Group A streptococcus (GAS) is an important Gram-positive pathogen that causes various human diseases ranging from peripheral lesions to invasive infections. The M protein is one of the main virulence factors present on the cell surface and is associated with invasive GAS infections. Compared with other M types, serotype M3 has a predominant role in lethal infections and demonstrates epidemic behaviors, including streptococcal toxic shock syndrome, bacteremia, and necrotizing fasciitis. Traditional methods for M typing are time-consuming, tedious, contradictory, and generally restricted to ref
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aptamers are non-naturally occurring structured oligonucleotides that may bind to small molecules, peptides, and proteins. Typically, aptamers are generated by an in vitro selection process referred to as SELEX (systematic evolution of ligands by exponential enrichment). Aptamers that bind with high affinity and specificity to proteins that reside on the cell surface have potential utility as therapeutic antagonists, agonists, and diagnostic agents. When the target protein requires the presence of the cell membrane (e.g., G-protein-coupled receptors, ion channels) or a co-receptor to fold prop
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Twelve ssDNA aptamers specific for a novel recombinant anti-neuroexcitation peptide (ANEPIII) were identified using the SELEX method from a 79-nucleotide ssDNA pool to purify ANEPIII in a more efficient way. To further understand the binding modes between ssDNA and ANEPIII, fully flexible dinucleotides were docked onto the homology-modeled ANEPIII structure. AutoDocking identified favorable binding sites on ANEPIII for nucleotides, which was valuable for designing more potent ligands.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Selective drug delivery to podocytes remains a challenge. Aptamers, nucleic acids that bind specific cells, offer a potential solution, though podocyte-targeting aptamers have not yet been developed. Podocytes stimulated with adriamycin, puromycin aminonucleoside, and high glucose are used to screen an single-stranded DNA (ssDNA) library (10¹⁵ sequences). High-throughput sequencing identifies nucleotide sequences, and the aptamer's affinity, stability, cytotoxicity, uptake, biodistribution (especially to podocyte), target protein and ability to deliver siRNA are evaluated. After 11-14 rounds o
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Timely diagnosis of tuberculosis (TB) remains a critical challenge, highlighting the need for better screening tools. Traditional antibody-based detection methods for TB are often costly and cumbersome. To address this, we developed a streamlined centrifugal SELEX approach using a 69-nucleotide DNA library and the recombinant TB biomarker Ag85B, towards fabrication of an aptasensing platform offering a simpler and faster alternative.
RESULTS: Two high affinity DNA aptamers were screened through 12 rounds of SELEX and verified with in silico docking, circular dichroism spectroscopy
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Leptospirosis is a potentially life-threatening zoonosis caused by pathogenic Leptospira and for rapid diagnostics, direct detection is desirable. LipL32 protein is the most suitable biomarker for direct detection. DNA aptamers are sought to be generated against LipL32 by Systemic Evolution of Ligands via Exponential Enrichment (SELEX). LepDapt-5a is the most potent aptamer candidate among all the candidates, as determined by direct Enzyme-linked Aptasorbent Assay (ELASA). LepDapt-5a was predicted to form a G-quadruplex structure as predicted by QGRS Mapper and validated experimentally by dire
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tilapia Lake Virus (TiLV) is an emerging pathogen that poses a significant threat to global tilapia aquaculture, leading to substantial economic losses. The development of rapid, sensitive, and specific diagnostic methods is crucial for disease control and prevention. In this study, TiLV-infected tilapia brain cell line (TiB cells) was used as the target for screening specific aptamers via the Systematic Evolution of Ligands by Exponential Enrichment (SELEX) technique. The affinity, specificity, stability, cytotoxicity, and antiviral activity of the obtained aptamers were systematically analys
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Early diagnosis of acute diseases is fundamentally constrained by the lack of chemically tractable methods for biomarker discovery directly from a complex plasma. Here, we report PSABD (plasma-SELEX-enriched aptamer-based biomarker discovery and diagnosis), a chemical platform that integrates carboxylate magnetic-bead-mediated plasma protein capture within situ aptamer SELEX, enabling molecular-recognition-driven identification of disease-associated biomarkers. With this strategy, enriched aptamers not only serve as affinity probes but also function as structurally programmable molecular handl
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aptamers are synthetic single-stranded oligonucleotides that fold into defined three-dimensional structures, enabling high-affinity and highly selective target recognition, and are increasingly explored as alternatives to antibodies in diagnostics and therapeutics owing to advantages in production cost, reproducibility, thermal stability, and generation time. However, the conventional systematic evolution of ligands by exponential enrichment (SELEX)-an iterative in vitro selection process that screens large random nucleic-acid libraries for target-binding sequences-remains labor-intensive, tim
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this study, six candidate DNA aptamers specific to trichlorfon were successfully obtained through 16 rounds of capture-SELEX. Their binding affinities were rigorously evaluated and comparatively analyzed using three orthogonal techniques: quantitative real-time polymerase chain reaction (qPCR), gold nanoparticle-based colorimetric assay (AuNP assay), and SYBR Green I (SGI)-mediated fluorescence assay. Among these identified aptamers, APTri-7 exhibited the highest binding affinity, with a dissociation constant (Kd) of 0.597 ± 0.206 µg mL-1. Subsequently, using APTri-7, a highly sensitive ele
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gastric cancer (GC) is one of the leading causes of cancer-related mortality worldwide, with late-stage diagnosis and limited treatment efficacy. The major challenges in chemotherapy and radiotherapy for GC include drug resistance, systemic toxicity, limited tumor selectivity, adverse side effects, tumor heterogeneity, and the development of radioresistance, all of which hinder treatment efficacy and patient outcomes. Aptamers, single-stranded DNA or RNA molecules with high specificity and affinity for molecular targets, offer a promising alternative to traditional diagnostic and therapeutic a
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aptamers are nucleic acid-based ligands that can selectively bind to target molecules. Because of their unique target-binding properties, the use of aptamers for targeting cell surface molecules has attracted broad research interest. The field has evolved from selecting aptamers against purified surface proteins to using whole cells (cell-SELEX) as targets. To further advance the field, the concept of tissue-SELEX was later proposed to ensure that selected aptamers possess optimal binding properties in more native in vivo environments. In this article, we review recent progress made for tissue
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To combat the growing threat of antibiotic resistance, environmental testing for antibiotic contamination is gaining an increasing role. This study aims to develop an easy-to-use assay for the detection of the fluoroquinolone antibiotic levofloxacin. Levofloxacin is used in human and veterinary medicine and has been detected in wastewater and river water. An RNA aptamer against levofloxacin was selected using RNA Capture-SELEX. The 73 nt long aptamer folds into three stems with a central three-way junction. It binds levofloxacin with a Kd of 6 µM and discriminates the closely related compound
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Blood is one of the most commonly found biological fluids at crime scenes, with the detection and identification of blood holding a high degree of evidential value. It can provide not only information about the nature of the crime but can also lead to identification via DNA profiling. Presumptive tests for blood are usually sensitive but not specific, so small amounts of the substrate can be detected, but false-positive results are often encountered, which can be misleading. Novel methods for the detection of red blood cells based on aptamer-target interactions may be able to overcome these is
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
An important current issue of modern molecular medicine and biotechnology is the search for new approaches to early diagnostic assays and adequate therapy of infectious diseases. One of the promising solutions to this problem might be a development of nucleic acid aptamers capable of interacting specifically with bacteria, protozoa, and viruses. Such aptamers can be used for the specific recognition of infectious agents as well as for blocking of their functions. The present review summarizes various modern SELEX techniques used in this field, and of several currently identified aptamers again
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The category A agent, botulinum neurotoxin (BoNT), is the most toxic molecule known to mankind. The endopeptidase activity of light chain domain of BoNT is the cause for the inhibition of the neurotransmitter release and the flaccid paralysis that leads to lethality in botulism. Currently, antidotes are not available to reverse the flaccid paralysis caused by BoNT. In the present study, we have identified three RNA aptamers through SELEX-process, which bind strongly to the light chain of type A BoNT (BoNT/A) and inhibit the endopeptidase activity, with IC(50) in low nM range. Inhibition kineti
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The COVID-19 pandemic exposed major disparities in global diagnostic capacity, particularly in low- and middle-income countries (LMICs) where reliance on conventional assays and external technologies hindered rapid response. Aptamers offer a promising alternative; however, practical and experimentally validated frameworks that connect aptamer discovery to assay development and evaluation in LMIC settings remain limited. Here, we present an integrated and stepwise framework and its feasibility for developing and validating aptamer-based testing tools using SARS-CoV-2 as a model. Native viral pa
СтатьяВалидационное исследованиеПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: SELEX technique is employed to select aptamers against wide range of targets. The in vitro method of aptamer selection using live cells as the target is referred as cell-SELEX.
SCOPE OF THE REVIEW: The review provides a comprehensive description on the development of aptamers through various cell-SELEX methods and list of aptamers identified through this method. In addition, it pinpoints the advantages and limitations of the cell-SELEX process and its variants.
MAJOR CONCLUSIONS: The use of aptamers as therapeutic and diagnostic agents is rapidly evolving, selection techniques su
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aptamers face challenges for use outside the ideal conditions in which they are developed. These difficulties are most palpable in vivo due to nuclease activities, rapid clearance, and off-target binding. Herein, we demonstrate that a polyphosphodiester-backboned molecular brush can suppress enzymatic digestion, reduce non-specific cell uptake, enable long blood circulation, and rescue the bioactivity of a conjugated aptamer in vivo. The backbone along with the aptamer is assembled via solid-phase synthesis, followed by installation of poly(ethylene glycol) (PEG) side chains using a two-step p
СтатьяПоддержка правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Here, we proposed an enzyme-linked oligonucleotide assay (ELONA) for yellow fever (YF) diagnosis that uses a pair of aptamers, YFns1-4 and YFns1-31. The aptamers were selected to specifically bind to nonstructural protein 1 (NS1), which is secreted at a high concentration after YF infection. We applied the aptamers which did not interfere with each other on binding to the NS1 in a sandwich ELONA. In the assay, the best detection sensitivity was obtained when the combination of YFns1-31 as a capture aptamer and YFns1-4 as a detect aptamer was used. The sensitivity could be attributed to the res
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования