We developed a label-free, real-time, and highly sensitive nucleic acid biosensor based on fiber optic particle plasmon resonance (FOPPR). The biosensor employs a single-strand deoxyoligonucleotides (ssDNA) probe, conjugated to immobilized gold nanoparticles on the core surface of an optical fiber. We explore the steric effects on hybridization affinity and limit of detection (LOD), by using different ssDNA probe designs and surface chemistries, including diluent molecules of different lengths in mixed self-assembled monolayers, ssDNA probes of different oligonucleotide lengths, ssDNA probes i
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The frequency of disease-related large rearrangements (referred to as copy-number mutations, CNMs) varies among genes, and search for these mutations has an important place in diagnostic strategies. In recent years, CGH method using custom-designed high-density oligonucleotide-based arrays allowed the development of a powerful tool for detection of alterations at the level of exons and made it possible to provide flexibility through the possibility of modeling chips. The aim of our study was to test custom-designed oligonucleotide CGH array in a diagnostic laboratory setting that analyses seve
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We describe here the development of four sets of painting probes for mouse chromosomes 1 and 13, 2 and 8, 6 and 15, and X and Y by degenerate oligonucleotide-primed polymerase chain reaction (DOP-PCR) amplification of 10-20 copies of microdissected male meiotic chromosomes. The X,Y probe was obtained from the X-Y bivalent of diakinesis/metaphase I complements of mice with a normal karyotype, whereas the other probes were derived from tri- or quadrivalents in diakinesis/metaphase I of two reciprocal translocations, T(1;13)70H and T(2;8)2Wa, and one inversion heterozygote carrying a small deleti
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Simultaneous detection of multiple tumor biomarkers with a simple and low-cost assay is crucial for early cancer detection and diagnosis. Herein, we presented a low-cost and simple assay for multiplexed detection of tumor biomarkers using a spatially separated electrodes strategy. The sensor is fabricated based on a metal-free thiol-yne click reaction, which is mediated by visible light, on commercially available indium tin oxide (ITO) electrodes. Four biomarkers, including p53 DNA, Brca2 DNA, K-ras DNA, and MicroRNA-204 RNA, were used as model analytes, and the corresponding oligonucleotide p
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Novel QD-DNA complexes are prepared by simple electrostatic interaction between pegylated amine-functionalized CdSe/ZnS quantum dots (QDs) and DNA. The cationic nature of the amine functionality on the QD surface allows for formation of an electrostatic complex with negatively charged DNA. The presence of polyethylene glycol (PEG5000) molecules on the QD leads to enhanced stability and decreased nonspecific adsorption of DNA on the QD surface. Unlike assembly of QD-DNA based on hydrogen bonding, the present QD probes tend to be more strongly stabilized during the hybridization process by incre
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Development of chemically modified oligonucleotides, nucleic acid mimics, protein-based constructs, and other ligands - capable of sequence-unrestricted recognition of specific double-stranded (ds) DNA regions - is an area of research that continues to attract considerable attention. Efforts are fueled by the need for diagnostic agents, modulators of gene expression, and novel therapeutic modalities against genetic diseases. While pioneering approaches focused on accessing nucleotide-specific features from the grooves of DNA duplexes, recent developments have entailed strand-invading probes, i
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
During in situ hybridisation on frozen and paraffin-embedded sections of bowel for IkappaB alpha, oligodeoxyribonucleotide probes were found to bind more avidly to eosinophils than target mRNA. This binding could not be obviated using strategies previously employed to block either binding of long DNA probes (200-mers) to eosinophils in bone marrow smears, or of riboprobes to eosinophils in sections of bowel, without removing specific hybridisation of probes. That this binding could arise through interaction of anionic oligodeoxyribonucleotides with eosinophil cationic protein, which has an unu
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cyprinid herpesvirus 2 (CyHV-2) is an emerging pathogen in the commercially exploited fish, Prussian carp (Carassius auratus gibelio), which has caused huge economic loss in China and appears to be spreading worldwide. In this article, CyHV-2 infection of Prussian carp was confirmed for the first time by polymerase chain reaction (PCR), which gave positive results from the tissue samples dissected from moribund fish including kidney, spleen, liver, and gill. Histological examination showed systemic inflammatory reactions in the infected tissues, with infiltration of hemocytes, hypertrophied nu
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We have used four oligonucleotide probes and two restriction enzymes to detect the beta thalassaemia mutation in a group of 61 couples of Italian descent who were prospective parents. We have been able to define the beta thalassaemia mutation in both parents in 47 couples and in only one parent in 12 couples. Prenatal diagnosis was accomplished successfully either by amniocyte (two) or trophoblast (26) DNA analysis in 28 couples in which the pregnancy was in progress. These results indicate that direct identification of the mutation by oligonucleotide or restriction endonuclease analysis is a
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: TaqMan probe-based real-time PCR (qPCR/RT-qPCR) has been widely used in various fields because of its high sensitivity and specificity. However, TaqMan probes are associated with a relatively higher background signal, and hence negatively affect the detection results.
METHODS: Double-stranded probes (DSPs) were designed for the high sensitive detection of hepatitis B virus (HBV) DNA and severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) RNA using qPCR/RT-qPCR. Old DSPs (ODSPs) consist of different lengths of positive and negative strands with complementary oligonucleotid
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nonhuman primates, including African green monkey (AGM), are important models for biomedical research. The information on monkey genomes is still limited and no versatile gene expression screening tool is available. We tested human whole genome microarrays for cross-species reactivity with AGM transcripts using both long oligonucleotide arrays (60-mer probes) and short oligonucleotide arrays (25-mer). Using the long oligonucleotide arrays, we detected 4-fold more AGM transcripts than with the short oligonucleotide technology. The number of detected transcripts was comparable to that detected u
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To facilitate sequence-specific detection of DNA amplified in a diagnostic reverse transcription (RT)-PCR for Lassa virus, we developed an array featuring 47 oligonucleotide probes for post-PCR hybridization of the amplicons. The array procedure may be performed with low-tech equipment and does not take longer than agarose gel detection.
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This report describes a new technique for the detection and identification of Salmonella species in food with the use of fluorescent in situ hybridization (FISH) with 23S rRNA-targeted oligonucleotide probes. Two species-specific 23S rRNA-targeted oligonucleotide probes (Sal-1 and Sal-3) were selected, and one (Sal-544) was newly designed. The relative specificities of these probes were compared with those of bacterial 23S rRNA sequences from the GenBank database and tested by in situ hybridization with bacterial cell smears of pure cultures. Fifty-one tested reference strains of Salmonella se
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A novel liposome-based signal amplification system was developed by encapsulating DNA oligonucleotides within antibody-tagged liposomes and subsequently detecting the oligonucleotide with dye-encapsulating liposomes for double signal enhancement. In this sandwich immunoassay, the model analyte, protective antigen protein from B. anthracis, was captured by one set of antibodies immobilized in microtiter plate wells and detected using a second antibody conjugated to oligonucleotide-encapsulating liposomes. Bound liposomes were lysed releasing the encapsulated fluorescein-tagged DNA 25-mer probe,
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Expression of muscarinic receptor mRNA subtypes (m1-5) and nicotinic receptor subunits (alpha 2-4, and beta 2) was examined in the rat submandibular gland by in situ hybridization histochemistry, using oligonucleotide probes for the muscarinic receptor and RNA probes for the nicotinic receptors. m2, alpha 3, and beta 2 mRNA were strongly expressed in the submandibular ganglion, and m3, alpha 2, alpha 3, alpha 4, and beta 2 were expressed in the striated and interlobular duct cells. Both muscarinic and nicotinic receptors were coexpressed in the same ganglion neurons, while none of these mRNA w
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The IS6110 sequence was detected visually in sputum samples of tuberculosis patients using a bi-probe system. One of the probes was an oligonucleotide conjugated to colloidal gold particles, complementary to one end of the target strand. The other probe was an oligonucleotide conjugated to latex beads complementary to the other end of the target strand. In a reaction mix, these two probes bind to the target strand, and the latex beads are then separated by filtration. Bound latex beads have gold colloid particles at the other end of the target strand. These gold colloid particles were made vis
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this report, we present details of two rapid molecular detection techniques based on 16S and 23S rRNA sequence data to identify and differentiate Yersinia species from clinical and environmental sources. Near-full-length 16S rRNA gene (rDNA) sequences for three different Yersinia species and partial 23S rDNA sequences for three Y. pestis and three Y. pseudotuberculosis strains were determined. While 16S rDNA sequences of Y. pestis and Y. pseudotuberculosis were found to be identical, one base difference was identified within a highly variable region of 23S rDNA. The rDNA sequences were used
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A combination of Hybridization Chain Reaction (HCR) and Lateral Flow Immunoassay (LFIA) is an attractive strategy for a simple signal amplification DNA/RNA detection. The present study aimed to report a strategy used to solve a problem encountered when the target DNA contained folded secondary structure during HCR, enabling HCR hairpin probes to easily access the target site. The 24-nt conserved sequence within 3'-UTR, present only in dengue virus genome but not in other species, is an ideal target to use as a probe binding site for pan-dengue virus detection. Thus, the 105-nt target containin
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A oligonucleotide microchip was developed for revealing Influenza A viruses subtypes, circulating in human population: pandemic H1N1 swine influenza viruses, seasonal H1N1, H2N2, H3N2, H5N1, H9N2, H7N9. Typing of influenza virus was performed by on-microchip PCR. We used immobilized primers-probes selected for the neuraminidase gene that allows determining both subtype of neuraminidase and subtype of hemagglutinin.
Аннотация на английскомСтатьяПоиск полного текста в очередиОригинал на русском
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNAs of the human polyomaviruses BK virus (BKV) and JC virus (JCV) were amplified by the polymerase chain reaction (PCR) by using a single pair of 20-base oligonucleotide primers that were complementary to the same regions of both viruses. The sequences flanked by the primers were unique for each virus and could be differentiated by hybridization with 40-base, 32P-labeled oligonucleotide probes or by cleavage with BamHI. The DNA fragments resulting from amplification of BKV and JCV were 176 and 173 nucleotide pairs, respectively. The sensitivities of PCR for amplification of cloned BKV and JCV
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования