Escherichia coli (E. coli) O157:H7 is a major foodborne pathogen and a critical global food safety concern. Bacteriophage (phage) therapy offers a promising, highly specific biological alternative to antibiotic treatment. However, the clinical application of phage therapy is frequently limited by the rapid emergence of bacterial resistance. In this study, we examined the interaction between E. coli O157:H7 strain EDL933 and two T4-like phages, assessing the adaptive costs incurred by host strains in developing phage resistance. Our results indicate that phage PSD2001 utilizes capsular polysacc
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Shiga toxin producing Escherichia coli O157 can cause severe bloody diarrhea and haemolytic uraemic syndrome. Phage typing of E. coli O157 facilitates public health surveillance and outbreak investigations, certain phage types are more likely to occupy specific niches and are associated with specific age groups and disease severity. The aim of this study was to analyse the genome sequences of 16 (fourteen T4 and two T7) E. coli O157 typing phages and to determine the genes responsible for the subtle differences in phage type profiles.
RESULTS: The typing phages were sequenced usin
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Accurate monitoring of polynucleotide kinase (PNK) activity is essential for DNA repair studies and early clinical diagnostics. Conventional λ-exonuclease (λ-exo)-based biosensors often suffer from high background signals and false‑positive results, mainly due to nonspecific hydrolysis and unintended phosphorylation. To address these issues, we developed a double- strand gated (DSG) biosensing platform that integrates high-order dimer G-triplex (DG-3) structures as signal reporters, significantly reducing background interference and enabling robust signal amplification. In this DSG strategy, λ
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Influenza A virus (IAV) represents a considerable threat to both animal and human health, while current detection methods encounter challenges related to the spectrum, rapidity, and sensitivity of viral identification. Herein, we describe the development of a magnetic T4 phage surface plasmon resonance probe for universal, rapid, highly sensitive, and visually detectable IAV detection under dark field microscopy (DFM). Briefly, we initially fused the Soc protein of the T4 phage with a single-chain variable fragment (scFv) antibody that exhibits broad-spectrum affinity toward the hemagglutinins
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND/AIMS: Bacteriophages (phages) are viruses of bacteria. Escherichia coli phage (T4) can potentially interfere with adsorption of HAdV-5 to cellular integrins by its KGD motif, while staphylococcal A5/80 phage does not possess this structure. The objective of this study was to investigate the effects of T4 and A5/80 phage preparations on type 5 human adenovirus (HAdV-5) DNA synthesis and the expression of HAdV-5 genes.
METHODS: Experiments were performed on the A549 cell line. HAdV-5 DNA synthesis was investigated with real-time PCR. Expression of HAdV-5 early (DBP) and late (hexon)
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The detection of Escherichia coli (E. coli) is a fundamental aspect of water safety assessments, serving as an indicator of fecal contamination. However, current methods often fail to distinguish viable E. coli cells, resulting in false-positive outcomes. We have developed a facile and sensitive method combining one-step phagomagnetic separation with reporter phage amplification to address this challenge. This method employs magnetically functionalized T4 phages to selectively bind and concentrate E. coli from liquid samples. A genetically engineered phage carrying the NanoLuc luciferase gene
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Molecular dynamics (MD) simulations are powerful tools for studying biomolecular systems, but they are fundamentally limited by accessible time scales, making the study of rare events such as protein folding or ligand unbinding computationally challenging. While several enhanced-sampling methods exist to accelerate such processes, their efficacy depends critically on the choice of collective variables (CVs), which are typically intuition-driven and must be defined a priori. To address this, we introduced a unified framework that couples the recently developed OPES-eABF hybrid scheme with a dat
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bacteriophages are viruses that attack and usually kill bacteria. Their appearance in the industrial facilities using bacteria to produce active compounds (e.g., drugs, food, cosmetics, etc.) causes considerable financial losses. Instances of bacteriophage resistance towards disinfectants and decontamination procedures (such as thermal inactivation and photocatalysis) have been reported. There is a pressing need to explore new ways of phage inactivation that are environmentally neutral, inexpensive, and more efficient. Here, we study the effect of zero-valent iron nanoparticles (nZVI) on four
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cyclic oligonucleotide-based antiphage signaling systems (CBASS) are bacterial immune pathways evolutionarily related to cGAS-STING (cyclic GMP-AMP synthase-stimulator of interferon genes) in humans. In CBASS, cGAS/DncV-like nucleotidyltransferase (CD-NTase) enzymes sense phage infection and synthesize nucleotide signals to initiate antiviral defense. Here, we reveal phage prohead protease activity as a widespread mechanism of CD-NTase activation. We reconstitute CBASS recognition of phage T4 in vitro and identify proteolytic cleavage of a CD-NTase activation loop as a trigger of immune signal
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Oral administration of biologic drugs is challenging because of the degradative activity of the upper gastrointestinal tract. Strategies that use engineered microbes to produce biologics in the lower gastrointestinal tract are limited by competition with resident commensal bacteria. Here we demonstrate the engineering of bacteriophage (phage) that infect resident commensals to express heterologous proteins released during cell lysis. Working with the virulent T4 phage, which targets resident, nonpathogenic Escherichia coli, we first identify T4-specific promoters with maximal protein expressio
