Although the ERCC2 gene rs13181 polymorphism is involved in the pancreatic cancer pathogenic mechanism, there is no consistent finding. This meta-analysis aimed to determine the association between ERCC2 rs13181 polymorphism and pancreatic cancer. Related articles were searched against the PubMed database in a retrospective way. Additionally, the combined odds ratios (ORs) and the corresponding 95% confidence intervals (CIs) were calculated using the random- or fixed-effects model. Altogether, seven articles regarding ERCC2 gene rs13181 polymorphism were enrolled. The combined ORs regarding th
СтатьяМетаанализПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cutaneous melanoma (CM) is a malignant skin cancer with the high incidence in whiteskinned populations. Host genetic factors (such as: genes in nucleotide excision repair system or cell proliferation regulation system) interacted with ultraviolet radiation are potential reasons for CM. Previous studies about associations between CM and the rs4444903 (+61A>G) in the Epidermal growth factor gene (EGF) or rs13181 (+35931 A>C) in the xeroderma pigmentosum group D gene (XPD) have produced inconsistent results. To clarify these associations, metaanalyses of available candidate case-control associati
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA repair has been shown to affect the cellular response to platinum-based therapy in a variety of cancers; however, translating this knowledge to the clinic has proven difficult and yielded mixed results. In this issue of Cancer Discovery, Van Allen and colleagues have analyzed responders and nonresponders to neoadjuvant platinum-based therapy with locally advanced urothelial cancer and identified a series of mutations in the nucleotide excision repair (NER) gene ERCC2 that correlate with the response to platinum-based therapy. This work provides evidence that defects in NER can be exploited
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаКомментарийПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The association between excision repair cross complementing group 2 (ERCC2) Asp312Asn polymorphism and lung cancer has been reported by many articles recently, but the results were controversial and inconclusive. Therefore, a meta-analysis was conducted to assess the relationship between them. Pooled odds ratios (ORs) with 95% confidence intervals (CIs) were used to assess the strength of association. A total of 22 full studies with 20,101 subjects (8719 cases and 11,382 controls) were included in our research. The meta-analysis result showed that no significant association was found between E
СтатьяМетаанализПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Using DNA-modified electrodes, we show DNA-mediated signaling by XPD, a helicase that contains a [4Fe-4S] cluster and is critical for nucleotide excision repair and transcription. The DNA-mediated redox signal resembles that of base excision repair proteins, with a DNA-bound redox potential of ~80 mV versus NHE. Significantly, this signal increases with ATP hydrolysis. Moreover, the redox signal is substrate-dependent, reports on the DNA conformational changes associated with enzymatic function, and may reflect a general biological role for DNA charge transport.
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To derive a more precise estimation of the relationship between the excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, group 2 (ERCC2) Lys751Gln polymorphism and lung cancer risk, a meta-analysis was performed. A total of 23 studies including 8137 cases and 9824 controls were involved in this meta-analysis. Overall, significantly elevated lung cancer risk was associated with ERCC2 Gln allele when all studies were pooled into the meta-analysis (Lys/Gln versus Lys/Lys: odds ratio (OR)=1.10, 95% confidence interval (CI)=1.03-1.19; Gln/Gln versus Lys/Lys: OR=1.20, 95% CI=1.06-1.35; domi
СтатьяМетаанализОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To determine the contribution of a human DNA repair gene, ERCC2 (XPD), to mutagenesis in human cells, two ERCC2 (XPD)-transformed xeroderma pigmentosum complementation group D (XPD) cell lines with increased UV survival compared to XP6BE(SV40), the original XPD line, were studied: D6BE-ER2-2 with slightly increased UV survival; and D6BE-ER2-9 with normal UV survival. ERCC2 (XPD) antibody-reactive protein levels were elevated 4.8-fold in D6BE-ER2-2 and 17.6-fold in D6BE-ER2-9 relative to XP6BE(SV40). DNA repair ability was assessed by measuring the ability of the cells to restore expression to
СтатьяПоддержка правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: The fluorinated benzothiazole analogue 2-(4-amino-3-methylphenyl)-5-fluorobenzothiazole (5F 203, NSC 703786) exhibits selective and potent anticancer activity, and its lysylamide prodrug (Phortress, NSC 710305) recently entered Phase I clinical trials in the United Kingdom. Only cancer cells sensitive to the anti-proliferative effects of 5F 203 deplete this drug candidate from nutrient media. 5F 203 induces cell cycle arrest, cytochrome P450 1A1 (CYP 1A1) mRNA and protein expression, and is metabolized into reactive electrophilic species that can covalently bind to DNA and form adduct
СтатьяResearch Support, N.I.H., IntramuralПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Аннотация не предоставлена источником. Откройте карточку для перехода к публикации.
СтатьяНаблюдательное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Nucleotide excision repair (NER) pathway is an evolutionarily conserved mechanism of genome maintenance. It detects and repairs distortions in DNA double helix. Xeroderma Pigmentosum group B (XPB) and group D (XPD) are important helicases in NER and are also critical subunits of TFIIH complex. We have studied XPB and XPD for the first time from the basal metazoan Hydra which exhibits lack of organismal senescence.
