The staphylococcal accessory regulator (encoded by sarA) is an important global regulator of virulence factor biosynthesis in Staphylococcus aureus. To further characterize its role in virulence determinant production, an sarA knockout mutant was created by insertion of a kanamycin antibiotic resistance cassette into the sarA gene. N-terminal sequencing of exoproteins down-regulated by sarA identified several putative proteases, including a V8 serine protease and a novel metalloprotease, as the major extracellular proteins repressed by sarA. In kinetic studies, the sarA mutation delays the ons
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND OBJECTIVES: Systemic lupus erythematosus (SLE) is distinguished by dysregulated immune system activity, resulting in a spectrum of clinical manifestations, with lupus nephritis being particularly prominent. This study endeavors to discern novel targets as potential therapeutic markers for this condition.
METHODS: Weighted correlation network analysis (WGCNA) was used to construct the network and select the key hub genes in the co-expression module based on the gene expression dataset GSE81622. Subsequently, functional enrichment and pathway analysis were performed for SLE and l
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Cancer Genome Atlas (TCGA) sequencing analysis of head and neck squamous cell carcinoma (HNSCC) recently reported on gene fusions, however, few human papillomavirus (HPV) positive samples were included, and the functional relevance of identified fusions was not explored. We therefore performed an independent analysis of gene fusions in HPV-positive oropharyngeal SCC (OPSCC). RNA sequencing was performed on 47 HPV-positive OPSCC primary tumors and 25 normal mucosal samples from cancer unaffected controls on an Illumina TruSeq platform. MapSplice2 was used for alignment and identification of
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The mammalian circadian system controls various physiology processes and behavior responses by regulating thousands of circadian genes with rhythmic expressions. In this study, we redefined circadian-regulated genes based on published results in the mouse liver and compared them with other gene groups defined relative to circadian regulations, especially the non-circadian-regulated genes expressed in liver at multiple molecular levels from gene position to protein expression based on integrative analyses of different datasets from the literature. Based on the intra-tissue analysis, the liver c
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Description of robust transcriptomic alterations in Huntington's disease is essential to identify targets for biochemical studies and drug development. We analysed publicly available transcriptome data from the brain and blood of 220 HD patients and 241 healthy controls and identified 737 and 661 genes with robustly altered mRNA levels in the brain and blood of HD patients, respectively. In the brain, a subnetwork of 320 genes strongly correlated with HD and was enriched in transport-related genes. Bioinformatical analysis of this subnetwork highlighted CDC42, PAK1, YWHAH, NFY, DLX1, HMGN3, an
СтатьяМетаанализПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Homeobox genes encode sequence-specific transcription factors (SSTFs) that recognize specific DNA sequences and regulate organogenesis in all eukaryotes. They are essential in specifying spatial and temporal cell identity and as a result, their mutations often cause severe developmental defects. Pitx genes belong to the PRD class of the highly evolutionary conserved homeobox genes in all animals. Vertebrates possess three Pitx paralogs, Pitx1, Pitx2, and Pitx3 while non-vertebrates have only one Pitx gene. The ancient role of regulating left-right (LR) asymmetry is conserved while new function
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Legionella pneumophila, the causative agent of Legionnaires' disease, actively manipulates intracellular processes to establish a replication niche inside their host cells. The establishment of its replication niche requires a functional Icm/Dot type IV secretion system which translocates about 300 effector proteins into the host cells during infection. This enormous number of effectors should be coordinated at the level of gene expression, in order to be expressed and translocated at the correct time and appropriate amounts. One of the predominant ways in bacteria to regulate virulence gene e
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sonic hedgehog (Shh) signaling regulates both digit number and identity, but how different distinct digit types (identities) are specified remains unclear. Shh regulates digit formation largely by preventing cleavage of the Gli3 transcription factor to a repressor form that shuts off expression of Shh target genes. The functionally redundant 5'Hoxd genes regulate digit pattern downstream of Shh and Gli3, through as yet unknown targets. Enforced expression of any of several 5'Hoxd genes causes polydactyly of different distinct digit types with posterior transformations in a Gli3(+) background,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
TAL1/SCL is one of the most prevalent oncogenes in T-cell acute lymphoblastic leukemia (T-ALL). TAL1 and its regulatory partners (GATA3, RUNX1, and MYB) positively regulate each other and coordinately regulate the expression of their downstream target genes in T-ALL cells. However, long non-coding RNAs (lncRNAs) regulated by these factors are largely unknown. Here we established a bioinformatics pipeline and analyzed RNA-seq datasets with deep coverage to identify lncRNAs regulated by TAL1 in T-ALL cells. Our analysis predicted 57 putative lncRNAs that are activated by TAL1. Many of these tran
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
miR319-targeted LsTCP4 negatively regulates de novo shoot regeneration, suggesting a role for the miR319-LsTCP4 module in lettuce regenerative competence. Plant regeneration is a major determinant of transformation and genome-editing efficiency, yet the endogenous regulatory networks controlling regenerative competence in horticultural crops remain incompletely understood. The miR319-TCP module regulates multiple developmental processes in plants, but its function in lettuce regeneration has not been defined. Here, we performed a genome-wide analysis of the TEOSINTE BRANCHED1/CYCLOIDEA/PROLIFE
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Seasonal allergic rhinitis (SAR) imposes substantial morbidity, and intralymphatic immunotherapy (ILIT) offers a targeted approach for allergen delivery. However, short-term efficacy and associated biomarkers remain insufficiently characterized.
METHODS: Eight SAR patients received ultrasound-guided ILIT with 100 SQ-U allergen extracts injected into cervical lymph nodes. Assessments were performed at baseline, 1 month, and 2 months post-treatment, alongside eight age- and gender-matched healthy controls. Symptom severity was evaluated using Visual Analog Scale (VAS) and Combined S
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Sleep, a core circadian rhythm, maintains physiological homeostasis. Its dysfunction links to neuropsychiatric disorders. Clinically, poor sleep impairs positive emotions and enhances negative emotion susceptibility, but the mechanism remains unclear, potentially involving circadian clock genes and neuroinflammatory pathways.
METHODS: Divide the male C57BL/6J mice into the following five groups: Non-sleep deprivation (SD) control (CON), sleep recovery 14-day after SD 7-day (SD7R14), sleep recovery 21-day after SD 7-day (SD7R21), sleep recovery 14-day after SD 14-day (SD14R14), and
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Neonatal jaundice and early growth patterns are important indicators of early health, and genetic as well as clinical factors are known to influence these traits. However, evidence from East Asian newborns is still limited.
RESULTS: This study presents a genome-wide association study (GWAS) investigating genetic determinants of Healthy Newborn Growth Indicators (HNGI), with a focus on neonatal jaundice (JAU), jaundice resolution (JAUR), birth weight (BW), and growth metrics (weight, height, BMI) measured within 90-105 days after birth. Our analysis identified 778 single-nucleotide
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND & AIMS: Tuft cells play protective roles in infection, inflammation, and tumorigenesis through the secretion of cytokines and eicosanoids. Tuft cells are known for their tall, blunt microvilli, thought to be analogous to mechanosensory hair cell stereocilia; however, a functional role for the microvillar apparatus has not been identified. POU Class 2 Homeobox 3 (POU2F3) is the master regulator transcription factor for tuft cells, yet how POU2F3 drives formation of this unique structure is unknown. Here, we aimed to identify POU2F3 target genes and commonalities between tuft and hair
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАResearch Support, N.I.H., IntramuralПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Cervical cancer (CC) immunotherapy resistance remains a critical clinical challenge. Although immune checkpoint blockade shows efficacy in subsets of patients, the epigenetic and post-transcriptional mechanisms driving resistance are poorly understood. Insulin-like growth factor 2 mRNA-binding protein 1 (IGF2BP1), an m6A "reader," is implicated in tumor progression, but its role in CC immunotherapy resistance is undefined. The aim of this study was to elucidate the function of epigenetic regulator IGF2BP1 and HDAC2 in CC acquired immunotherapy resistance.
METHODS: Multi-omics anal
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hepatocellular carcinoma (HCC) is a common malignancy characterised by molecular heterogeneity and poor prognosis. The purpose of this study was to determine differences in the expression of Cystic Fibrosis Transmembrane Conductance Regulator (CFTR), Fatty Acid Synthase (FASN), FKBP12-rapamycin-associated protein (FRAP; mTOR), and B-cell scaffold protein with ankyrin repeats 1 (BANK1) between HCC patients and controls. A total of 200 blood samples (100 from HCC patients and 100 from controls) were analysed using Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction (RT-PCR), with Glyceraldehyde-3-ph
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To investigate the function of HOXA11-antisense long non-coding RNA (HOXA11-AS) in endometriosis treatment response.
METHODS: Tissue samples (ectopic and eutopic endometrium) were obtained from surgically diagnosed subjects with endometriosis (n = 15) and controls (n = 11) without endometriosis after treatment with a progestin. RNA was extracted from these tissues; cDNA was prepared and lncRNA HOXA11-AS levels were measured by quantitative real-time polymerase chain reaction (RT-qPCR). Immortalized endometrial stromal cells from an endometriosis patient (ENDO cell line) were cultur
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Equine endometrosis is a chronic degenerative condition of the endometrium. A hallmark feature of endometrosis is endometrial fibrosis accompanied by degenerative changes in the adjacent tissue structure. Tumor necrosis factor α (TNFα), a pleiotropic cytokine produced by various immune cells, plays a dual role in coordinating immune responses and regulating cell/tissue homeostasis, making it an important regulator of fibrotic-related disorders. However, the exact role of TNFα in the development of equine endometrial fibrosis remains to be discovered and explained. Therefore, the main aim of th
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The emergence of vancomycin-intermediate Staphylococcus aureus (VISA) has significantly challenged the treatment of S. aureus infection. Toxin-antitoxin (TA) systems have been reported to mediate bacterial stress adaptation and virulence, but their role in vancomycin resistance remains elusive. This study investigated the vancomycin resistance mechanism regulated by the TA system SavRS in VISA.
METHODS: savRS mutants in Mu50 and XN108 were generated via homologous recombination. To investigate the regulatory mechanism of vancomycin resistance mediated by savRS in VISA, phenotypic
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND AIM: The transcription factor MafF is a novel regulator of adipogenesis, but its role in hepatic steatosis remains unclear. This study aimed to explore the impact of MafF on hepatocyte steatosis and its underlying mechanisms.
MATERIALS AND METHODS: A stable MafF-overexpressing cell line was established using lentiviral infection. RT-qPCR and Western blot analysis confirmed MafF expression. Free fatty acid (FFA) or ethanol (ETOH) induction was used to simulate hepatocyte steatosis in non-alcoholic or alcoholic fatty liver disease (NAFLD or AFLD). Cell activity and lipid accumula
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.