Уникальные публикации PubMed, Europe PMC и Crossref, сохранённые в библиотеке. Одна статья учитывается один раз, даже если получена из нескольких источников. Личные исследования и документы команд не публикуются.
Идёт проверка счётчикаДоступно в поиске—
Публикации, уже подготовленные для быстрого поиска. Остальная библиотека подключается в фоне.
Переведено на русский—
Готовые переводы среди доступных в поиске публикаций. Автоматический медицинский перевод и проверка специалистом учитываются отдельно.
Полные тексты—
Найденные полные тексты среди доступных в поиске публикаций. Доступность определяется первоисточником и условиями использования.
Оригиналов на русском—
Русскоязычные оригиналы доступны без ожидания перевода. Ниже — языки остальных оригиналов; для них готовится медицинский перевод на русский.
Пополняем библиотеку по диагнозам—Проверяем состояние обновлений
Для каждого диагноза из справочника МКБ-10 ищем связанные публикации в научных базах и добавляем их в библиотеку. Числа ниже — диагнозы, а не статьи.
Если сбор прервался, тема требует повторной попытки. Уже сохранённые статьи остаются в библиотеке.
Нажмите на показатель для подробностей. Показатели поиска обновляются автоматически; размер всей библиотеки сверяется отдельно. Время последней проверки указано явно.
Результаты поиска
4179 публикаций
Поиск: 499 мс
Публикации на разных языках · PubMed, Europe PMC и данные издателей через Crossref · 1005 с найденным полным текстом
BACKGROUND: RNA sequencing of whole blood has been increasingly employed to find transcriptomic signatures of disease states. These studies traditionally utilize short-read sequencing of cDNA, missing important aspects of RNA expression such as differential isoform abundance and poly(A) tail length variation.
METHODS: We used Oxford Nanopore Technologies sequencing to sequence native mRNA extracted from whole blood from 12 patients with definite bacterial and viral sepsis and compared with results from matching Illumina short-read cDNA sequencing data. Additionally, we explored poly(A) tail l
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Monocytes are an important cell type in chronic periodontitis (CP) by interacting with oral bacteria and mediating host immune response. The aim of this study was to reveal new functional genes and pathways for CP at monocyte transcriptomic level.
METHODS: We performed an RNA-sequencing (RNA-seq) study of peripheral blood monocytes (PBMs) in 5 non-smoking moderate to severe CP (case) individuals vs. 5 controls. We took advantage of a microarray study of periodontitis to support our findings. We also performed pathway-based analysis on the identified differentially expressed (DEx)
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Vaccine-induced transcriptional responses have been extensively characterized at the gene level, but whether vaccination also alters transcript isoform usage remains largely unexplored. Here, we reanalyzed longitudinal whole-blood RNA-seq data from a discovery cohort of mRNA COVID-19 vaccine recipients using the IsoformSwitchAnalyzeR framework and validated the findings in an independent cohort. Key findings were validated by full-length RNA long-read sequencing and extended to four additional vaccine cohorts covering distinct platforms and pathogens. mRNA vaccination induced a rapid and trans
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Understanding the role of transcript isoforms is essential for elucidating disease mechanisms. TDP-43 regulates RNA splicing, and its dysfunction in neurons is a hallmark of some neurodegenerative diseases, including amyotrophic lateral sclerosis (ALS) and frontotemporal degeneration (FTD). While an association between TDP-43-dependent cryptic exons and disease pathogenesis has been suggested, an approach to investigate how cryptic exons disrupt transcript isoforms has yet to be established. In this study, we developed IsoRefiner, a novel method for identifying full-length transcript structure
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The placenta is critical for fetal development and mediates effects of pregnancy complications on offspring metabolic health yet remains poorly characterized in genomic studies. Existing transcriptomic analyses rely on adult tissue reference annotations, overlooking developmentally important splicing diversity. Using largest-in-class long-read RNA-seq (n = 72), we create a comprehensive placental transcriptome reference identifying 37,661 high-confidence isoforms (14,985 previously unannotated) across 12,302 genes (2,759 previously unannotated). Contrary to characterizations of the placenta as