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Thymidine is an important precursor in the production of various antiviral drugs, including azidothymidine for the treatment of AIDS. Since thymidine-containing nucleotides are synthesized only by the de novo pathway during DNA synthesis, it is not easy to produce a large amount of thymidine biologically. In order to develop a host strain to produce thymidine, thymidine phosphorylase, thymidine kinase, and uridine phosphorylase genes were deleted from an Escherichia coli BL21 strain to develop BLdtu. Since the genes coding for the enzymes related to the nucleotide salvage pathway were disrupte
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Phage type 4 Salmonella enteritidis strains have only recently been isolated from poultry and humans in the United States, although this phage type predominates in many other countries. The present study assessed the ability of S. enteritidis isolates of various phage types found in the United States (including phage type 4) to colonize the intestinal tract and invade to reach internal organs in experimentally infected chicks. Groups of 5-day-old single-comb white leghorn chicks were inoculated with a range of oral doses of three phage type 4 isolates and three isolates of other phage types. A
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Understanding adaptation to complex environments requires information about how exposure to one selection pressure affects adaptation to others. For bacteria, antibiotics and viral parasites (phages) are two of the most common selection pressures and are both relevant for treatment of bacterial infections: increasing antibiotic resistance is generating significant interest in using phages in addition or as an alternative to antibiotics. However, we lack knowledge of how exposure to antibiotics affects bacterial responses to phages. Specifically, it is unclear how the negative effects of antibi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The most common method for phage quantitation is the plaque assay, which relies on phage ability to infect bacteria. However, non-infective phage particles may preserve other biological properties; specifically, they may enter interactions with the immune system of animals and humans. Here, we demonstrate real-time quantitative polymerase chain reaction (qPCR) detection of bacteriophages as an alternative to the plaque assay. The closely related staphylococcal bacteriophages A3R and 676Z and the coliphage T4 were used as model phages. They were tested in vivo in mice, ex vivo in human sera, an
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Development of safe and efficient nanoscale vehicles that can deliver large molecular cargos into human cells could transform future human therapies and personalized medicine. Here, we design a hybrid viral vector composed of a prokaryotic virus (bacteriophage T4) and a eukaryotic virus [adeno-associated virus (AAV)]. The small 25-nm AAV is attached to the large 120 nm × 86 nm T4 head through avidin-biotin cross-bridges using the phage decoration proteins Soc and Hoc. AAV "piggy-backed" on T4 capsid, by virtue of its natural ability to enter human cells acted as an efficient "driver," deliveri
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Streptococcus pyogenes (group A Streptococcus) causes severe invasive infections including scarlet fever, pharyngitis (streptococcal sore throat), skin infections, necrotizing fasciitis (flesh-eating disease), septicemia, erysipelas, cellulitis, acute rheumatic fever, and toxic shock. The conversion from nonpathogenic to toxigenic strains of S. pyogenes is frequently mediated by bacteriophage infection. One of the key bacteriophage-encoded virulence factors is a putative "hyaluronidase," HylP1, a phage tail-fiber protein responsible for the digestion of the S. pyogenes hyaluronan capsule durin
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bacteriophages are the dominant members of the human enteric virome and can shape bacterial communities in the gut; however, our understanding of how they directly impact health and disease is limited. Previous studies have shown that specific bacteriophage populations are expanded in patients with Crohn's disease (CD) and ulcerative colitis (UC), suggesting that fluctuations in the enteric virome may contribute to intestinal inflammation. Based on these studies, we hypothesized that a high bacteriophage burden directly induces intestinal epithelial responses. We found that filamentous bacteri
СтатьяПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lysozyme can effectively lyse Escherichia coli (E. coli), providing a method for the release of intracellular substances. In this study, an inside-out lysis system based on T4 lysozyme was constructed. Three secretion signal peptides (PelB, NapA, and HybA) were fused to T4 lysozyme to create fusion proteins, among which, NapA-T4 lysozyme (N-T4L) exhibited the highest level of intracellular protein leakage. Microscopic analysis revealed significant cell wall damage in N-T4L expressing cells, confirming the initiation of cell lysis. The influence of chemical factors on cell lysis was also evalua
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Carr-Purcell-Meiboom-Gill (CPMG) relaxation dispersion experiments establish that at room temperature, the L99A cavity mutant of T4 lysozyme (L99A T4L) interconverts between two compact folded conformations on the millisecond timescale. These include the native state in which the sidechain of Phe114 is exposed to solvent (E state) and a near-native minor state in which the aromatic moiety of Phe114 is buried in the core of the protein (B state, ∼2%). Molecular dynamics simulations that have captured the E to B interconversion in L99A T4L and related mutants suggest that these proteins adopt co
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Studies on dsDNA bacteriophages have revealed that a DNA packaging complex assembles at a special vertex called the 'portal vertex' and consists of a portal, a DNA packaging ATPase and other components. AdV protein IVa2 is presumed to function as a DNA packaging ATPase. However, a protein that functions as a portal is not yet identified in AdVs. To identify the AdV portal, we performed secondary structure analysis on a set of AdV proteins and compared them with the clip region of the portal proteins of bacteriophages phi29, SPP1 and T4. Our analysis revealed that the E4 34K protein of HAdV-C5
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.