The SLFN14 endoribonuclease is a post-transcriptional regulator that targets the ribosome and its associated RNA substrates for codon-bias translational repression. SLFN14 nuclease activity is linked to antiviral defense and platelet function. Despite its prominent role in gene regulation, the molecular signals regulating SLFN14 substrate recognition and catalytic activation remain unclear. SLFN14 dysregulation is linked to human diseases, including ribosomopathies and inherited thrombocytopenia, thus underscoring the importance of establishing the signals coordinating its RNA processing activ
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Extracellular vesicles (EVs) constitute a key mode of intercellular communication that remodels the complex tumor immune microenvironment by delivering diverse bioactive cargoes between tumor and immune cells. Nucleic acid species, encompassing microRNAs (miRNAs), messenger RNA (mRNAs), and other RNA transcripts, are functionally potent EV cargoes whose selective packaging dictates downstream immune signaling output. This review describes the molecular mechanisms driving selective RNA sorting into EVs, emphasizing sequence-motif recognition and core RNA-binding proteins FMR1 and TRIM25, which
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Low temperatures are a major environmental stress that limits plant growth and development. Understanding the molecular mechanism of cold tolerance is therefore essential for improving crop performance through molecular breeding. In this study, we focused on CISP, a small, previously uncharacterized protein, specifically induced in barley roots under low temperature conditions, and investigated its potential role in cold tolerance. Heterologous expression of CISP in Escherichia coli enhanced late-phase bacterial growth at low temperatures compared with the wild-type strain. Similarly, overexpr
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Split crRNA and split activator/target strategies have enhanced and advanced CRISPR-based diagnostics (CRISPR/Dx) by requiring a conditional assembly of components. The split crRNA involves dividing the guide RNA (crRNA) itself into multiple inactive fragments that only reassemble to become functional crRNA upon binding to a specific target. The split activator/target involves dividing the target or activator substrate into two reconfigurable segments that trigger Cas activation only upon proper assembly. These evolved CRISPR/Dx systems have enabled: direct quantification of miRNA and ultrasho
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The SARS-CoV-2 nucleocapsid (N) protein plays a pivotal role in disrupting host cellular processes by interfering with G3BP1, a key stress granule protein involved in RNA binding and metabolic regulation. Using RNA immunoprecipitation coupled with nanopore sequencing, we found that the N protein significantly alters the RNA interactome of G3BP1, particularly reducing binding to transcripts involved in fatty acid metabolism, such as ACOT12, PLIN4, GPX1, and ACADS. This disruption leads to dysregulation of lipid homeostasis and stress granule assembly, suggesting a strategy of the virus to repro
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Protein misfolding is a major factor of neurodegenerative diseases. Post-mitotic neurons are highly susceptible to protein aggregates that are not diluted by mitosis. Therefore, post-mitotic cells may have a specific protein quality control system. Here, we show that LONRF2 is a bona fide protein quality control ubiquitin ligase induced in post-mitotic senescent cells. Under unperturbed conditions, LONRF2 is predominantly expressed in neurons. LONRF2 binds and ubiquitylates abnormally structured TDP-43 and hnRNP M1 and artificially misfolded proteins. Lonrf2-/- mice exhibit age-dependent TDP-4
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Circular RNAs (circRNAs) represent a novel class of non-coding RNAs formed by a covalently closed loop and play crucial roles in many biological processes. Several circRNAs associated with myogenesis have been reported. However, the dynamic expression, function, and mechanism of circRNAs during myogenesis and skeletal muscle development are largely unknown.
METHODS: Strand-specific RNA-sequencing (RNA-seq) and microarray datasets were used to profile the dynamic circRNAome landscape during skeletal muscle development and myogenic differentiation. Bioinformatics analyses were used
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Folding intermediates mediate both protein folding and the misfolding and aggregation observed in human diseases, including amyotrophic lateral sclerosis (ALS), and are prime targets for therapeutic interventions. In this study, we identified the core nucleus of structure for a folding intermediate in the second RNA recognition motif (RRM2) of the ALS-linked RNA-binding protein, TDP-43 (TAR DNA-binding protein-43), using a combination of experimental and computational approaches. Urea equilibrium unfolding studies revealed that the RRM2 intermediate state consists of collapsed residual seconda
СтатьяПоддержка правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Viral infection is one of the conditions that induce stress granule (SG) formation, a cellular defense mechanism that exerts antiviral effects. To counteract this host response, viruses have evolved a broad spectrum of strategies to inhibit SG formation. However, the molecular mechanisms underlying SG inhibition remain poorly understood. The nucleocapsid proteins play a critical role in virus replication and host interaction. Here, using Semliki Forest Virus (SFV) as a model, we uncover the function of the alphavirus nucleocapsid in SG inhibition. This inhibitory function depends on oligomeriz
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chikungunya virus (CHIKV) is a re-emerging mosquito-transmitted RNA virus causing joint and muscle pain. To better understand how CHIKV rewires the host cell and usurps host cell functions, we generated a systematic CHIKV-human protein-protein interaction map and revealed several novel connections that will inform further mechanistic studies. One of these novel interactions, between the viral protein E1 and STIP1 homology and U-box containing protein 1 (STUB1), was found to mediate ubiquitination of E1 and degrade E1 through the proteasome. Capsid associated with G3BP1, G3BP2 and AAA+ ATPase
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Developing highly active, multivalent ligands as therapeutic agents is challenging because of delivery issues, limited cell permeability, and toxicity. Here, we report intrinsically cell-penetrating multivalent ligands that target the trinucleotide repeat DNA and RNA in myotonic dystrophy type 1 (DM1), interrupting the disease progression in two ways. The oligomeric ligands are designed based on the repetitive structure of the target with recognition moieties alternating with bisamidinium groove binders to provide an amphiphilic and polycationic structure, mimicking cell-penetrating peptides.
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RNA recognition motifs (RRMs) play a pivotal role in RNA metabolism and the regulation of gene expression. Owing to their plasticity and fuzziness, targeting RRM/RNA interfaces with small molecules is a daunting challenge for drug discovery campaigns. The U2AF2 splicing factor, which recognizes the polypyrimidine (polyPy) sequence of premature messenger (pre-m)RNA, exhibits a dynamic architecture consisting of two RRMs joined by a disordered linker. An inhibitor, NSC-194308, was shown to enhance the binding of pre-mRNA to U2AF2, selectively triggering cell death in leukemia cell lines containi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Japanese encephalitis virus (JEV) genome is a single-stranded, positive-sense RNA with non-coding regions (NCRs) of 95 and 585 bases at its 5' and 3' ends, respectively. These may bind to viral or host proteins important for viral replication. It has been shown previously that three proteins of 32, 35 and 50 kDa bind the 3' stem-loop (SL) structure of the JEV 3' NCR, and one of these was identified as 36 kDa Mov34 protein. Using electrophoretic mobility-shift and UV cross-linking assays, as well as a yeast three-hybrid system, it was shown here that La protein binds to the 3' SL of JEV. The bi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The etiology of the autoimmune disorder systemic lupus erythematosus (SLE) remains poorly understood. In neuropsychiatric SLE (NPSLE), autoimmune responses against neural self-antigens find expression in neurological and cognitive alterations. SLE autoantibodies often target nucleic acids, including RNAs and specifically RNA domains with higher-order structural content. We report that autoantibodies directed against neuronal regulatory brain cytoplasmic (BC) RNAs were generated in a subset of SLE patients. By contrast, anti-BC RNA autoantibodies (anti-BC abs) were not detected in sera from pat
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Argonaute (Ago) proteins play pivotal roles in nucleic acid targeting across eukaryotes and prokaryotes. While eukaryotic Ago (eAgo) proteins utilize RNA guides to cleave complementary RNA, prokaryotic Ago (pAgo) proteins often employ DNA guides for DNA targeting. This study focuses on the short pAgo system from Pleomorphomonas koreensis (Pko-SPARDA), which consists of a DUF4365-APAZ protein (PkoRE) and an Ago protein (PkoAgo). Upon RNA-guided target DNA recognition, Pko-SPARDA exhibits nonspecific cleavage activity toward ssDNA, dsDNA, and RNA, demonstrating potential for nucleic acid detecti
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Enterovirus 71 (EV-A71) is a major causative agent of severe hand, foot, and mouth disease (HFMD) in young children. However, the molecular interplay between EV-A71 and host factors, particularly how these interactions govern viral replication, remains incompletely understood. To systematically identify host factors involved in EV-A71 infection, we performed comprehensive identification of RNA-binding proteins (RBPs) by mass spectrometry (ChIRP-MS) during viral infection and identified 374 host proteins associated with the EV-A71 genomic RNA. Integrative analysis of existing datasets further r
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CRISPR-Cas systems use RNA-guided proteins for adaptive immunity through a mechanism whose origin is unknown. Here we report the discovery of Viral Interference Programmable Repeat (VIPR) systems consisting of a Vipr protein more ancient than CRISPR-Cas and vrRNAs comprising alternating GGY/NN motifs. Unlike canonical guide RNAs that base pair with nucleic acid targets using an uninterrupted sequence, vrRNAs recognize double-stranded DNA through a noncontiguous code in which the variable NNs of each repeat collectively specify a target that itself contains a gapped recognition sequence. Analys
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Crimean-Congo hemorrhagic fever virus (CCHFV) is a high-priority pathogen with high case-fatality rates, yet approved therapeutics remain unavailable. The CCHFV L segment encodes a ∼450-kDa RNA-dependent RNA polymerase (L protein) orchestrating viral replication, but its structural mechanisms remain elusive. Here, we present high-resolution cryo-EM structures of the CCHFV L protein in apo, 5' vRNA-bound, 5'/3' promoter-bound, and inhibitor-bound states. The catalytic core exhibits the canonical architecture of the Bunyavirales order, featuring conserved motifs and coordinated promoter recognit
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We explain environmental and genetic factors determining male genetic conditions and infertility and evaluate the significance of environmental stressors in shaping defensive responses, which is used in the diagnosis and treatment of male infertility. This is done through the impact of external and internal stressors and their instability on sperm parameters and their contribution to immunogenetic disorders and hazardous DNA mutations. As chemical compounds and physical factors play an important role in the induction of immunogenetic disorders and affect the activity of enzymatic and non-enzym
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Homoharringtonine (HHT) is widely used in combination regimens for acute myeloid leukemia (AML), yet its direct cellular targets remain undefined, limiting precision application. Here, we identified EWS RNA-binding protein 1 (EWSR1) as the primary target of HHT through chemical proteomics and biophysical validation. HHT bound the RNA recognition motif of EWSR1 with micromolar affinity, inducing an allosteric conformational switch that promoted oligomerization and liquid-liquid phase separation (LLPS). EWSR1 condensates selectively recruited the N6-methyladenosine (m6A) reader YTHDF2, forming c
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.