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DUX4 regulates the expression of genic and nongenic elements and modulates chromatin accessibility during zygotic genome activation in cleavage stage embryos. Its misexpression in skeletal muscle causes facioscapulohumeral dystrophy (FSHD). By leveraging full-length RNA isoform sequencing with short-read RNA sequencing of DUX4-inducible myoblasts, we elucidate an isoform-resolved transcriptome featuring numerous unannotated isoforms from known loci and novel intergenic loci. While DUX4 activates similar programs in early embryos and FSHD muscle, the isoform usage of known DUX4 targets is notab
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OPA1, a dynamin-related guanosine triphosphatase mutated in dominant optic atrophy, is required for the fusion of mitochondria. Proteolytic cleavage by the mitochondrial processing peptidase generates long isoforms from eight messenger RNA (mRNA) splice forms, whereas further cleavages at protease sites S1 and S2 generate short forms. Using OPA1-null cells, we developed a cellular system to study how individual OPA1 splice forms function in mitochondrial fusion. Only mRNA splice forms that generate a long isoform in addition to one or more short isoforms support substantial mitochondrial fusio
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gene expression profiling is widely used as a measure of the protein output of cells. However, it is becoming more evident that there are multiple layers of post-transcriptional gene regulation that greatly impact protein output (Battle et al., Science 347:664-667, 2014; Khan et al., Science 342:1100-1104, 2013; Vogel et al., Mol Syst Biol 6:400, 2010). Alternative splicing (AS) impacts the expression of protein coding genes in several ways. Firstly, AS increases exponentially the coding-capacity of genes generating multiple transcripts from the same genomic sequence. Secondly, alternatively s
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Long non-coding RNAs (lncRNAs) play crucial roles in gene regulation, but their full-length isoforms are often missed because of the limitations of poly(A)-based enrichment and short-read sequencing. Here, we aim to establish a comprehensive transcriptome profiling that captures both poly(A)+ and poly(A)- RNA isoforms using Oxford Nanopore Technologies (ONT) R10.4.1 flowcells. We establish an rRNA-depleted full-length transcriptome sequencing workflow (NanoncRNA-Seq), and use it together with Illumina NovaSeq to profile lncRNA isoforms in Saccharomyces cerevisiae under glucose and ethanol-asso
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Alternative mRNA splicing is a key mechanism for generating isoform diversity in eukaryotic cells. However, the extent of the splicing changes that occur during complex regulatory processes like neurodevelopment are still incompletely characterized.
RESULTS: We performed nanopore-based long-read RNA sequencing on differentiating human stem cell-derived retinal organoids to identify temporal patterns of isoform usage across developmental stages. We found that retinal organoids undergo dynamic shifts in isoform usage throughout differentiation, which were not necessarily accompanied
СтатьяПрепринтПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Parkinson's disease (PD) is a complex neurodegenerative disorder with diverse molecular signatures that extend beyond the central nervous system. Peripheral blood serves as a minimally invasive source of transcriptomic biomarkers reflecting systemic inflammation, mitochondrial dysfunction, lysosomal impairment, and disrupted RNA processing-key pathways involved in PD. Long-read RNA sequencing with Oxford Nanopore Technologies (ONT) offers unprecedented detail of full-length transcripts, alternative isoforms, and RNA modifications, enabling more accurate detection of disease-related transcripti
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
5-HT(2C) receptor (5HT(2C)R, serotonin-2C) RNA undergoes editing to produce several receptor variants, some with pharmacological differences. This investigation comprised two parts: the characterisation of 5-HT(2C)R RNA editing in a larger human control sample than previously examined, and a comparative study in subjects with schizophrenia. Secondary structure analysis of the putative edited region of the human 5-HT(2C)R gene predicted the existence of a double stranded (ds) RNA loop, essential for RNA editing in this receptor. RNA was then extracted from frontal cortex of five controls and fi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alternative splicing is a pervasive mechanism that expands the coding potential and functional complexity of the human genome. Dysregulated isoform usage alters gene functions and contributes broadly to human disease across developmental, neurodegenerative, and cancer settings. Technologies for characterizing splicing and isoforms have advanced rapidly, evolving from Sanger sequencing of individual cDNA clones to high-throughput next-generation sequencing of splice junctions, and more recently to long-read sequencing that resolves full-length transcripts at bulk, single-cell, and spatial resol
