Radiation therapy for abdominopelvic malignancies often results in damage to the gastrointestinal tract (GIT) and permanent changes in bowel function. An overlooked component of the pathophysiology of radiation-induced bowel injury is the role of the gut microbiome. The goal of this research was to identify the impacts of acute radiation exposure on the GIT and gut microbiome. C57BL/6 mice exposed to whole-body X-rays (0.1-3 Gy) were assessed for histological and microbiome changes 48 h post-radiation exposure. Within the ileum, a dose of 3 Gy significantly decreased crypt depth as well as the
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The human microbiome is the collection of microorganisms in the body that exist in a mutualistic relationship with the host. Recent studies indicate that perturbations in the microbiome may be implicated in a number of diseases, including cancer. More specifically, changes in the gut and vaginal microbiomes may be associated with a variety of gynecologic cancers, including cervical cancer, uterine cancer, and ovarian cancer. Current research and gaps in knowledge regarding the association between the gut and vaginal microbiomes and the development, progression, and treatment of gynecologic can
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Migraine is a disabling neurological disorder that often begins in childhood or adolescence and is frequently accompanied by gastrointestinal (GI) symptoms. However, the microbiota signatures and gut-brain interactions underlying pediatric migraine, particularly in the presence of GI disorder, remain poorly defined. This study aimed to explore the clinical and microbial features of pediatric migraine, as well as the therapeutic potential of probiotics.We prospectively enrolled 126 pediatric migraine patients (ages 6-19) with or without GI disorder and 50 age-matched healthy controls. Fecal mic
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The gastrointestinal (GI) tract harbors trillions of microorganisms known to influence human health and disease, and next-generation sequencing (NGS) now enables the in-depth analysis of their diversity and functions. Although a significant amount of research has been conducted on the GI microbiome, comprehensive metagenomic datasets covering the entire tract are scarce due to cost and technical challenges. Despite the widespread use of fecal samples, integrated datasets encompassing the entire digestive process, beginning at the mouth and ending with feces, are lacking. With this study, we ai
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Despite successful ART in people living with HIV infection (PLHIV) they experience increased morbidity and mortality compared with HIV-negative controls. A dominant paradigm is that gut-associated lymphatic tissue (GALT) destruction at the time of primary HIV infection leads to loss of gut integrity, pathological microbial translocation across the compromised gastrointestinal barrier and, consequently, systemic inflammation. We aimed to identify and measure specific changes in the gastrointestinal barrier that might allow bacterial translocation, and their persistence despite initi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Microbes within the gastrointestinal tract communicate with each other and with the host, which has profound effects on health and disease development. Only now, it is becoming apparent that how and when we acquire our own unique collection of "gut microbes" and also how we choose to maintain them is fundamental to our health. Helicobacter pylori is the most common bacterial infection worldwide, colonizing around half of the world's population, and is the major risk factor for gastric adenocarcinoma. More recently, it has also been shown to have some beneficial effects in terms of protecting a
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The gastrointestinal tract operates as a highly integrated, multi-layer signaling ecosystem in which microbial communities, metabolite flux, epithelial receptors, immune circuits, and neuroendocrine pathways form a coordinated regulatory network rather than isolated biological compartments. The Microbiome-Metabolite Signaling Network (MMSN) framework conceptualizes gastrointestinal homeostasis and disease as emergent properties of dynamic cross-layer interactions. This review explores the framework principally on inflammatory bowel disease and irritable bowel syndrome as representative gastroi
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sepsis, characterized by life-threatening organ dysfunction resulting from an uncontrolled response to infection, can impact various systems of the body, including the digestive system. Prior research has identified sepsis as a significant risk factor for gastrointestinal bleeding. However, there is limited reporting on the gastric microecology of individuals with sepsis complicated by gastrointestinal bleeding. This paper presents the cases of two patients, shedding light on this issue. The first case was a 29-year-old female who developed sepsis during perioperative liver transplantation, wh
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The disease profile in the Indian population provides a unique opportunity for studying the host microbiome interaction in both infectious (amebiasis) and autoimmune diseases like inflammatory bowel disease (IBD) from a similar environment and genetic background. Analysis of fecal samples from untreated amebic liver abscess (ALA) patients, Entamoeba histolytica (Eh)-negative and -positive asymptomatic individuals, and pus samples from naive ALA patients revealed a significant reduction in Lactobacillus in asymptomatic individuals (Eh +ve) and ALA patients. Two anaerobic genera, namely Bacteroi
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Environmental NH3 is a major pollutant in intensive livestock production, but its effects on host-associated microbiota remain insufficiently characterized. This systematic review evaluated the impact of environmental NH3 exposure on the respiratory and gastrointestinal microbiome of poultry, swine, and cattle. Following PRISMA 2020 guidelines, PubMed, Web of Science, and Scopus were searched, identifying 175 records. After duplicate removal and screening, eight studies were included: five in broiler chickens and three in pigs, while no eligible bovine studies were identified. NH3 exposure was
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Mobile genetic elements (MGEs) drive horizontal gene transfer and microbial evolution, spreading adaptive genes across microbial communities. While extensively studied in other ecosystems, the role of MGEs in shaping ruminant gastrointestinal microbiomes-especially their impact on diversity, adaptation, and dietary responsiveness-remains largely unexplored. This study systematically profiles MGE distribution and functionality across gastrointestinal regions in multiple ruminant species to advance our understanding of microbial adaptation.
RESULTS: Across 2458 metagenomic samples f
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND & AIMS: Nonalcoholic fatty liver disease affects up to 30% of the US population, but the mechanisms underlying this condition are incompletely understood. We investigated how diet standardization and choline deficiency influence the composition of the microbial community in the human gastrointestinal tract and the development of fatty liver under conditions of choline deficiency.
METHODS: We performed a 2-month inpatient study of 15 female subjects who were placed on well-controlled diets in which choline levels were manipulated. We used 454-FLX pyrosequencing of 16S ribosomal RNA
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
There is considerable interest in the gastrointestinal (GI) microbiome and its interaction with disease processes, but existing reviews tend to assume ecological and microbiological knowledge that critical care clinicians may not have. In this review, we present an overview of the GI microbiome for the critical care clinician and highlight unanswered questions pertinent to the field. The human GI microbiome can now be mapped and its relationship with organ function interrogated. Multiomics approaches that integrate data from multiple sources, including the microbiome, epigenome, transcriptome,
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Syrian hamsters (Mesocricetus auratus) have been increasingly used as rodent models in recent years, especially for SARS-CoV-2 since the pandemic. However, the physiology of this animal model is not yet well-understood, even less when considering the digestive tract. Generally, the gastrointestinal microbiome influences the immune system, drug metabolism, and vaccination efficacy. However, a detailed understanding of the gastrointestinal microbiome of hamsters is missing. Therefore, we analyzed 10 healthy 11-week-old RjHan:AURA hamsters fed a pelleted standard diet. Their gastrointestinal cont
СтатьяСравнительное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Dairy cattle (Bos taurus), especially Holstein cows, which are the highest-producing dairy animals and are widely bred to provide milk products to humans, rely critically on their associated gastrointestinal tract (GIT) microbiota to digest plant feed. However, the region-specific taxonomic composition and function of the GIT microbiome in dairy cattle and the mechanistic basis for the diet-induced effects remain to be elucidated. RESULTS: We collected 120 digesta samples from 10 GIT regions of 12 Holstein cows fed forage- and grain-based diets and characterized their GIT microbio
Video-Audio MediaСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Arsenic exposure has been reported to alter the gut microbiome in mice. Activity of the gut microbiome derived from fecal microbiota has been found to affect arsenic bioaccessibility in an in vitro gastrointestinal (GI) model. Only a few studies have explored the relation between arsenic exposure and changes in the composition of the gut microbiome and in arsenic bioaccessibility. Here, we used simulated GI model system (GIMS) containing a stomach, small intestine, colon phases and microorganisms obtained from mouse feces (GIMS-F) and cecal contents (GIMS-C) to assess whether exposure to arsen
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bacteroides fragilis is an obligately anaerobic Gram-negative bacterium and a major colonizer of the human large colon where Bacteroides is a predominant genus. During the growth of an individual clonal population, an astonishing number of reversible DNA inversion events occur, driving within-strain diversity. Additionally, the B. fragilis pan-genome contains a large pool of diverse polysaccharide biosynthesis loci, DNA restriction/modification systems and polysaccharide utilization loci, which generates remarkable between-strain diversity. Diversity clearly contributes to the success of B. fr
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Host-microbe interactions within the gastrointestinal tract (GIT) play a pivotal role in shaping host physiology, ecology, and life history. However, these interactions vary across gut regions due to changes in the physical environment or host immune system activity, thereby altering the microbial community. Each animal species may harbor their own unique microbial community due to host species-specific ecological traits such as dietary habits, micro-habitat preferences, and mating behavior as well as physiological traits. While the gut microbiota in wild animals has received much attention ov
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Clostridium difficile (C. difficile) infection (CDI) poses a tremendous clinical challenge, especially in patients with recurrent disease and antibiotic resistance. Fecal microbiota transplantation (FMT) has become a new therapeutic strategy for restoring gut microbiota and decreasing CDI recurrence. The study aims to assess the clinical effectiveness of FMT in adult subjects with recurrent or refractory CDI, determine its effect on gut microbiome diversity, and track safety outcomes and rates of recurrence post-treatment. FMT was compared against standard antibiotic treatments to establ
СтатьяОтозванная публикацияПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Regional variation in the human gastrointestinal microbiome remains difficult to characterize because existing sampling methods either rely on invasive endoscopy or stool, which poorly reflects the upper gut. We evaluated a minimally invasive capsule-string device capable of collecting luminal and mucosal material from the esophagus, stomach, duodenum, and jejunum during natural transit. In healthy adults, compartment-level samples were anatomically localized using pH, bile staining, and string length, and microbial communities were profiled by 16S rRNA gene sequencing. The device was well tol
СтатьяОценочное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.