Early-life exposure to environmental pollutants poses a critical risk to pediatric health, yet few studies have integrated chemical contaminants with urban land-use characteristics to assess their combined associations with the developing gut microbiome. In this study, we evaluated the associations between fecal heavy metal (HM) concentrations and residential land-use cover area (measured as area-based metrics within specific buffers), as well as gut microbial composition and predicted functional pathways, in 78 preschool children from the greater Taipei area. Using Bayesian kernel machine reg
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Correlative structural and chemical imaging of biofilms allows for the combined analysis of microbial identity and metabolism at the microscale. Here, we developed pH-FISH, a method that combines pH ratiometry with fluorescence in situ hybridization (FISH) in structurally intact biofilms for the coupled investigation of microbial acid metabolism and biofilm composition. Careful biofilm handling and modified sample preparation procedures for FISH allowed preservation of the three-dimensional biofilm structure throughout all processing and imaging steps. We then employed pH-FISH to i
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background/Objective: This study investigated the relationship between the composition of oral microbiota and metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease (MASLD) in the general population. Methods: In total, 712 participants in a health check-up project were divided into four oral microbiota patterns by principal component analysis and cluster analysis; they were included in Neisseria, Streptococcus, Fusobacterium, and Veillonella groups. The Neisseria group had the largest number of patients and was used as a reference group to compare the incidence of MASLD and cardiometabolic c
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Few studies reported the relation of intestinal microbiome composition and diversity in pediatric patients with primary sclerosing cholangitis (PSC) and ulcerative colitis (UC). In this cross-sectional study, we selected patients younger than 19 years old from the pediatric gastroenterology and hepatology outpatient clinic of a tertiary hospital to describe the intestinal microbiome of pediatric patients with PSC associated or not to UC. Patients were divided in PSC, PSC+UC, and UC diagnosis. A stool sample was collected from each patient (n=30) and from a healthy relative/neighbor (n=23). The
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Objective: The oral microbiota plays a key part in the initial colonization by pathogens and the chronic inflammatory reaction of the host. We measured variations in the salivary microbiota and evaluated their potential associations with periodontitis and chronic obstructive pulmonary disease (COPD). Methods: We investigated the salivary microbiota of patients with COPD and periodontitis (n = 21) compared with that in patients with periodontitis alone (n = 36) and with healthy controls (HCs; n = 14), using pyrosequencing of polymerase chain reaction-amplified 16s rRNA genes. Results: Bacterial
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Studies of microbiota composition of infants with small intestinal ostomy due to various etiologies are limited. Here, we characterized the intestinal microbiota of neonates with ileostomy resulting from distinct primary diseases.
METHODS: Fifteen patients with necrotizing enterocolitis, eight patients with meconium peritonitis, and seven patients with Hirschsprung's disease were included in the study. The small intestinal microbiota composition in infants with ileostomy caused by these diseases was studied.
RESULTS: Microbial diversity in neonatal ileostomy fluid was generally l
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The exacerbation of a chronic gingivitis during pregnancy was confirmed in a group of 24 pregnant patients who were observed at the 14th and 30th weeks of pregnancy and postpartum. This exacerbation occurred despite a fall in the amount of plaque accumulation and confirmed that during pregnancy some factor in addition to plaque is involved in the increased inflammation. Using in vitro methods, it was shown that during pregnancy there is a depression of maternal T-cell responsiveness and it is suggested that this depression of the cell-mediated immune response could be a factor in the altered r
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Infantile cholestasis (IC) is the most common hepatobiliary disease in infants, resulting in elevated direct bilirubin levels. Indeed, hepatointestinal circulation impacts bile acid and bilirubin metabolism. This study evaluates changes in the gut microbiota composition in children with IC and identifies abnormal metabolite profiles associated with microbial alterations.
RESULTS: The gut microbiota in the IC group exhibits the higher abundance of Veillonella, Streptococcus and Clostridium spp. (P < 0.05), compared to healthy infants (CON) group. Moreover, the abundance of Ruminoco
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND AIMS: Biliary atresia is the most common cause of liver disease and liver transplantation in children. The accumulation of bile acids in hepatocytes and the stimulation of the intestinal microbiome can aggravate the disease progression. This study investigated changes in the composition of the gut microbiota and its metabolites in biliary atresia and the possible effects of these changes on disease progression.
