The RET proto-oncogene is often activated through somatic rearrangements in papillary thyroid carcinomas (PTCs). Three main rearranged forms of RET have been described: RET/PTC1 and RET/PTC3, which arise from a paracentric inversion and RET/PTC2, which originates from a 10 : 17 translocation. We previously developed a dual-color FISH test to detect these RET rearrangements in interphase nuclei of thyroid lesions. This approach allowed us to detect a novel translocation involving the RET region, which was not detectable by RT - PCR with specific primers for known rearrangements. A combination o
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Solitary fibrous tumors (SFTs) harbor recurrent NAB2-STAT6 gene fusions, promoting constitutional up-regulation of oncogenic early growth response 1 (EGR1)-dependent gene expression. SFTs with the most common canonical NAB2 exon 4-STAT6 exon 2 fusion variant are often located in the thorax (pleuropulmonary) and are less cellular with abundant collagen. In contrast, SFTs with NAB2 exon 6-STAT6 exon 16/17 fusion variants typically display a cellular round to ovoid cell morphology and are often located in the deep soft tissue of the retroperitoneum and intra-abdominal pelvic region or in the meni
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A t(17;19) chromosomal translocation in early B-lineage acute leukemia was shown to result in chimeric transcripts that contain sequences from the E2A basic helix-loop-helix transcription factor gene on chromosome 19, fused to sequences from a previously unidentified gene (HLF) on chromosome 17 that encodes a hepatic leukemia factor. The chimeric protein consisted of the amino-terminal transactivation domain of E2A linked to the carboxyl-terminal basic region-leucine zipper domain of HLF. HLF was normally expressed in liver and kidney, but not in lymphoid cells, and was found to be closely rel
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spindle cell/sclerosing rhabdomyosarcoma (SRMS) comprises a heterogeneous group of tumors characterized by distinct molecular alterations and clinical behaviors. Among them, ZFP64::NCOA3 fusion-positive SRMS represents an extremely rare subtype, and its biological characteristics remain poorly understood because of the lack of representative experimental models. In this study, we established a patient-derived organoid (PDO) line, designated OICI-RMS-1275, together with organoid-derived xenograft (ODX) models from a previously reported case of ZFP64::NCOA3 fusion-positive SRMS using a modified
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To investigate a novel suicide gene for nasopharyngeal carcinoma (NPC) therapy, the yCDglyTK gene was constructed by fusing yeast cytosine deaminase (CD) and herpes simplex type 1 thymidine kinase. The expression of the yCDglyTK gene was detected by RT-PCR and Western blotting, and its bioactivity was demonstrated by an MTT (3-(4,5-dimethylthiazol-2-yl)-2,5-diphenyl tetrazolium bromide) assay. An animal study was carried out in which BALB/C nude mice bearing yCDglyTK gene-modified tumors were treated with prodrugs and radiation. Our results revealed that the yCDglyTK gene could be expressed in
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chromosome changes are one of the hallmarks of human malignancies. Chromosomal rearrangement is frequent in human cancers. One of the consequences of chromosomal rearrangement is gene fusions in the cancer genome. We have previously identified a panel of fusion genes in aggressive prostate cancers. In this study, we showed that 6 of these fusion genes are present in 7 different types of human malignancies with variable frequencies. Among them, the CCNH-C5orf30 and TRMT11-GRIK2 gene fusions were found in breast cancer, colon cancer, non-small cell lung cancer, esophageal adenocarcinoma, gliobla
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
T-cell acute lymphoblastic leukemia (T-ALL) is not as frequently reported as the B-cell counterpart (B-ALL), only occurring in about 15% of pediatric cases with a typically heterogeneous etiology. Approximately 8% of childhood T-ALL cases have rearrangements involving the ABL1 tyrosine kinase gene at 9q34.12; although a t(9;22), resulting in a fusion of ABL1 with the BCR gene at 22q11.23 is a common occurrence in B-ALL, it is not a typical finding in T-ALL. A subset of 10 of 40 documented cases of T-ALL analyzed over a 5-year period is presented, each having gene rearrangements within band 9q3
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Norcoclaurine synthase (NCS) catalyzes the enantioselective Pictet-Spengler condensation of dopamine and 4-hydroxyphenylacetaldehyde as the first step in benzylisoquinoline alkaloid (BIA) biosynthesis. NCS orthologs in available transcriptome databases were screened for variants that might improve the low yield of BIAs in engineered microorganisms. Databases for 21 BIA-producing species from four plant families yielded 33 assembled contigs with homology to characterized NCS genes. Predicted translation products generated from nine contigs consisted of two to five sequential repeats, each conta
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Endometrial stromal tumors are divided into three types: benign stromal nodules, endometrial stromal sarcomas, and undifferentiated endometrial sarcomas. A variety of cytogenetic abnormalities involving chromosome 7 have been reported in endometrial stromal sarcomas, including a recurrent t(7;17)(p15;q21). We have identified two zinc finger genes, which we have termed JAZF1 and JJAZ1, at the sites of the 7p15 and 17q21 breakpoints. Analyses of tumor RNA indicate that a JAZF1/JJAZ1 fusion is present in all types of endometrial stromal tumors; however, the fusion appears to be rarer among endome
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The expression of many of the known virulence determinants of Bordetella pertussis is coordinately regulated by the vir regulatory locus and reduced in response to environmental signals called modulators. We have previously identified eight TnphoA gene fusions in B. pertussis in which the expression of alkaline phosphatase was maximal in the absence of the modulators nicotinic acid and MgSO4. We have termed the genes identified by these fusions vir-activated genes. Here we report the characterization of these TnphoA mutant strains. Four fusion strains were defective in known virulence determin
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This report describes two unique gonadal serous carcinomas, one low-grade serous carcinoma (LGSC) of the ovary and one serous carcinoma of the scrotum each harboring novel PAK gene fusions. The first patient with ovarian LGSC was identified to have a PTPRM::PAK1 fusion, identifying PTPRM as a novel fusion partner for PAK1. The second patient with high-grade papillary serous carcinoma of the scrotum contained a DLG1::PAK2 fusion. Neither fusion was detected by DNA next-generation sequencing (NGS), highlighting the importance of RNA-based methodologies in identifying gene fusions. Overexpression
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Acute myeloid leukemia (AML) is a clonal malignant disorder of the bone marrow. Genetic aberrations have an unequivocal role in disease pathogenesis. With the application of next-generation sequencing technologies (NGS), an enormous number of genetic fusions and variants has been detected. Their co-occurrence has an impact on patient`s prognosis. Therefore, our aim in this study was to survey fusion genes as well as their relation with genetic variants.
SUBJECTS AND METHODS: Targeted sequencing of the following fusion genes, in bone marrow aspirate samples, was performed; MECOM, M
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The biological and clinical relevance of gene fusions in melanoma is unknown. Reports and preclinical data have suggested that tumor cells with specific rearrangements such as RAF1 gene fusions could be therapeutically targeted. To investigate the relevance of targeted therapy in patients with melanoma harboring RAF1 gene fusions, we reviewed records of 1268 melanoma patients with targeted sequencing data at the Dana-Farber Cancer Institute. We identified 9 cases and report here on their clinicopathologic characteristics. We describe the favorable outcome of 2 patients who received MEK inhibit
СтатьяКлинический случайПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Fusion genes are major drivers of acute leukemia. Conventional diagnostics are limited in detecting the diverse fusions included in recently updated acute leukemia classifications. We evaluated the fusion detection performance of RNA sequencing (RNA-seq) compared with that of conventional diagnostics in patients with acute leukemia.
METHODS: We retrospectively obtained the data of 101 patients with acute leukemia who underwent conventional diagnostics (i.e., karyotyping, FISH, or multiplex reverse transcription PCR) at diagnosis at Samsung Medical Center, Seoul, Korea, between Sep
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Acute lymphoblastic leukemia (ALL) is a common cancer affecting children worldwide. The development of ALL is driven by several genes, some of which can be targeted for treatment by inhibiting gene fusions. PAX5 is frequently mutated in ALL and is involved in chromosomal rearrangements and translocations. Mutations in PAX5 interact with other genes, such as ETV6 and FOXP1, which influence B-cell development. PAX5/ETV6 has been observed in both B-ALL patients and a mouse model. The interaction between PAX5 and FOXP1 negatively suppresses the Pax5 gene in B-ALL patients. Additionally, ELN and PM
ОбзорСтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND/AIM: Chondroid syringoma is a rare benign tumor emanating from sweat glands. Although rearrangements of the pleomorphic adenoma gene 1 (PLAG1) have been reported in such tumors, information on PLAG1 fusion genes is very limited.
MATERIALS AND METHODS: Cytogenetic, fluorescence in situ hybridization, RNA sequencing, array comparative genomic hybridization, reverse transcription polymerase chain reaction, and Sanger sequencing analyses were performed on two chondroid syringoma cases.
RESULTS: Both tumors had structural rearrangements of chromosome 8. An NDRG1-PLAG1 transcript was fo
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Аннотация не предоставлена источником. Откройте карточку для перехода к публикации.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The desirable features for a screening assay to detect antibacterial antibiotics include 1) high specificity for the desired antibiotic type 2) high sensitivity 3) lack of interference by other compounds likely to be associated with the antibiotic of interest and 4) ease of operation to allow a large number of samples to be tested. These characteristics are largely found in screens employing strains carrying fusions between antibiotic induced promoters and the structural genes for Escherichia coli beta-galactosidase. Screens were designed based upon fusions with three antibiotic induced promot
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Аннотация не предоставлена источником. Откройте карточку для перехода к публикации.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A subset of renal cell carcinomas harbor gene fusions, and we report the first case of an EZR-ROS1 fusion in renal cell carcinoma. A 47-year-old female presented with hematuria and a mass involving the renal pelvis. Renal biopsy revealed a tumor with solid and tubular architecture that was diffusely positive for PAX8, CK7, and vimentin; retained expression of INI1; focally positive for P504S; and negative for GATA3 and TFE3. Partial nephrectomy was performed, and histologically, the tumor had solid and tubular architecture with mucin-like content within tubules. The nuclei corresponded to WHO/
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования