BACKGROUND: The development of the brain requires precise coordination of molecular processes across many cell-types. Underpinning these events are gene expression programs which require intricate regulation by non-coding regulatory sequences known as enhancers. In the context of the developing brain, transcribed enhancers (TEs) regulate temporally-specific expression of genes critical for cell identity and differentiation. Transcription of non-coding RNAs at active enhancer sequences, known as enhancer RNAs (eRNAs), is tightly associated with enhancer activity and has been correlated with tar
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hox genes encode evolutionarily conserved transcription factors that specify regional identities along the anterior-posterior (A-P) axis. Although some Hox genes are known to regulate the differentiation of certain neurons, to what extent Hox genes are involved in the terminal specification of the entire nervous system is unclear. Here, we systematically mapped the expression of all six Hox genes in C. elegans nervous system and found Hox expression in 97 (32%) of the 302 neurons in adult hermaphrodites. Our results are generally consistent with previous high-throughput expression mapping and
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bacterial small non-coding RNA (sRNAs), together with the RNA chaperone Hfq, post-transcriptionally regulate gene expression by affecting ribosome binding or mRNA stability. In the human pathogen Bordetella pertussis, the causative agent of whooping cough, hundreds of sRNAs have been identified, but their roles in B. pertussis biology are mostly unknown. Here we characterize the Hfq-dependent sRNABpsA, whose level is dramatically higher in the virulence (Bvg+) mode. We show that transcription from a σA-dependent promoter yields a long form of 190 nucleotides (nt) that is processed by RNase E t
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gene regulatory networks encode the fundamental logic of cellular functions, but systematic network mapping remains challenging, especially in cell states relevant to human biology and disease. Here, we perturbed all expressed genes across 22 million primary human CD4+ T cells from four donors and developed a probe-based perturb-seq platform to measure the transcriptome effects in cells at rest and after stimulation. These data allowed us to map genes regulating immune pathways, including previously uncharacterized regulators of cytokine production. Importantly, active regulators and the gene
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
YY1 can activate or repress transcription of various genes. In cardiac myocytes in culture YY1 has been shown to regulate expression of several genes involved in myocyte pathology. YY1 can also acutely protect the heart against detrimental changes in gene expression. In this study we show that cardiac over-expression of YY1 induces pathologic cardiac hypertrophy in male mice, measured by changes in gene expression and lower ejection fraction/fractional shortening. In contrast, female animals are protected against pathologic gene expression changes and cardiac dysfunction. Furthermore, we show
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
*Plant growth and development ultimately depend on environmental variables such as the availability of essential minerals. Unravelling how nutrients affect gene expression will help to understand how they regulate plant growth. *This study reports the early transcriptomic response to magnesium (Mg) deprivation in Arabidopsis. Whole-genome transcriptome was studied in the roots and young mature leaves 4, 8 and 28 h after the removal of Mg from the nutrient solution. *The highest number of regulated genes was first observed in the roots. Contrary to other mineral deficiencies, Mg depletion did n
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cleft lip and cleft palate are common congenital craniofacial birth defects in humans. Phenytoin (PHT) is a risk factor of cleft palate formation; however, the molecular mechanisms by which phenytoin exerts its teratogenic effects resulting in cleft palate remain unknown. The Satb2 gene mutation is associated with cleft palate. Satb2-deficient mice exhibit cleft palate deformity and an up-regulation of Hoxa2 in the fronto-nasal region. In this study, phenytoin was administered intraperitoneally to pregnant C57BL/6 mice on the 10th day of gestation. Real-time PCR results showed that the express
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The effect of infection with Chlamydia pneumoniae on host messenger RNA expression in human monocytic cells with complement DNA microarrays was studied. The data chronicle a cascade of transcriptional events affecting 128 genes, many of which have not previously been reported to be affected by C. pneumoniae infection. Down-regulated genes are primarily associated with RNA and DNA metabolism, chromosomal stability, and cell-cycle regulation. Up-regulated messages include those for a variety of genes with important proinflammatory functions. Many of the up-regulated genes-including the hyaluron
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In order to identify genes differentially expressed by putrescine, a polyamine, which play important roles in the regulation of cell proliferation and the development of cancer, we performed mRNA differential display analysis using total RNA extracted from HepG2 cells (human hepatoblastoma cell line) treated with a specific inhibitor of polyamine biosynthesis, alpha-difluorometylornithine (DFMO). A total of 25 genes were up-regulated and 32 genes down-regulated by putrescine. Of the genes differentially expressed by putrescine, we chose three that were related to the respiratory chain and oxid
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Insect juvenile hormone (JH) and its regulation are crucial for their reproduction. Diaphorina citri Kuwayama is a major pest in the citrus industry. However, it remains unclear how the JH synthase-encoding gene (DcJHAMT) and the degradation enzyme-encoding gene (DcJHEH) are involved in regulating JH levels, vitellogenin synthesis and ovarian development.