METHODS: In silico analysis of proteins was performed using MEGA 6.0, Clustal Omega, Swiss Model, etc. Gene expression was studied by in situ hybridization and qRT-PCR.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chl1 is a member of the XPD family of 5'-3' DNA helicases, which perform a variety of roles in genome maintenance and transmission. They possess a variety of unique structural features, including the presence of a highly variable, partially-ordered insertion in the helicase domain 1. Chl1 has been shown to be required for chromosome segregation in yeast due to its role in the formation of persistent chromosome cohesion during S-phase. Here we present structural and biochemical data to show that Chl1 has the same overall domain organisation as other members of the XPD family, but with some conf
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Helicases are motor proteins that play a central role in the metabolism of DNA and RNA in biological cells. Using the energy of ATP molecules, they are able to translocate along the nucleic acids and unwind their duplex structure. They have been extensively characterized in the past and grouped into superfamilies based on structural similarities and sequential motifs. However, their functional aspects and the mechanism of their operation are not yet well understood. Here, we consider three helicases from the major superfamily 2--Hef, Hel308 and XPD--and study their conformational dynamics by u
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Xeroderma pigmentosum factor D (XPD) is a 5'-3' superfamily 2 helicase and the founding member of a family of DNA helicases with iron-sulphur cluster domains. As a component of transcription factor II H (TFIIH), XPD is involved in DNA unwinding during nucleotide excision repair (NER). Archaeal XPD is closely related in sequence to the eukaryal enzyme and the crystal structure of the archaeal enzyme has provided a molecular understanding of mutations causing xeroderma pigmentosum and trichothiodystrophy in humans. Consistent with a role in NER, we show that archaeal XPD can initiate unwinding f
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Аннотация не предоставлена источником. Откройте карточку для перехода к публикации.
Редакционная статьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES AND AIMS: The combination of genetic and environmental factors may contribute to the carcinogenesis of HNC. Despite the reported associations between xeroderma pigmentosum group D (XPD) polymorphisms and HNC, the results have been inconsistent, with different studies reporting varying results. Therefore, our aim is to assess the association of three XPD polymorphisms (rs13181, rs1799793, and rs238406) in a comprehensive meta-analysis.
MATERIALS AND METHODS: An exhaustive literature review was performed across several databases, including PubMed, Web of Science, Scopus, and Cochrane
СтатьяСистематический обзорNetwork Meta-AnalysisПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Trichothiodystrophy 1 (TTD1) is a rare, autosomal recessive, multisystem disorder characterized by the sulfur-deficient brittle hair, cutaneous photosensitivity, high risk of skin cancer, psychomotor retardation. TTD1 is caused by homozygous or compound heterozygous mutation in ERCC2 gene. The peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) from a patient carrying two heterozygous missense mutations of the ERCC2 gene were reprogrammed using the CytoTune-iPS2.0 Sendai Reprogramming Kit. The putative compound heterozygous mutation in ERCC2 will cause the abnormal protein, which is known to associated
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The helicase XPD is known as a key subunit of the DNA repair/transcription factor TFIIH. However, here, we report that XPD, independently to other TFIIH subunits, can localize with the motor kinesin Eg5 to mitotic spindles and the midbodies of human cells. The XPD/Eg5 partnership is promoted upon phosphorylation of Eg5/T926 by the kinase CDK1, and conversely, it is reduced once Eg5/S1033 is phosphorylated by NEK6, a mitotic kinase that also targets XPD at T425. The phosphorylation of XPD does not affect its DNA repair and transcription functions, but it is required for Eg5 localization, checkp
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To explore the function of ERCC2/XPD in the repair of DNA damage induced by UVC.
METHODS: Chinese hamster ovary (CHO) cell line including AA8 (wild-type) and UV5 (mutant type, ERCC2/XPD defective), was selected as a cell control model. The cell inhibition rate of AA8 and UV5 after UVC treatment was estimated by MTT assay, and DNA repair capacity to difference irradiation intensity of UVC in cells after 1 h, 3 h, 6 h, 24 h incubation were measured by the Comet Assay and Rad51 immunofluorescence test.
RESULTS: As compared to AA8, UV5 was more sensitive to UVC, and whose cell viabili
Аннотация на английскомСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Xeroderma pigmentosum group D (XPD) rs13181 may reduce DNA repair capacity (DRC) through modifying XPD protein product. Reduced DRC is reportedly related to an increase in the risk of lung cancer. To precisely estimate the association between XPD rs13181 and lung cancer risk, we carried out the current meta-analysis. We searched multiple databases (up to 31 October 2013) for studies investigating the association of XPD rs13181 and lung cancer. Odds ratio (OR) was estimated with the fixed effect model to assess the association. Heterogeneity between studies was measured using Q test. Subgroup a
СтатьяМетаанализПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Nucleotide excision repair is a versatile DNA repair reaction that removes bulky adducts generated by environmental mutagens such as the UV spectrum of sunlight or chemical carcinogens. Current multistep models of this excision repair pathway accommodate its broad substrate repertoire but fail to explain the stringent selectivity toward damaged nucleotides among excess native DNA. To understand the mechanism of bulky lesion recognition, we postulated that it is necessary to analyze the function of xeroderma pigmentosum group D (XPD) protein beyond its well-known role in the unwindi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.