Episignatures are popular tools for the diagnosis of rare neurodevelopmental disorders. They are commonly based on a set of differentially methylated CpGs used in combination with a support vector machine model. DNA methylation (DNAm) data often include missing values due to changes in data generation technology and batch effects. While many normalization methods exist for DNAm data, their impact on episignature performance have never been assessed. In addition, technologies to quantify DNAm evolve quickly and this may lead to poor transposition of existing episignatures generated on deprecate
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: To reveal the complex etiology of gastroschisis through two independent cases.
CASES: Case 1 involves gastroschisis recurrence in a consanguineous marriage, and Case 2 concerns a fetus with gastroschisis whose mother had undergone gastroplasty. Methylation array was carried out in both cases (two fetuses with gastroschisis, their two mothers, one father from the consanguineous marriage), and in 16 controls (fetuses and their respective mothers).
CONCLUSION: The two cases presented different noninherited methylation profiles.
Клинический случайПоддержка исследования: вне правительства СШАСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: This systematic review aimed to summarize evidence reporting epigenetic and/or neuro-immuno-endocrine embedding of adverse childhood events (ACEs) in children, with a particular focus on the short-term biological effect of those experiences. Methods: A search was conducted in PsycINFO®, PubMed®, Isi Web of Knowledge and Scopus, until July 2019, to identify papers reporting the short-term biological effects of exposure to ACEs. Results: The search identified 58 studies, that were included in the review. Regarding exposure, the type of ACE more frequently reported was sexual abuse (n
Поддержка исследования: вне правительства СШАСистематический обзорСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Accumulating evidence suggests that epigenetic mechanisms may hold great potential in the field of pain. We systematically reviewed the literature exploring epigenetic mechanisms in people with pain. Four databases have been interrogated: MEDLINE, The Cochrane Central Register of Controlled Trial, Scopus, and Web of Science, following PRISMA guidelines in conducting study selection and assessment. Thirty-seven studies were included. Studies explored epigenetics in conditions such as fibromyalgia, CRPS, neuropathies, or osteoarthritis. Research focussed on genome-wide and gene-specific DNA meth
СтатьяСистематический обзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The 45th Annual Meeting of the American Society of Hematology was held December 6-9, 2003, at the San Diego Convention Center in California. As with past meetings, there were exciting new developments, comprehensive educational programs, and phenomenal exhibits. There was also an ever increasing ASCLS presence at the meeting, as more hematology/hemostasis educators and researchers are finding their way to this very excellent scientific meeting. A group of us who attended the meeting would like to share with our colleagues who were unable to attend some of the new information in select areas, c
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Methyl-dependent restriction endonucleases are promising tools for analyzing eukaryotic DNA methylation patterns. However, quantitative assessment of their substrate specificity requires the determination of the kinetic parameters of enzymatic reactions. Here, we present a method for determining initial reaction rates based on fluorescent probes and real-time monitoring of changes in fluorescence intensity. Initial rates of methyl-dependent GlaI and BlsI restriction endonucleases were determined as the slope of the linear part of the kinetic curves, after which the Michaelis-Menten constants (
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Methyl donor micronutrients might affect muscle strength via DNA methylation. We aimed to evaluate the combined relationship of dietary methyl donor micronutrients containing betaine, choline, methionine, vitamin B12, vitamin B6 and folate on muscle strength. This cross-sectional study was conducted on 267 subjects including 113 men and 154 women. Dietary intake of micronutrients was assessed utilising a validated 168-item semi-quantitative FFQ, and methyl donor micronutrient score (MDMS) was calculated. The muscle strength of the participants was measured using a digital handgrip dynamometer.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND OBJECTIVE: Hepatopancreatobiliary (HPB) cancers, including pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC), hepatocellular carcinoma (HCC), and cholangiocarcinoma (CCA), are among the deadliest malignancies due to late-stage diagnosis and limited curative options. Conventional tissue biopsies are often invasive and insufficient for longitudinal monitoring. This review synthesizes the current available literature on liquid biopsy, a minimally invasive approach that uses analysis of circulating tumor DNA (ctDNA) and cell-free DNA (cfDNA) in serum, plasma, or bile, to enable better early d
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Preterm birth (PTB), a leading cause of neonatal morbidity and mortality, arises from complex maternal-fetal interactions with multifactorial origins. Emerging evidence suggests that epigenetic dysregulation may mediate these interactions. This study aimed to identify DNA methylation changes associated with PTB to uncover potential biomarkers and underlying mechanisms.
METHODS: We employed long-read sequencing to profile genome-wide DNA methylation followed by gene ontology and pathway enrichment analysis in matched maternal peripheral blood and neonatal cord blood from 15 prete
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Meningiomas exhibit a complex biology that, despite notable successes in preclinical studies, contributes to the failures of pharmaceutical clinical trials. Animal models using patient tumor cells closely mimic in vivo conditions but are labor-intensive, costly, and unsuitable for high-throughput pharmaceutical testing. In comparison, monolayer cell models (two-dimensional, 2D) are cost-efficient but lack primary tumor cell-cell interactions, potentially overestimating treatment effects. Three-dimensional (3D) models offer an alternative through more precise mimicking of tumor morp
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) is a highly aggressive cancer type that urgently requires effective therapeutic strategies. Andrographolide, a labdane diterpenoid compound abundant in Andrographis paniculata, has anticancer effects against various cancer types, but its anticancer activity and mechanism against PDAC remain largely uncharacterized.
