OBJECTIVES: Sheep farming represents an important economic sector in Algeria, and the potential dissemination of methicillin-resistant Staphylococcaceae (MRS) is a critical veterinary and public health concern. This study aimed to determine the prevalence and types of MRS in ovine in Algeria and characterize them using whole-genome sequencing (WGS) analysis.
METHODS: Two hundred sheep from 20 different Algerian farms across 3 regions were screened for nasal colonization with MRS. The isolates were identified by matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry (MALD
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Proteus mirabilis is a common opportunistic zoonotic pathogen, and its ongoing acquisition of antimicrobial resistance genes poses challenges to clinical treatments. Human-sourced whole genomic sequencing of human P. mirabilis isolates has been reported, but pig-sourced isolates have not been thoroughly investigated even though these animals can serve as reservoirs for human infections. In the current study, we report a molecular epidemiological investigation to unravel the antimicrobial and virulence gene risk factors for P. mirabilis contamination in 9 pig farms in 3 different cities in Zhej
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Antimicrobial use in livestock production has been linked to antimicrobial resistance (AMR) worldwide; however, optimization of their use has been considered an important strategy in dealing with it. The aims of this study were as follows: (a) to assess the literature on antimicrobial usage (practices, frequency, class, type) in cattle and poultry production with regard to resistance in Escherichia coli (E. coli) including multidrug resistance (MDR) (b) summarize evidence for quantitative (volumes of active antimicrobial ingredients) and quality (identify and quantify active ingredient) and (c
Систематический обзорСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Clostridioides difficile is a neglected pathogen in many African countries as it is generally not regarded as one of the major contributors toward the diarrheal disease burden in the continent. However, several studies have suggested that C. difficile infection (CDI) may be underreported in many African settings. The aim of this study was to determine the prevalence of CDI in hospitalized patients, evaluate antimicrobial exposure, and detect toxin and antimicrobial resistance profiles of the isolated C. difficile strains.
METHODS: In this cross-sectional study, 333 hospitalized
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The increasing worldwide prevalence of extended-spectrum beta-lactamase (ESBL) producing Escherichia coli constitutes a serious threat to global public health. Surgical site infections are associated with high morbidity and mortality rates in developing countries, fueled by the limited availability of effective antibiotics. We used whole-genome sequencing (WGS) to evaluate antimicrobial resistance and the phylogenomic relationships of 19 ESBL-positive E. coli isolates collected from surgical site infections in patients across public hospitals in Benin in 2019. Isolates were identified by MALDI
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Salmonella enterica subspecies enterica serotype Dublin is a host-adapted serotype in cattle, associated with enteritis and systemic disease. The primary clinical manifestation of Salmonella Dublin infection in cattle, especially calves, is respiratory disease. While rare in humans, it can cause severe illness, including bacteremia, with hospitalization and death. In the United States, S. Dublin has become one of the most multidrug-resistant serotypes. The objective of this study was to characterize S. Dublin isolates from sick cattle by analyzing phenotypic and genotypic antimicrobial resista
СтатьяПоддержка правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A total of 1,537 clinical isolates of Haemophilus influenzae were recovered in 30 U.S. medical center laboratories between 1 November 1994 and 30 April 1995 and were characterized in a central laboratory with respect to serotype and beta-lactamase production and the in vitro activities of 15 oral antimicrobial agents. Overall, 36.4% of the isolates were found to produce beta-lactamase. The rank order of activity of six cephalosporins on the basis of MICs was cefixime > cefpodoxime > cefuroxime > loracarbef > or = cefaclor > cefprozil. On the basis of current National Committee for Clinical Lab
Сравнительное исследованиеСтатьяМногоцентровое исследованиеПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Streptococcus suis (S. suis) has emerged as an important zoonotic pathogen that can cause serious human infections. S. suis sequence type 1 (ST1) is predominant in sporadic human infections. However, few studies have characterized S. suis ST1 isolated directly from human clinical specimens.Streptococcus suis 366 was isolated from the cerebrospinal fluid (CSF) of a patient with purulent meningitis. Antimicrobial susceptibility testing and whole-genome sequencing were performed. Detailed functional annotations (CARD, VFDB, GO, KEGG, and COG), along with pangenome, phylogenetic, and comparative g
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Staphylococcus aureus is a leading cause of infection, and methicillin-resistant S. aureus (MRSA) is a high-priority resistance threat. MRSA and methicillin-susceptible S. aureus (MSSA) differ in non-β-lactam resistance, yet longitudinal data from Aseer, Saudi Arabia are limited. We characterized methicillin-resistance and non-susceptibility trends to inform local stewardship.
METHODS: We conducted a retrospective laboratory-based surveillance study of 4,194 S. aureus isolates from 3,122 patients (aged ≥12 years) at a tertiary-care center in Aseer, Saudi Arabia (January 2013-June
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Salmonella enterica serovar Dublin (S. Dublin) is a cattle-adapted pathogen that can cause severe systemic infections in humans and animals. Understanding genomic relatedness across host species is essential for assessing the zoonotic potential and dissemination of antimicrobial resistance (AMR). In this study, 78 clinical S. Dublin strains, isolated in Florida between 2019 and 2024, were subjected to comparative genomic analysis. These included 19 animal-derived isolates (17 from dairy cattle and two from dogs) and 59 human-derived isolates. AMR gene profiling revealed widespread multidrug re
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Salmonella Typhimurium and its monophasic variants are major contributors to foodborne illnesses globally, with zoonotic transmission posing significant public health risks. In southern China, persistent salmonellosis cases linked to poultry and pork highlight the need for advanced genomic tools to trace contamination sources and understand transmission dynamics. This study integrates whole-genome sequencing (WGS) and spatiotemporal data to investigate the molecular epidemiology of Salmonella in Jiangxi Province, a region with high incidence of foodborne salmonellosis. Analysis of 206 Salmonel
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Aerobic gram-negative bacilli (AGNB) are not part of the resident oral microflora but are occasionally found in high abundance under inflammatory dysbiotic conditions at various oral niches. The aim of the present study was to investigate the identity and antibiotic susceptibility of AGNB isolated from patients in Sweden with mucosal lesions, periodontitis, and peri-implantitis, with special attention to antibiotic resistance and on the presence of phenotypic Extended Spectrum Beta-Lactamase (ESBL) isolates.
MATERIALS AND METHODS: Microbiolgical samples were harvested from 211 p
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: The study aims to describe phageome of soil rhizosphere of M.oleifera in terms of the genes encoding CAZymes and other KEGG enzymes.
METHODS: Genes of the rhizospheric virome of the wild plant species Moringa oleifera were investigated for their ability to encode useful CAZymes and other KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes) enzymes and to resist antibiotic resistance genes (ARGs) in the soil.
RESULTS: Abundance of these genes was higher in the rhizospheric microbiome than in the bulk soil. Detected viral families include the plant viral family Potyviridae as well as t
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Diabetic foot concerns are a major public health problem. Methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) plays a significant role in diabetic foot ulcers. Community-associated MRSA has become notorious for skin and skin soft tissue infections over the last two decades. This study investigated MRSA infection in diabetic foot patients at a tertiary hospital, focusing on the epidemiology and characteristics of community-associated MRSA.
METHODS: A total of 149 patients with diabetic foot infection whose culture results indicated Staphylococcus aureus as the source were selected.
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
ABSTRACT: Virulence genes expressed in Salmonella are a primary contributing factor leading to the high morbidity and mortality of salmonellosis in humans. The pathogenicity of Salmonella is mainly determined by the specific virulence factors that it carries. These factors also confer greater virulence and play a role in infection of a host and transmission of disease, and most Salmonella enterica can cause cross-infections between humans and animals. In this study, 265 samples in total were collected from a farmer's market and two supermarkets in Xuzhou, Jiangsu province, China, including 205
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Manure from food animals exposed to antibiotics is often used as soil fertiliser, potentially releasing antibiotic-resistant bacteria (ARB) with diverse antibiotic-resistance genes (ARGs) into the soil. To determine the impact of chicken litter application on the soil resistome, Enterococcus spp. isolated from chicken litter and soil samples collected before and after the soil amendment were characterised, using whole-genome sequencing and bioinformatics tools. Nineteen Enterococcus spp. isolates from the three sources were sequenced on Illumina Miseq platform to ascertain the isolates' resist
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: To determine the bacterial profile with its associated risk factors and to identify extended spectrum beta-lactamase producing Gram-negative bacterial uropathogens among diabetic patients at Dessie Referral Hospital, Northeastern Ethiopia.
MATERIALS AND METHODS: A hospital-based cross-sectional study was conducted from May to September 2018. A total of 336 diabetic patients were included using a simple random sampling technique. A structured questionnaire was used to collect socio-demographic and risk factor-related data. A 10-mL mid-stream urine specimen was collected and transporte
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Vibriosis, a hemorrhagic septicemic disease caused by the bacterium Vibrio anguillarum, is an important bacterial infection in Danish sea-re … ymorphisms were identified, and the pan-genome was calculated. All strains carried tet(34) encoding tetracycline resistance, and 36 strains also contained qnrVC6 for increased fluoroquinolone/quinolone resistance. But interestingly, all strains were phenotypic sensitive to both oxytetracycline and oxolinic acid. Almost all serotype O1 strains contained a pJM1-like plasmi …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The aim of this work was to verify the occurrence, quantification, pulse types, and antimicrobial susceptibility profiles of Salmonella sp. isolated from chicken meat produced and marketed in the state of Paraná, considered to be the state with the highest production of poultry meat in Brazil. Ninety-five of 300 (31.5%) frozen cuts of chicken were found to contain Salmonella sp., and 98 different isolates of Salmonella sp. were cultured from the positive samples. Quantification showed low Salmonella sp. loading, ranging from 0.12 to 6.4 MPN/g. The antimicrobial resistance test was performed ag
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Streptococcus pseudopneumoniae is a close relative of the major human pathogen S. pneumoniae It is increasingly associated with lower-respiratory-tract infections (LRTI) and a high prevalence of antimicrobial resistance (AMR). S. pseudopneumoniae is difficult to identify using traditional typing methods due to similarities with S. pneumoniae and other members of the mitis group (SMG). Using whole-genome sequencing of LRTI isolates and a comparative genomic approach, we found that a large number of pneumococcal virulence and colonization genes are present in the core S. pseudopneumoniae genome.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования