Уникальные публикации PubMed, Europe PMC и Crossref, сохранённые в библиотеке. Одна статья учитывается один раз, даже если получена из нескольких источников. Личные исследования и документы команд не публикуются.
Идёт проверка счётчикаДоступно в поиске—
Публикации, уже подготовленные для быстрого поиска. Остальная библиотека подключается в фоне.
Переведено на русский—
Готовые переводы среди доступных в поиске публикаций. Автоматический медицинский перевод и проверка специалистом учитываются отдельно.
Полные тексты—
Найденные полные тексты среди доступных в поиске публикаций. Доступность определяется первоисточником и условиями использования.
Оригиналов на русском—
Русскоязычные оригиналы доступны без ожидания перевода. Ниже — языки остальных оригиналов; для них готовится медицинский перевод на русский.
Пополняем библиотеку по диагнозам—Проверяем состояние обновлений
Для каждого диагноза из справочника МКБ-10 ищем связанные публикации в научных базах и добавляем их в библиотеку. Числа ниже — диагнозы, а не статьи.
Если сбор прервался, тема требует повторной попытки. Уже сохранённые статьи остаются в библиотеке.
Нажмите на показатель для подробностей. Показатели поиска обновляются автоматически; размер всей библиотеки сверяется отдельно. Время последней проверки указано явно.
Результаты поиска
6295 публикаций
Поиск: 109 мс
Публикации на разных языках · PubMed, Europe PMC и данные издателей через Crossref · 650 с найденным полным текстом
Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)2026eng
Spatial transcriptomics has advanced our ability to study gene expression within the spatial context of tissues and single cells. Among the diverse methodologies available, in situ transcript detection offers subcellular spatial resolution by preserving the precise coordinates of RNA molecules. A widely used approach involves padlock probe (PLP) technology, which enables rolling circle amplification and fluorescent detection of individual transcripts. To address the limitations of conventional in situ methods in multiplexing, we recently developed the Combinatorial Dual-Color (CoDuCo) assay, e
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Autoantibody internalization has been implicated in autoimmune disease pathogenesis, yet its mechanisms, and generality across different diseases, cell types, and affected tissues remain poorly defined. Using bulk RNA sequencing, we identified reproducible, autoantibody-specific transcriptomic signatures consistent with autoantigen dysfunction in muscle biopsies from patients with anti-Mi2 dermatomyositis and anti-PM/Scl scleromyositis across independent cohorts. Electroporation of purified patient IgG into primary cultures of healthy cells was sufficient to induce the corresponding transcript
СтатьяПрепринтПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Autoantibody internalisation has been implicated in autoimmune disease pathogenesis, yet its mechanisms and generalisability across diseases, cell types, and tissues remain poorly defined. We sought to address these gaps.
METHODS: Bulk RNA sequencing was performed on 814 muscle biopsies from patients with autoimmune diseases and healthy controls, including an external validation cohort of 41 additional samples. Purified patient immunoglobulin (Ig) G was electroporated into primary human cells to assess functional effects in vitro. Immunofluorescence evaluated localisation of immun
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tumor microenvironments (TMEs) are compositionally and functionally heterogeneous, making it challenging to discover organizing structural principles. Through a study of 262 solid tumors profiled by spatial transcriptomics, we identify a conserved architecture where TMEs are partitioned into discrete, hierarchically organized multicellular sub-regions, which we term "spatial groups" (SGs). As indicated by orthogonal spatial measurements and expert pathologist review, SGs associate with recognizable biological domains spanning global tissue context to local cellular neighborhoods. Comparing tum
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spatial transcriptomics has revolutionized our understanding of tissue organization by simultaneously capturing gene expression and spatial localization within intact tissues. However, analyzing these increasingly complex datasets requires specialized expertise across computational biology, statistics, and biological context. To address this challenge, we introduce the Spatial Transcriptomics AI Agent (STAgent), an autonomous multimodal agentic AI that integrates multimodal large language models (LLMs) with specialized computational tools to transform weeks-long analysis tasks into minutes of
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The key advantage of spatial transcriptomics (ST) technologies lies in the spatial domain: these techniques not only offer an unprecedented opportunity to interrogate intact biological samples in a spatially informed manner, but also set the stage for integration with other imaging-based modalities. However, how to most effectively exploit spatial context and integrate ST with imaging-based modalities that capture morphological insight remains an open and heavily investigated question. To address this, particularly under real-world experimental constraints such as limited dataset size, class i
СтатьяПрепринтПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Spatial transcriptomics allows gene expression to be measured within complex tissue contexts. Among the array of spatial capture technologies available is 10x Genomics' Visium platform, a popular method which enables transcriptome-wide profiling of tissue sections. Visium offers a range of sample handling and library construction methods which introduces a need for benchmarking to compare data quality and assess how well the technology can recover expected tissue features and biological signatures.
RESULTS: Here we present SpatialBenchVisium, a unique reference dataset generated f
СтатьяDatasetПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Деятельность МИРНА варьируется в зависимости от различных популяций и систем клеток в рамках механизмов, которые проводят различие между типами клеток и ролью в живых организмах, а также в здоровье человека и болезнях. Как правило, регулирование miRNA стимулирует изменения в составе и уровнях белковой кодировки RNA и INCRNA, при этом целевые показатели регулируются понижательно, когда miRNA являются активными. Термин " деятельность МИРНК " используется для обозначения такого транскрипционного эффекта МИРНК. В этом исследовании предлагается метод miTEA-HiRes, призванный облегчить оцен
СтатьяПолный текст найденМашинный перевод · не проверен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A key hallmark of Parkinson's disease (PD) is Lewy pathology. Composed of α-synuclein, Lewy pathology is found both in dopaminergic neurons that modulate motor function, and cortical regions that control cognitive function. Recent work has established the molecular identity of dopaminergic neurons susceptible to death, but little is known about cortical neurons susceptible to Lewy pathology or molecular changes induced by aggregates. In the current study, we use spatial transcriptomics to capture whole transcriptome signatures from cortical neurons with α-synuclein pathology compared to neuron
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Psoriasis is a chronic inflammatory skin disease, thought to be predominantly mediated by TH17 cells. Significance of other inflammatory pathways and the innate immune system is not well understood and the spatial heterogeneity of inflammation in the skin has largely been overlooked. Our aim was to create a comprehensive map of skin inflammation in psoriasis, exploring the tissue patterning of inflammation. In situ whole transcriptome sequencing (spatial sequencing) was performed on lesional psoriatic skin in four patients with moderate-to-severe disease to quantify all expressed genes within
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Although complex inflammatory-like alterations are observed around the amyloid plaques of Alzheimer's disease (AD), little is known about the molecular changes and cellular interactions that characterize this response. We investigate here, in an AD mouse model, the transcriptional changes occurring in tissue domains in a 100-μm diameter around amyloid plaques using spatial transcriptomics. We demonstrate early alterations in a gene co-expression network enriched for myelin and oligodendrocyte genes (OLIGs), whereas a multicellular gene co-expression network of plaque-induced genes (PIGs) invol
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spatial omics has revolutionized molecular biology by providing invaluable insights into how native tissue microenvironments regulate cellular functions and disease mechanisms. Accurately capturing this structural complexity and decoding the underlying biological processes requires effectively integrating data from multiple modalities. However, transitioning to subcellular resolutions introduces massive data scales and severe transcriptomic sparsity, which challenge current analytical frameworks. To address this, we present HESTIA (Histology-Enhanced Scalable cross-Resolution inTegration for s
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To elucidate the regional distribution of metabolic dysfunction-associated steatohepatitis (MASH) fibrosis within the liver and to identify potential therapeutic targets for MASH fibrosis.
METHODS: Liver sections from healthy controls, patients with simple steatosis and MASH patients were analysed using spatial transcriptomics integrated with single-cell RNA-seq.
RESULTS: Spatial transcriptomics analysis of liver tissues revealed that the fibrotic region (Cluster 9) was primarily distributed in lobules, with some fibrosis also found in the surrounding area. Integration of the sing
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Integrating spatial transcriptomics, which maps gene expression location within tissues, with single-cell multi-omics data, profiling gene expression and chromatin accessibility (or other epigenomic data) for the same cell, offers powerful insights into gene regulation. However, commercially available kits for simultaneous spatial multi-omics profiling are currently unavailable, hindering widespread data generation. Here, we present ISON (Integrated Spatial Omics Network), a unified computational method for integrative spatial multi-omics analysis from single cell multiome data and spatial tra
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spatial transcriptomics (ST) data have emerged as a pivotal approach to comprehending the function and interplay of cells within intricate tissues. Nonetheless, analyses of ST data are restricted by the low spatial resolution and limited number of ribonucleic acid transcripts that can be detected with several popular ST techniques. In this study, we propose that both of the above issues can be significantly improved by introducing a deep graph co-embedding framework. First, we establish a self-supervised, co-graph convolution network-based deep learning model termed SpatialcoGCN, which leverag
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MOTIVATION: The recent spatial transcriptomics (ST) technologies have enabled characterization of gene expression patterns and spatial information, advancing our understanding of cell lineages within diseased tissues. Several analytical approaches have been proposed for ST data, but effectively utilizing spatial information to unveil the shared variation with gene expression remains a challenge.
RESULTS: We introduce STew, a Spatial Transcriptomic multi-viEW representation learning method, to jointly analyze spatial information and gene expression in a scalable manner, followed by a data-driv
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Atopic dermatitis (AD), the most common chronic inflammatory dermatosis, currently lacks definitive curative treatments. This study aimed to identify potential drug targets for AD through an integrative genomic approach.
MATERIAL AND METHODS: Cis-expression quantitative trait loci (cis-eQTL) from the eQTLGen consortium were used as genetic instruments for druggable genes. Summary-level AD statistics were obtained from the largest available GWAS dataset (cases = 22,474; controls = 774,187) with replication in an independent cohort (cases = 10,788; controls = 30,047). Mendelian ra
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alcohol misuse damages numerous organs, including the liver, heart, brain, and pancreas. The kidney remains a severely understudied target of alcohol-induced injury despite renal injury being commonly observed in end-stage alcohol-associated liver disease (ALD) patients. A 6-week murine ethanol (1-6% v/v) model for early-stage ALD combined with carbon tetrachloride (CCl4) treatment was utilized to reveal mechanisms of renal injury. This paradigm yields elevated kidney damage markers when compared to ethanol consumption alone, including elevated urinary KIM-1 in 3 weeks. Hypothesis generating t
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In brief: This review synthesizes the technical landscape of current spatial transcriptomic platforms, addresses computational challenges unique to ovarian tissue, and surveys biological discoveries across ovarian development, aging, follicle dynamics, and cancer, providing a practical framework to guide platform selection and analytical strategy in reproductive biology. Abstract: The ovary is a structurally complex organ whose function depends on precisely coordinated interactions among multiple cell types. Spatially resolved transcriptomics (ST) has emerged as a powerful complement to single
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Mexican axolotl (Ambystoma mexicanum) is an established model for studying tetrapod regeneration and development. Notably, axolotls exhibit remarkable brain regeneration as adults, a trait rarely observed in other adult vertebrates. Adult axolotls can undergo metamorphosis, a process that induces dramatic remodeling of multiple organs and is accompanied by a gradual decline in regenerative capacity and lifespan. However, systematic studies on whole-brain cellular dynamics and molecular mechanisms in both adult and metamorphosed individuals remain lacking. Here, we profiled five representat
СтатьяDatasetПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.