Background: Nanosilver possesses antiviral, antibacterial, anti-inflammatory, anti-angiogenesis, antiplatelet, and anticancer properties. The development of disinfectants, inactivated vaccines, and combined etiotropic and immunomodulation therapy against respiratory viral infections, including COVID-19, remains urgent. Aim: Our goal was to determine the SARS-CoV-2 molecular targets (genomic RNA and the structural virion proteins S and N) for silver-containing nanomaterials. Methods: SARS-CoV-2 gene cloning, purification of S2 and N recombinant proteins, viral RNA isolation from patients' blood
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Diagnostic systems based on reverse transcription (RT)-PCR are widely used for the detection of viral genomes in different human specimens. The application of internal controls (IC) to monitor each step of nucleic acid amplification is necessary to prevent false-negative results due to inhibition or human error. In this study, we designed various real-time RT-PCRs utilizing the coliphage MS2 replicase gene, which differ in detection format, amplicon size, and efficiency of amplification. These noncompetitive IC assays, using TaqMan, hybridization probe, or duplex scorpion probe techniques, wer
Оценочное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Messenger RNAs (mRNAs) were prepared from MCF-7 breast cancer cells grown in the presence of estradiol. Complementary DNAs (cDNAs) were inserted into pBR322 plasmid and a library of 4400 recombinant bacterial clones was prepared. The clones were screened by in situ differential hybridization with cDNAs prepared from RNAs of MCF-7 cells grown either in the presence or absence of estradiol. Several estrogen-induced or estrogen-repressed clones were identified. One of them corresponded to a relatively frequent mRNA (0.8% of recombinant plasmids) of 650 nucleotides. The concentration of this mRNA
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Treatment options for Staphylococcus aureus infections are increasingly limited, particularly in livestock, where S. aureus causes mastitis requiring prolonged antibiotic therapy. This study engineered Phage Inducible Chromosomal Islands (ePICIs) to deliver CRISPR-Cas9 modules targeting small RNA genes. ePICIs exhibit bactericidal activity without chromosomal integration, an expanded host range compared to their parental phages, and biofilm-dependent efficacy influenced by the extracellular matrix composition. Biofilms mediated by the Bap protein strongly protect bacteria from ePICIs, whereas
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The coat protein of the MS2 self-assembles into virus-like particles (VLPs) with a diameter of 26 nm. These VLPs are devoid of the phage genome yet are efficiently recognized by the immune system, eliciting robust humoral and cellular immune responses. The structural characteristics of VLPs position them as a promising platform for the development of vaccines and diagnostic tools. Through genetic engineering, antigenic peptides up to 91 amino acids in length can be densely displayed at the N-terminal β-hairpin (AB loop) of the coat protein. Moreover, the fusion of an exogenous sequence with th
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bacterial infections pose a challenge to human health and burden the health care system, especially with the spread of antibiotic-resistant populations. To provide effective treatment and improved prognosis, effective diagnostic methods are of great importance. Here we present phage-mediated molecular detection (PMMD) as a novel molecular method for the detection and assessment of bacterial antibiotic resistance. This technique consists of a brief incubation, of approximately ten minutes, of the biological sample with a natural bacteriophage (phage) targeting the bacteria of interest. This is
СтатьяПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Diagnosis is an important factor in controlling disease. Single-chain fragment variables (scFvs) can be used for diagnosis; however, due to their immobilization issues, their application has been limited. Herein, we isolated a SARS-CoV-2 nucleocapsid phosphoprotein (NP)-specific scFv and propose it as a diagnostic tool in the scFv-displaying phage format to overcome the immobilization issue.
METHOD: Spleen from NP-immunized BALB/c mice was isolated, total RNA was extracted, and cDNA was synthesized. An scFv library was constructed, using the splicing by overlap extension (SOE) PCR
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Retroviral infections are 'mini-symbiotic' events supplying recipient cells with sequences for viral replication, including the reverse transcriptase (RT) and ribonuclease H (RNase H). These proteins and other viral or cellular sequences can provide novel cellular functions including immune defense mechanisms. Their high error rate renders RT-RNases H drivers of evolutionary innovation. Integrated retroviruses and the related transposable elements (TEs) have existed for at least 150 million years, constitute up to 80% of eukaryotic genomes and are also present in prokaryotes. Endogenous retrov
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Filamentous phages are now the most widely used vehicles for phage display and provide efficient means for epitope identification. However, the peptides they display are not very immunogenic because they normally fail to present foreign epitopes at the very high densities required for efficient B-cell activation. Meanwhile, systems based on virus-like particles (VLPs) permit the engineered high-density display of specific epitopes but are incapable of peptide library display and affinity selection. We developed a new peptide display platform based on VLPs of the RNA bacteriophage MS2. It combi
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Since SARS-CoV-2 RNA in wastewater is often present at low concentration or under detection limit, ensuring the reliability of detection processes using appropriate process controls is essential. The objective of this study was to evaluate applicability and limitations of candidate surrogate viruses as process controls under combinations of different virus concentration and RNA extraction methods. Detection efficiency of SARS-CoV-2 spiked in wastewater was compared with those of candidate surrogate viruses of bacteriophage ϕ6, pepper mild mottle virus (PMMoV), F-specific coliphage (F-phage), a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We described earlier the isolation of lfl25 mutation reducing the frequency of lysogenization of mutant cells by phage lambda (LycA phenotype). The mutation is mapped at present in the rpoC gene coding for the beta' subunit of bacterial RNA polymerase and named rpoC90. It is dominant and causes decrease in pools of some branched amino acids, pyrimidines and thiamine (vitamin B1) in mutant cells. Combination of rpoC90 mutation with some Rif-r mutations strengthens both the LycA phenotype and deficiency in metabolites mentioned above. Such combination was shown to also cause a defect in antiterm
