Nodule organogenesis is a complex developmental process which is induced post-embryonically following rhizobia infection and relies on coordinated action of a suite of transcription factors at multiple stages starting from its initiation, de novo meristem establishment and differentiation. The rewiring of nitrate-responsive NIN-LIKE PROTEIN (NLP) homolog, NODULE INCEPTION (NIN) transcription factor through genetic adaptations in the common ancestor of the nitrogen-fixing clade is crucial to the origin of nodulation trait. Moreover, nodule formation emerged through the co-option of evolutionary
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Promoter recognition by the RNA polymerase (RNAP) holoenzyme is a key step in gene regulation. In Chlamydia trachomatis, a medically important obligate intracellular bacterium, σ66 allows the RNAP to initiate promoter-specific transcription throughout the chlamydial developmental cycle. Here, we investigated the intrinsic properties of σ66-specific promoters with emphasis on their role in the developmental gene expression of C. trachomatis. First, we examined whether promoters that contain a 5'-T(-15)G(-14)-3' (TG) motif upstream from the -10 element appear more often than others in genes that
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The organization and renewal capacity of teeth vary greatly among vertebrates. Mammals have only one row of teeth that are renewed at most once, whereas many nonmammalian species have multirowed dentitions and show remarkable capacity to replace their teeth throughout life. Although knowledge on the genetic basis of tooth morphogenesis has increased exponentially over the past 20 years, little is known about the molecular mechanisms controlling sequential initiation of multiple tooth rows or restricting tooth development to one row in mammals. Mouse genetics has revealed a pivotal role for the
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Antigen-stimulated B lymphocytes undergo genetic and phenotypic changes in germinal centers (GCs), including affinity maturation of immunoglobulin (Ig) genes and Ig heavy chain isotype switching. Expression of the Germinal Center Expressed Transcript (GCET) gene is up-regulated in murine GC B cells. The human homolog of GCET, HGAL/GCET2, is an important prognostic marker for staging lymphomas derived from GCs. To identify mechanisms that control cell type-specific transcription of GCET, we localized promoter sequences using S1 nuclease protection and functional assays. Sequences comprising a T
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Puromycin-insensitive leucyl-specific aminopeptidase (PILSAP) was expressed in endothelial cells (ECs) and played an important role in angiogenesis. Here, we characterized its transcriptional regulation. Mouse PILSAP gene contained 19 exons and located in the chromosome 13C1-C2. We identified two transcripts; one transcribed from exon 1 and the other from exon 2. Mouse ECs expressed dominantly the one from exon 1. The promoter analysis using 5' upstream region of exon 1 revealed that -1868 to -1812 was critical for its transcription in mouse ECs. We identified a motif of the transcription fact
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Adeno-associated virus (AAV) has long been known to inhibit helper adenovirus (Ad) replication independently of AAV Rep protein expression. More recently, replication of Ad serotype 5 (Ad5)/AAV serotype 2 (AAV-2) hybrid vectors was shown to be inhibited incisby a sequence near the 3' end of AAVrep, termed the Rep inhibition sequence for adenoviral replication (RIS-Ad). RIS-Ad functions independently of Rep protein expression. Here we demonstrate that inhibition of adenoviral replication by RIS-Ad requires an active AAV p40 promoter and the 5' half of the intron. In addition, Ad inh
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Open reading frame 11 (ORF11) of Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus belongs to a herpesviral homologous protein family that is conserved among members of the gamma-herpesvirus subfamily. Little is known about the function of ORF11 and how this viral gene is regulated in KSHV life cycle. In this study, we have characterized the major transcript of the ORF11 gene, which is located adjacent and in the opposite orientation to a well-characterized viral IL-6 gene. Northern blot analysis revealed that the ORF11 gene is lytic viral gene with delayed-early expression kinetics. We have determined
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background/Objectives: Promoter DNA methylation is conventionally summarised as a regional mean. Two alternatives have been proposed to capture information the mean discards: the concurrence ratio derived from partially methylated bisulfite reads (CAMDA) and single-CpG Shannon (β-) entropy. Benchmarks of such metrics typically report one coefficient per metric on a single gene set at a single aggregation scale. We asked how far that comparison depends on analytical choices that are rarely reported. Methods: Matched whole-genome bisulfite sequencing (WGBS) and RNA-seq from one donor of human CD
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The WHO has recently classified Neisseria gonorrhoeae as a super-bacterium due to the rapid spread of antibiotic resistant derivatives and an overall dramatic increase in infection incidences. Genome sequencing has identified potential genes, however, little is known about the transcriptional organization and the presence of non-coding RNAs in gonococci. We performed RNA sequencing to define the transcriptome and the transcriptional start sites of all gonococcal genes and operons. Numerous new transcripts including 253 potentially non-coding RNAs transcribed from intergenic regions or antisens
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alternative transcription initiation, which refers to the transcription of a gene from different transcription start sites (TSSs), is prevalent across metazoans and has important biological functions. Although transcriptional regulation has been extensively studied, the mechanism that selects one TSS over others within a gene remains elusive. Using the Cap Analysis of Gene Expression sequencing (CAGE-seq) method, we discovered that Piwi, an RNA-binding protein, regulates TSS usage in at least 87 genes. In piwi-deficient Drosophila ovaries, these genes displayed significantly altered TSS usage