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
European archives of oto-rhino-laryngology : official journal of the European Federation of Oto-Rhino-Laryngological Societies (EUFOS) : affiliated with the German Society for Oto-Rhino-Laryngology - Head and Neck Surgery2009eng
Otosclerosis is a primary bone remodeling disorder of the human otic capsule and is associated with persistent measles virus infection. The human cellular receptor of measles virus is the membrane cofactor protein (MCP, CD46), which has 14 well-described splicing variants. Unique CD46 expression pattern of the otic capsule and the stapes footplate may determine the susceptibility for persistent measles virus infection. A total of 51 surgically removed ankylotic stapes footplates were analyzed by histopathological and molecular biological methods, respectively. Nucleic acids were extracted. Mea
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Epithelial splicing regulatory protein 1 (ESRP1) is a key regulator of epithelial-mesenchymal transition (EMT) and cancer progression, including in pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC). We show that ESRP1-mediated isoform switching of DNA methyltransferase 3B (DNMT3B) correlates with the metastatic potential of pancreatic cancer cells. The expression of DNMT3B splicing variants was closely linked to ESRP1 level. Ectopic expression of mesenchymal DNMT3B isoforms 3 and 7, lacking part of the methyltransferase catalytic domain, significantly enhanced lung metastasis and tumor growth, while epi
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The microtubule-associated protein tau regulates the dynamic stability of the neuronal cytoskeleton by interacting with microtubules. It is encoded by a single gene, but expressed in a variety of isoforms due to differential RNA splicing. Six isoforms can be found in the human central nervous system. These isoforms differ in their ability to promote the assembly of microtubules as well as in their capacity to stabilize existing microtubule structures. Furthermore, some of the isoforms of tau are specifically involved in the pathogenesis of neurodegenerative disorders. Thus, splicing of tau mig
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Zika virus (ZIKV), dengue virus, and several other orthoflaviviruses cause disease outbreaks in human and animal populations worldwide. The orthoflaviviral nonstructural protein 2A (NS2A) is critical for both viral replication and virion assembly. However, due to its small size, hydrophobicity, and the absence of structural information or protein-specific antibodies, we lack a clear understanding of how NS2A participates in these disparate processes. Here, using endogenously tagged NS2A-containing viral RNAs, we reveal that two NS2A isoforms are present during ZIKV infection, including both fu
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
ZCCHC10 (zinc finger CCHC-type containing 10) has been shown to play a tumor suppressive role in acute myeloid leukemia (AML), but the underlying mechanism is not clear. Many ZCCHC proteins are involved in RNA metabolism, such as synthesis, splicing and stability of RNA. To investigate the role of ZCCHC10 in RNA metabolism, we performed PacBio single-molecule long-read isoform sequencing (Iso-seq) and Illumina short-read RNA sequencing (RNA-seq) on ML-2 cells stably overexpressing ZCCHC10 (designated ML2T) and stably overexpressing an empty vector (designated ML2C). The Iso-seq data consists o
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Organellar transcriptomes are relatively under-studied systems, with data related to full-length transcripts and posttranscriptional modifications remaining sparse. Direct RNA sequencing presents the possibility of accessing a previously unavailable layer of information pertaining to transcriptomic data, as well as circumventing the biases introduced by second-generation RNA-seq platforms. Direct long-read ONT sequencing allows for the isoform analysis of full-length transcripts and the detection of posttranscriptional modifications. However, there are still relatively few projects
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human adenosine deaminase acting on RNA 1 (ADAR1) catalyzes adenosine-to-inosine deamination reactions on double-stranded RNA molecules to regulate cellular responses to endogenous and exogenous RNA. Defective ADAR1 editing leads to disorders such as Aicardi-Goutières syndrome, an autoinflammatory disease that manifests in the brain and skin, and dyschromatosis symmetrica hereditaria, a skin pigmentation disorder. Two ADAR1 protein isoforms, p150 (150 kDa) and p110 (110 kDa), are expressed and can edit RNA, but the contribution of each isoform to the editing landscape remains unclear, largely
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.