Fragment-based screening methods can be used to discover novel active site or allosteric inhibitors for therapeutic intervention. Using saturation transfer difference (STD) NMR and in vitro activity assays, we have identified fragment-sized inhibitors of HIV-1 reverse transcriptase (RT) with distinct chemical scaffolds and mechanisms compared to nonnucleoside RT inhibitors (NNRTIs) and nucleoside/nucleotide RT inhibitors (NRTIs). Three compounds were found to inhibit RNA- and DNA-dependent DNA polymerase activity of HIV-1 RT in the micromolar range while retaining potency against RT variants c
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Understanding in detail the factors which permit Staphylococcus aureus to counteract cell wall-active antibiotics is a prerequisite to elaborating effective strategies to prolong the usefulness of these drugs and define new targets for pharmacological intervention. Methicillin-resistant S. aureus (MRSA) strains are major pathogens of hospital-acquired and community-acquired infections and are most often treated with glycopeptides (vancomycin and teicoplanin) because of their resistance to most penicillins and a limited arsenal of clinically proven alternatives. In this study, we examined PrsA,
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The regulatory regions of the neurofibromatosis type 1 (NF1) gene have scarcely been screened either for mutations of potential pathological importance or for functional polymorphisms. To address this question, a 987 bp sequence spanning the promoter and 5' flanking sequence of the human NF1 gene was screened for sequence variants in 570 unrelated NF1 patients and 105 controls. Five novel sequence variants were identified, comprising a 14 bp deletion at -142 within the promoter region, three single nucleotide substitutions in the 5'UTR (C + 247T, C + 261G, G + 462C), and a substitution (C + 51
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The order Rhizobiales contains numerous agriculturally, biotechnologically, and medically important bacteria, including the rhizobia, and the genera Agrobacterium, Brucella, and Methylobacterium, among others. These organisms tend to be metabolically versatile, but there has been relatively little investigation into the regulation of their central carbon metabolic pathways. Here, RNA-sequencing and promoter fusion data are presented to show that the PckR protein is a key regulator of central carbon metabolism in Sinorhizobium meliloti; during growth with gluconeogenic substrates, PckR represse
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A novel naphthalene-2,3-diamine-2-salicylaldehyde (NS) ligand and its mononuclear copper(II) complex (CuNS) have been synthesized and structurally characterized. The UV–vis absorption and emission spectra of NS showed obvious changes on addition of Cu2+ solution. The interaction of the compounds with calf thymus DNA and G-quadruplex DNA were investigated by spectroscopic methods and thermal melting assay. The nucleolytic cleavage activity of the compounds was investigated on double-stranded circular pBR322 plasmid DNA and G-quadruplex DNA by electrophoretic mobility shift assay. The results sh
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The antimicrobial peptide PMAP-36 is a highly cationic and amphipathic α-helical peptide. PRW4 is a truncated analog that replaces paired lysine residues with tryptophan along the N-terminal and deletes the C-terminal hydrophobic tail of PMAP-36. Studies on the two peptides have already been performed. However, whether there is a synergistic effect with antibiotics has not been investigated, and the study of the antibacterial mechanism of the peptides is inadequate. In this study, antibiotic-peptide combinations were tested against Escherichia coli ATCC 25922 and Staphylococcus aureus ATCC 292
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Xeroderma Pigmentosum A (XPA) protein is involved in the DNA damage recognition and repair complex formation steps of nucleotide excision repair (NER), and has been shown to preferentially bind to various forms of DNA damage including bulky lesions. DNA interstrand crosslinks are of particular interest as a form of DNA damage, since these lesions involve both strands of duplex DNA and present special challenges to the repair machinery, and mitomycin C (MMC) is one of several useful cancer chemotherapy drugs that induce these lesions. Purified XPA and the minimal DNA-binding domain of XPA a
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To gain new insights into the molecular pathogenesis of the 109(InsG) and 139(C--> T) mutations and their roles in familial oligodontia.
METHODS: The region of PAX9 paired domain (PAX9PD) was amplified and the expression plasmids were constructed in pGEXlambda -1T by PCR-based cloning. PAX9PD proteins were prepared on the basis of GST instruction. The binding of wild type and two novely mutant PAX9 paired domain to double-stranded DNA targets were analyzed by gel mobility shift assay.
RESULTS: Wild type PAX9PD protein bind to the high affinity paired domain recognition sequences,
Аннотация на английскомСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To determine the antiangiogenic effect of cyclosporin A (CSA) in rheumatoid arthritis (RA).
METHODS: We investigated the effect of CSA on the production of vascular endothelial growth factor (VEGF) by rheumatoid synovial fibroblasts. Fibroblast-like synoviocytes (FLS) were prepared from the synovial tissues of RA patients, and cultured in the presence of CSA. The production of VEGF by FLS was measured in culture supernatants by enzyme-linked immunosorbent assay. The VEGF messenger RNA (mRNA) expression and activator protein 1 (AP-1) binding activity for VEGF transcription were dete
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND & AIMS: Glucagon-like peptide (GLP)-2 may exert antifibrotic effects on hepatic stellate cells (HSCs). Thus, we aimed to test whether application of the GLP-2 analogue teduglutide has hepatoprotective and antifibrotic effects in the Mdr2/Abcb4-/- mouse model of sclerosing cholangitis displaying hepatic inflammation and fibrosis.
METHODS: Mdr2-/- mice were injected daily for 4 weeks with teduglutide followed by gene expression profiling (bulk liver; isolated HSCs) and immunohistochemistry. Activated HSCs (LX2 cells) and immortalized human hepatocytes and human intestinal organoids w
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: HLA-B27 and the endoplasmic reticulum aminopeptidase 1 (ERAP1) and ERAP2 genes are predisposing factors for AS. A single nucleotide polymorphism (SNP) in the ERAP2 promoter (rs75862629) coordinates the transcription of both ERAP genes. We investigated whether this SNP associates with AS and whether it affects the expression of the two major HLA-B27 alleles present in Sardinia, the AS-associated B*2705 and the non-AS-associated B*2709.
METHODS: Four SNPs in the ERAP region were genotyped in HLA-B*2705-positive patients with AS (n = 145), B27-positive healthy subjects (n = 126) and
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Recruitment of macrophages is essential to the pathogenesis of nasal polyps (NP), since this disease is inflammation-related. In this study, the effects of tumor necrosis factor alpha (TNF-alpha) on the expression of C-C chemokine ligand 2 (CCL2) in fibroblasts derived from nasal polyps (NPFs) were investigated. The roles of cyclooxygenase (COX) 2 and prostaglandins in the mediation of TNF-alpha-stimulated CCL2 gene expression were also investigated.
METHODS: Northern blot analysis was used to study the expression of CCL2 and c-Fos in cultured NPFs. An electrophoretic mobility shi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Therapeutic effectiveness of ursodeoxycholic acid (UDCA) for primary biliary cirrhosis strongly indicates that UDCA possesses immunomodulatory activities. In order to further investigate mechanical background of such UDCA action, we first asked whether UDCA modulates glucocorticoid-mediated signal transduction. Using electrophoretic mobility-shift assay, we demonstrated that treatment with UDCA promoted the specific complex formation between the cytosol protein and the glucocorticoid-response element DNA in a dose-dependent fashion in vitro, and also nuclear translocation of the glucocorticoid
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Glycogen synthase kinase-3 beta (GSK-3β) is involved in multiple signaling pathways. Consistent with its critical roles in normal cells, abnormalities in GSK-3β activity have been implicated in diabetes, heart disease, Parkinson disease, and Alzheimer's disease. In this study, a series of new scaffolds of small molecule inhibitors of GSK-3β were identified by virtual screening and bioassay. Candidates that adhere to drug-like criteria from a virtual library of compounds were tested using computational docking studies. Twenty selected compounds were tested, which led to the discovery of two hit
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIM: Many intracellular components have been implicated in the regulation of redox homeostasis, but homeostasis can be unbalanced by reactive species (RS), which also probably contribute to underlying inflammatory processes. Nuclear factor-κB (NF-κB) is a well-known redox-sensitive transcription factor that controls the genes responsible for regulating inflammation.
METHODS: In the present study, the authors investigated the effect of short-term salicylideneamino-2-thiophenol (SAL-2) administration on the modulation of pro-inflammatory NF-κB through redox regulation in aged rats. In addition,
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Although rapamycin has been reported to increase procoagulants and decrease anticoagulants in human umbilical vein endothelial cells (HUVECs), there is no significant difference in the incidence of stent thrombosis between patients with drug-eluting stents (DESs) and those with bare metal stents (BMSs). Krüppel-like transcription factor 2 (KLF2) has been identified as a key regulator of endothelial antithrombotic function. We hypothesized that rapamycin might induce the expression and activity of KLF2, thereby counteracting coronary endothelial dysfunction induced by DESs.
METHODS
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The structural and conformational features of the potent 10-membered enediyne-containing calicheamicin γ 1I that account for its remarkable DNA site-specific binding and cleavage are reviewed. A variety of spectroscopic and biophysical techniques were used to gain insight into the binding and stereospecific DNA cleavage of this potent antitumor agent. These include gel-shift cleavage assays, atom transfer NMR experiments, drug-DNA conformational studies, circular dichroism, and capillary electrophoresis. Computational descriptions are described for the DNA binding and cleavage of calicheamicin
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Electrophysiological studies of wild-type and mutated forms of anthrax protective antigen (PA) suggest that the Phe clamp, a structure formed by the Phe427 residues within the lumen of the oligomeric PA pore, binds the unstructured N-terminus of the lethal factor and the edema factor during initiation of translocation. We now show by electrophysiological measurements and gel shift assays that a single Cys introduced into the Phe clamp can form a disulfide bond with a Cys placed at the N-terminus of the isolated N-terminal domain of LF. These results demonstrate direct contact of these Cys resi
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Magnolol has been reported to have an anti-inflammatory and antitumor effect in vitro and in vivo. Herein, we report the investigation of the inhibitory effects of magnolol on 12-O-tetradecanoylphorbol-13-acetate (TPA)-induced expression of inducible nitric oxide synthase (iNOS) and cyclooxygenase-2 (COX-2) in mouse skin. We found that the topical application of magnolol effectively inhibited the transcriptional activation of iNOS and COX-2 mRNA and proteins in mouse skin stimulated by TPA. Pretreatment with magnolol resulted in the reduction of TPA-induced nuclear translocation of the nuclear
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alternative splicing of the locus AbetaH-J-J generates functionally distinct proteins: the enzyme aspartyl (asparaginyl) beta-hydroxylase, humbug and junctate (truncated homologs of aspartyl (asparaginyl) beta-hydroxylase with a role in calcium regulation), and junctin (a structural protein of the sarcoplasmic reticulum membrane). Aspartyl (asparaginyl) beta-hydroxylase and humbug are overexpressed in a broad range of malignant neoplasms. We have previously reported the gene structure of this locus, showing the presence of two putative promoters, P1 and P2, and characterized the P2 sequences,
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.