СтатьяПоиск полного текста в очередиОригинал на русском
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mixed-species biofilms formed by carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae and carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii can complicate the clinical management of device-associated infections; however, phage-based interventions targeting these communities remain insufficiently characterized. We assessed the antibiofilm activity of a lytic HZJ31 + HZY2308 phage cocktail against KPZ2-AB48 mixed-species biofilms. Compared with the corresponding single-species cultures, cocultures showed greater crystal violet-stained biomass, higher metabolic activity as measured by the 2,3-bis(2-methoxy-4-ni
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Clostridioides difficile is an important nosocomial pathogen that causes approximately 500,000 cases of C. difficile infection (CDI) and 29,000 deaths annually in the United States. Antibiotic use is a major risk factor for CDI because broad-spectrum antimicrobials disrupt the indigenous gut microbiota, decreasing colonization resistance against C. difficile Vancomycin is the standard of care for the treatment of CDI, likely contributing to the high recurrence rates due to the continued disruption of the gut microbiota. Thus, there is an urgent need for the development of novel therapeutics th
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RNA amplification with transcript sequencing (RAWTS) is a rapid and sensitive method of direct sequencing that involves complementary DNA synthesis, polymerase chain reaction (PCR) with a primer or primers containing a phage promoter, transcription from the phage promoter, and reverse transcriptase-mediated sequencing. By means of RAWTS, it was possible to sequence each of four tissue-specific human messenger RNAs (blue pigment, factor IX, phenylalanine hydroxylase, and tyrosine hydroxylase) in four cell types examined (white blood cells, liver, K562 erythroleukemia cells, and chorionic villus
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Bacteriophage has been renewed attention as a new antibacterial agent due to the limitations of antibiotic treatment. Bacteriophages are generally thought to be highly host specific and even strain specific, but a small number of polyvalent bacteriophages have been found to infect bacteria of different genera.
RESULTS: In this study, a virulent lytic bacteriophage (named Salmonella phage PSH-1) of Salmonella Enteritidis was isolated from the sewage samples of a large-scale pig farm, PSH-1 demonstrated lytic activity against four multidrug-resistant Salmonella Enteritidis isolates
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To construct a naive human Fab fragment phage display library, provide a platform for human antibody preparation and a new therapy for the malignant tumors.
METHODS: Peripheral blood lymphocytes were isolated from 200 ml blood, which was obtained from a healthy blood donor. The heavy chain Fd fragments and light chain cDNA synthesized from the total RNA of lymphocytes were amplified by PCR and the amplification products were ligated into the phagemid vector pComb3, then the ligated sample was transformed into competent E. coli XL1-Blue. The transformed cells were infected with VCSM
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To identify the candidate auto-antigen of rheumatic heart disease as a molecular marker for this disease.
METHODS: The total RNA of the heart tissue of patients with rheumatic heart disease was extracted and reverse-transcribed into long cDNA to construct the phage expression library. The library was screened using the serum from patients with active rheumatic fever, and the positive clone was identified and analyzed by bioinformatics and expressed in vitro. The expressed products were evaluated with Western blotting and its cross-reactivity was assessed.
RESULTS: The phage expres
Аннотация на английскомСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pseudomonas aeruginosa is a Gram-negative opportunistic pathogen, the leading cause of acute and chronic infections in immunocompromised patients, frequently with high morbidity and mortality rates. The xenobiotic response element (XRE) family proteins are the second most common transcriptional regulators (TRs) in P. aeruginosa. However, only a few XRE-like TRs have been reported to regulate multiple bacterial cellular processes, encompassing virulence, metabolism, antibiotic synthesis or resistance, stress responses, and phage infection, etc. Our understanding of what roles these XRE-like sma
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Trypanosoma brucei spp. cause African human and animal trypanosomiasis, a burden on health and economy in Africa. These hemoflagellates are distinguished by a kinetoplast nucleoid containing mitochondrial DNAs of two kinds: maxicircles encoding ribosomal RNAs (rRNAs) and proteins and minicircles bearing guide RNAs (gRNAs) for mRNA editing. All RNAs are produced by a phage-type RNA polymerase as 3' extended precursors, which undergo exonucleolytic trimming. Most pre-mRNAs proceed through 3' adenylation, uridine insertion/deletion editing, and 3' A/U-tailing. The rRNAs and gRNAs are 3' uridylate
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The cloning of large enterovirus RNA sequences is labor-intensive because of the frequent instability in bacteria of plasmidic vectors containing the corresponding cDNAs. In order to circumvent this issue we have developed a PCR-based method that allows the generation of highly modified or chimeric full-length enterovirus genomes. This method relies on fusion PCR which enables the concatenation of several overlapping cDNA amplicons produced separately. A T7 promoter sequence added upstream the fusion PCR products allows its transcription into infectious genomic RNAs directly in transfected cel
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.