RESULTS: This study employed RNA interference (RNAi) to silence DcJHAMT and DcJHEH in female D. citri. After DcJHAMT was silenced, the JH concentration decreased, the expression levels of key vitellogenin genes (Vg and VgR) decre
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The flgM gene of Salmonella typhimurium encodes a negative regulator of flagellin synthesis that acts by inhibiting the flagellum-specific sigma factor FliA (sigma 28), but only when a mutation in a flagellar basal body, hook, or switch gene is present. We previously showed that FlgM is also necessary for the virulence of S. typhimurium in the mouse model of typhoid fever and proposed that FlgM is required to modulate the activity of the FliA sigma factor, which, in turn, regulates a gene involved in virulence. In this investigation, we observed that (i) the in vitro generation times of flgM m
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Psoriasis is an autoimmune/inflammatory disorder primarily affecting the skin. Chronic joint inflammation triggers the diagnosis of psoriatic arthritis (PsA) in approximately one-third of psoriasis patients. Although joint disease typically follows the onset of skin psoriasis, in around 15% of cases it is the initial presentation, which can result in diagnostic delays. The pathophysiological mechanisms underlying psoriasis and PsA are not yet fully understood, but there is evidence pointing towards epigenetic dysregulation involving CD4+ and CD8+ T-cells.
OBJECTIVES: The aim of th
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cre1 is an important transcription factor that regulates carbon catabolite repression (CCR) and is widely conserved across fungi. The cre1 gene has been extensively studied in several Ascomycota species, whereas its role in gene expression regulation in the Basidiomycota species remains poorly understood. Here, we identified and investigated the role of cre1 in Coprinopsis cinerea, a basidiomycete model mushroom that can efficiently degrade lignocellulosic plant wastes. We used a rapid and efficient gene deletion approach based on PCR-amplified split-marker DNA cassettes together with in vitro
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spotted scat (Scatophagus argus) is a popular species of marine fish cultured in China. It shows normal sexual growth dimorphism. Female spotted scat grows quicker and bigger than males. Growth and reproduction are the most important traits in aquaculture. In vertebrates, the pituitary gland occupies an important position in the growth and reproduction axis. Estrogen is involved in regulating growth and reproduction in the pituitary gland in an endocrine fashion. Transcriptome sequencing of the pituitary was performed in female and male fish at 6 h after 17β-estradiol injection (4.0 μg E2/g bo
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Liver fibrosis is a progression of chronic liver disease with lacks effective therapies at present. Schisandrin B (Sch B), a bioactive compound extracted from the traditional Chinese medicine Schisandra chinensis, was reported to benefit liver diseases. This study aimed to investigate the therapeutic effects and molecular mechanisms of Sch B against CCl4-induced liver fibrosis in rats. RNA sequencing and transcriptome analysis were performed collaboratively, including analysis of differential gene expression, gene ontology (GO) analysis, pathway analysis and pathway-act-network analysis. The r
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
myc oncogenes are transcription factors regulating the level of expression of other genes. Using a subtraction/coexpression strategy, a murine genetic target for Myc regulation was isolated. To further characterize this target gene, named ECA39, we have recently isolated the human, nematode and budding yeast homologs of the mouse gene. The recognition site for Myc binding, located 3' to the start site of transcription in the mouse gene, is conserved in the human homolog. Transfection experiments demonstrated that the Myc binding site of the human gene, mediates activation of a reporter gene in
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Though intensive genetic selection has led to extraordinary advances in growth rate and feed efficiency in production of meat-type chickens, endocrine processes controlling these traits are still poorly understood. The anterior pituitary gland is a central component of the neuroendocrine system and plays a key role in regulating important physiological processes that directly impact broiler production efficiency, though how differences in pituitary gland function contribute to various growth and body composition phenotypes is not fully understood.
RESULTS: Global anterior pituitar
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genome-wide association meta-analysis (GWAMA) by the Cortisol Network (CORNET) consortium identified genetic variants spanning the SERPINA6/SERPINA1 locus on chromosome 14 associated with morning plasma cortisol, cardiovascular disease (CVD), and SERPINA6 mRNA expression encoding corticosteroid-binding globulin (CBG) in the liver. These and other findings indicate that higher plasma cortisol levels are causally associated with CVD; however, the mechanisms by which variations in CBG lead to CVD are undetermined. Using genomic and transcriptomic data from The Stockholm Tartu Atherosclerosis Reve
СтатьяМетаанализПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: The domestication of horses has played critical roles in human civilizations. The excavation of ancient horse DNA provides crucial data for studying horse domestication. Studies of horse domestication can shed light on the general mechanisms of animal domestication. Objective: We wish to explore the gene transcription regulation by long noncoding RNAs (lncRNAs) that influence horse domestication. Methods: First, we assembled the ancient DNA sequences of multiple horses at different times and the genomes of horses, donkeys, and Przewalski horses. Second, we extracted sequences of ln
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: The hedgehog (Hh) signaling pathway is one of the key regulators of gastrointestinal tract development. Recent studies point to the role of hedgehog signaling in regulating adult stem cells involved in maintenance and regeneration of intestinal stem cells. The purpose of this study was to evaluate the role of Hh signaling during intestinal adaptation in a rat model of short bowel syndrome (SBS).
METHODS: Male rats were divided into two groups: Sham rats underwent bowel transection and SBS rats underwent a 75 % bowel resection. Parameters of intestinal adaptation, enterocyte prolifera
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.