PURPOSE: This study explores novel drug target(s) and underlying molecular mechanism of andrographolide against PDAC.
STUDY DESIGN AND METHODS: The malignant phenotypes of PDAC cells, PANC-1 and MIA PaCa-2 cells, were measured us
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Psoriasis is a common inflammatory skin disease. Abnormal proliferation of keratinocytes is one of the psoriatic histopathological features. Indirubin has an essential effect on the proliferation and activation of keratinocytes; however, in psoriasis, the specific mechanism of action of indirubin on keratinocytes is unclear. In the present study, we revealed the effects of indirubin on DNA methyltransferase 1 (DNMT1), wnt inhibitory factor 1 (wif-1), and wnt/β-catenin signal pathway, in the meantime, we explored the effects of indirubin on proliferation, cell cycle and the apoptosi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The etiology and pathology osteonecrosis of the femoral head (ONFH) are not completely clarified. As a cytokine participating in systemic inflammation, tumor necrosis factor alpha (TNFα) has been shown to be involved in the pathogenesis of ONFH. However, the role of TNFα in ONFH is not clearly clarified. In the present study, we investigated the effects of TNFα on proliferation, angiogenesis, and osteogenic differentiation of rat bone mesenchymal stem cells (rMSCs) and the underlying mechanisms.
METHODS: All femoral bone tissues were separated in surgeries. After extracting total
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Severe acute malnutrition (SAM) in infants may present as one of two distinct syndromic forms: non-edematous (marasmus), with severe wasting and no nutritional edema; or edematous (kwashiorkor) with moderately severe wasting. These differences may be related to developmental changes prior to the exposure to SAM and phenotypic changes appear to persist into adulthood with differences between the two groups. We examined whether the different response to SAM and subsequent trajectories may be explained by developmentally-induced epigenetic differences.
METHODS: We extracted genomic D
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Studies were undertaken to examine the interaction of chloramphenicol and some of its analogs with DNA in an effort to elucidate the mechanism by which high levels of the drug cause inhibition of DNA synthesis. Chloramphenicol at concentrations of 1 mM and above was found to mediate the degradation of double-stranded DNA in the presence of copper and a reducing agent. Similarly, the L-threo steroisomer of chloramphenicol was equally potent at causing strand scissions in DNA. Nitroso-chloramphenicol, which inhibits DNA synthesis at much lower concentrations, also causes DNA damage at levels 100
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: DNA methylation in blood may reflect adverse exposures accumulated over the lifetime and could therefore provide potential improvements in the prediction of cancer risk. A substantial body of research has shown associations between epigenetic aging and risk of disease, including cancer. Here we aimed to study epigenetic measures of aging and lifestyle-related factors in association with risk of breast cancer.
METHODS: Using data from four prospective case-control studies nested in three cohorts of European ancestry participants, including a total of 1,655 breast cancer cases, we c
СтатьяМетаанализПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Hemihyperplasia and hemihypoplasia result in leg length discrepancy (LLD) by causing skeletal asymmetry. Beckwith-Wiedemann syndrome (BWS) and Silver-Russell syndrome (SRS) are opposite growth-affecting disorders caused by opposite epigenetic alterations at the same chromosomal locus, 11p15, to induce hemihyperplasia and hemihypoplasia, respectively. Because of their somatic mosaicism, BWS and SRS show a wide spectrum of clinical phenotypes. We evaluated the underlying epigenetic alterations and potential epigenotype-phenotype correlations, focusing on LLD, in a group of individual
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: This study sought to examine promoter methylation and expression of the identified sonic hedgehog (SHH) gene in terminal rectal tissues of children with congenital anorectal malformations (ARMs).
METHODS: Tissue samples from the terminal rectum of pediatric patients with ARMs (five cases each of high and intermediate malformation - two cases of rectovesical fistula, two cases of rectourethral prostatic fistula, one case of cloaca with >3cm common channel, four cases of rectourethral bulbar fistula and one case of imperforate anus without fistula, respectively, and ten cases of low
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nutriture in utero is essential for fetal brain development through the regulation of neural stem cell proliferation, differentiation, and apoptosis, and has a long-lasting impact on risk of disease in offspring. This review examines the role of maternal methyl donor micronutrients in neuronal development and programming of physiological functions of the hypothalamus, with a focus on later-life metabolic outcomes. Although evidence is mainly derived from preclinical studies, recent research shows that methyl donor micronutrients (e.g., folic acid and choline) are critical for neuronal developm
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MeCP2 is a protein that selectively binds to methylated cytosines through its methyl-CpG-binding domain (MBD) and connects DNA methylation to transcriptional repression. Mutations in MECP2 gene, located in Xq28, have been reported as being the major cause of Rett syndrome and are also associated with some cases of X-linked mental retardation in both males and females. In this study, we present the first screening in the MECP2 gene in a Brazilian cohort of 239 unrelated males with idiopathic mental retardation. Eight sequence variations were observed in 10 patients: one novel putative pathogeni
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования