replicons and show that, in addition to the main chromosomes, XerCD is preferentially used by small plasmids and by the largest secondary replicons, mega
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bacteria with multiple chromosomes represent up to 10% of all bacterial species. Unlike eukaryotes, these bacteria use chromosome-specific initiators for their replication. In all cases investigated, the machineries for secondary chromosome replication initiation are of plasmid origin. One of the important differences between plasmids and chromosomes is that the latter replicate during a defined period of the cell cycle, ensuring a single round of replication per cell. Vibrio cholerae carries two circular chromosomes, Chr1 and Chr2, which are replicated in a well-orchestrated manner with the c
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bacterial wilt, caused by Ralstonia spp., poses a major threat to blueberry (Vaccinium corymbosum) production due to its persistence and rapid spread through soil and infected stock, highlighting the need for genetic insights to guide breeding strategies. This study investigated the genetic basis of bacterial wilt resistance in blueberry using a genome-wide association study (GWAS) across two populations comprising 401 advanced selections from the University of Florida Blueberry Breeding and Genomics Program. A high-throughput screening assay was developed to evaluate southern highbush blueber
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Germline-restricted chromosomes (GRCs) constitute a unique class of chromosomes confined to germ cells. Arising in multiple evolutionarily distant lineages, GRCs have been identified in three insect families (non-biting midges, gall midges, and fungus gnats), each within the order Diptera. Genomic characterisation in fungus gnats has revealed GRCs to be large, gene-rich chromosomes, which, together with their persistence over millennia, implies they play important biological roles within this clade. However, transcription from these chromosomes has yet to be demonstrated, leaving key questions
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.