METHODS: Stool samples of biliary atresia at different disease stages and matched control individuals were collected (early stage: 16 patients, 16 controls; later stage:
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Objective: The intestinal microbiome is associated with various autoimmune diseases. Regional difference is the main influencing factor of intestinal microbial difference. This study aimed to identify the differences in fecal microbiome between autoimmune hepatitis (AIH) patients and healthy controls (HCs) in Central China, and to validate the efficacy of fecal microbiome as a diagnostic tool for AIH. Design: We collected 115 fecal samples from AIH patients (N = 37) and HCs (N = 78) in Central China and performed gene sequencing. Fecal microbiomes were characterized and microbial markers for A
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The gut microbiota has recently been recognized to play a role in the pathogenesis of autoimmune liver disease (AILD), mainly primary biliary cholangitis (PBC) and autoimmune hepatitis (AIH). This study aimed to analyze and compare the composition of the oral microbiota of 56 patients with AILD and 15 healthy controls (HCs) and to evaluate its association with salivary immunological biomarkers and gut microbiota. The subjects included 39 patients with PBC and 17 patients with AIH diagnosed at our hospital. The control population comprised 15 matched HCs. Salivary and fecal samples were collect
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Porphyromonas gingivalis is present in dental plaque as early as 4 h after tooth cleaning, but it is also associated with periodontal disease, a late-developing event in the microbial successions that characterize daily plaque development. We report here that P. gingivalis ATCC 33277 is remarkable in its ability to interact with a variety of initial, early, middle, and late colonizers growing solely on saliva. Integration of P. gingivalis into multispecies communities was investigated by using two in vitro biofilm models. In flow cells, bacterial growth was quantified using fluorescently conju
СтатьяResearch Support, N.I.H., IntramuralПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To explore the association between the oral microbiome and the presence or progression of lung cancer (LC) using metagenomic sequencing techniques.
METHODS: Databases, including PubMed and EMBASE, were reviewed. Eligible studies included the study of oral microorganisms via genomic sequencing and molecular mechanisms associated with LC in saliva, sputum, bronchoalveolar lavage fluid (BALF), or tumor tissue from LC patients. A quality analysis of the studies was carried out, and a qualitative synthesis was performed according to the localization and sample type. Meta-analysis was pe
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This prospective pilot study aimed to evaluate the effect of minocycline-HCl ointment (MO), locally delivered as an adjunct to scaling and root planing (SRP), on subgingival microflora. A total of 59 periodontitis patients received SRP as an initial periodontal therapy. In the selected periodontal pockets with probing depths (PD) of 6−9 mm, the sites that exhibited a positive reaction following a bacterial test using an immunochromatographic device were subsequently treated with MO (SRP + MO group, n = 25). No additional treatment was performed at sites showing a negative reaction (SRP group,
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The gut microbiome exerts important functions on host health maintenance, whereas excessive antibiotic use may cause gut flora dysfunction resulting in serious disease and dysbiosis. Colistin is a broad-spectrum antibiotic with serious resistance phenomena. However, it is unclear whether colistin alters the gastrointestinal tract microbiome in piglets. In this study, 16s rDNA-based metagenome analyses were used to assess the effects of colistin on the modification of the piglet microbiome in the stomach, duodenum, jejunum, cecum, and feces. Both α- and β-diversity indices showed that colistin
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Perturbations of the gut microbiota in pulmonary tuberculosis (PTB) patients, often antibiotic-induced, are frequently observed; however, the defining features of this dysbiosis and its relationship with clinical phenotypes remain insufficiently characterized.
METHODS: In this cross-sectional study, we collected fecal samples from 66 PTB patients and performed 16S rRNA gene (V3-V4) sequencing. Species-level taxonomic profiling was conducted using the Human Gut Microbiome Analysis Database (HGMAD). Enterotypes were constructed, and their associations with PTB were investigated. The
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Gut microbiota could influence gut, as well as hepatic and biliary immune responses. We therefore thoroughly characterised the gut microbiota in primary sclerosing cholangitis (PSC) compared with healthy controls (HC) and patients with ulcerative colitis without liver disease.
DESIGN: We prospectively collected 543 stool samples. After a stringent exclusion process, bacterial DNA was submitted for 16S rRNA gene sequencing. PSC and HC were randomised to an exploration panel or a validation panel, and only significant results (p<0.05, QFDR<0.20) in both panels were reported, followed
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gut microbiota may play an important role in the pathophysiology of Schistosoma japonicum infection, yet microbial signatures associated with advanced schistosomiasis remain poorly defined. In this matched case-control study, we compared gut microbiota profiles between 67 patients with advanced schistosomiasis and 67 age-, sex-, and region-matched chronic cases, and examined associations with nutritional indicators and dietary patterns. Fecal microbiota was characterized using 16S rRNA gene sequencing, and demographic, anthropometric, nutritional, and dietary data were concurrently collected.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The subgingival microbiome is largely uncultivated, and therefore, cultivation-based and targeted molecular approaches have limited value in examining the effect of smoking on this community. We tested the hypothesis that the subgingival biofilm is compositionally different in current and never-smokers by using an open-ended molecular approach for bacterial identification. Subgingival plaque from deep sites of current and never-smokers matched for disease was analyzed by 16S sequencing. Smokers demonstrated greater abundance of Parvimonas, Fusobacterium, Campylobacter, Bacteroides, and Trepone
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The oral cavity is one of the most complex microbial environments; however, the complex nature of the salivary microbiota and the level of inorganic anions in the saliva of subjects with and without gastroesophageal reflux disease (GERD) are poorly understood. The primary goals of this pilot research were to assess differences in salivary bacterial community composition and inorganic anion concentrations between patients with GERD and GERD-free people. Thus, the salivary microbiota within both groups was dominated by these genera: Streptococcus, Prevotella, Porphyromonas, Veillonella, Neisseri
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.