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Eukaryotic core promoters are often characterized by the presence of consensus motifs such as the TATA box or initiator elements, which attract and direct the transcriptional machinery to the transcription start site. However, many human promoters have none of the known core promoter motifs, suggesting that undiscovered promoter motifs exist in the genome. We previously identified a mutation in the human Ankyrin-1 (ANK-1) promoter that causes the disease ankyrin-deficient Hereditary Spherocytosis (HS). Although the ANK-1 promoter is CpG rich, no discernable basal promoter elements had been ide
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаResearch Support, N.I.H., IntramuralПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The general transcription factor IIE (TFIIE) is essential for transcription initiation by RNA polymerase II (RNA pol II) via direct interaction with the basal transcription/DNA repair factor IIH (TFIIH). TFIIH harbors mutations in two rare genetic disorders, the cancer-prone xeroderma pigmentosum (XP) and the cancer-free, multisystem developmental disorder trichothiodystrophy (TTD). The phenotypic complexity resulting from mutations affecting TFIIH has been attributed to the nucleotide excision repair (NER) defect as well as to impaired transcription. Here, we report two unrelated children sho
СтатьяResearch Support, N.I.H., IntramuralПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The B169L protein (pB169L) of African swine fever virus (ASFV) is a structural protein with an unidentified function during the virus replication. The sequences of the B169L gene and the downstream B438L gene are separated by short intergenic regions. However, the regulatory mode of the gene transcription remains unknown. Here, we identified two distinct promoter regions and two transcription start sites (TSSs) located upstream of the open reading frame (ORF) of B438L. Using the promoter reporter system, we demonstrated that the cis activity of the ORF proximal promoter exhibited significantly
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The SRY-HMG-Box transcription factor SOX10 plays a critical role in neural crest development, but its function in epithelial tumorigenesis remains unclear. Here, we identify SOX10 as a key regulator of tumor-initiating activity in Neu-driven mammary cancers. Genetic ablation of Sox10 in the luminal compartment of MMTV-Neu (NIC) mice resulted in delayed but normal mammary gland development. Sox10 deletion resulted in a reduction in mammary progenitors and a complete loss of tumor initiation in Sox10-deficient luminal cells. CRISPR/Cas9-mediated Sox10 inactivation in Neu-transformed tumor cells
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We previously hypothesized that a 2 nucleotide deletion, causing a A-greater than C change at position -3 preceding the ATG initiation codon of alpha globin gene, reduced translation efficiency of alpha globin mRNA and was responsible for a form of alpha + thalassemia displayed by an Algerian patient. We presently show that this deletion leads to a 30-45% reduction in translation efficiency of synthetic alpha globin mRNA in rabbit reticulocyte lysate. In other experiments, we constructed alpha/G gamma hybrid globin genes in which the 3' end of normal or mutated alpha globin genes downstream to
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mutations in the gene MID1 are responsible for the X-linked form of Opitz syndrome, a genetic disorder that primarily affects the development of midline structures. Several mRNA isoforms with variant 5' ends have been reported for MID1, suggesting the presence of alternative transcription initiation sites. However, the genomic organization and expression pattern of the heterogeneous MID1 5'-untranslated regions (UTRs), as well as the promoter regions regulating their transcription, have not been determined. We now report the characterization of alternative MID1 first exons and their associated
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The remodeling of chromatin in the nucleolus is important for the control of ribosomal DNA (rDNA) transcription and ribosome biogenesis. Herein, we found that upstream binding factor (UBF) interacts with ESET, a histone H3K9 methyltransferase and is trimethylated at Lys (K) 232/254 by ESET. UBF trimethylation leads to nucleolar chromatin condensation and decreased rDNA transcriptional activity. UBF mutations at K232/254A and K232/254R restored rDNA transcriptional activity in response to ESET. Both ESET-ΔSET mutant and knockdown of ESET by short hairpin RNA reduced trimethylation of UBF and re
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hailey-Hailey disease (HHD) is a blistering skin disease caused by malfunction of the Ca2+-dependent ATPase, ATP2C1. In this study, key regulatory regions necessary for the expression of the gene encoding human ATP2C1 were investigated. The transient reporter assay demonstrated that region +21/+57 was necessary for activation of the ATP2C1 promoter, and the electrophoretic mobility shift assay demonstrated that the region was recognized by the transcription factors, Sp1 and YY1. In accordance with this result, when Sp1 or YY1 was overexpressed in keratinocytes, an obvious increase in ATP2C1 pr
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Colon cancers arise from benign neoplasms and evolve into adenocarcinomas through a stepwise histological progression sequence, proceeding from either adenomas or hyperplastic polyps/serrated adenomas. Genetic alterations have been associated with specific steps in this polyp-adenocarcinoma sequence and are believed to drive the histological progression of colon cancer. Recently, epigenetic alterations, which include CGI (CpG island) DNA methylation, have been shown to occur in colon polyps and colon cancer. The aberrant methylation of genes appears to co-operate with the genetic alterations t
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Enterotoxigenic Escherichia coli (ETEC) is a major cause of infant and child mortality in developing countries. This enteric pathogen causes profuse watery diarrhea by elaborating one or more enterotoxins that intoxicate eukaryotic cells and ultimately leads to a loss of water to the intestinal lumen. Virulence is also dependent upon fimbrial adhesins that facilitate colonization of the small intestine.
RESULTS: The expression of CS1 fimbriae is positively regulated by Rns, a member of the AraC/XylS superfamily of transcriptional regulators. Based on fimbrial protein homology, CS1
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования