We describe the usefulness of a real-time polymerase chain reaction (PCR) assay for detection of the t(11;14)(q13;q32), most commonly present in mantle cell lymphoma (MCL). This assay is based on the 5'-->3' exonuclease activity of Taq polymerase, which cleaves an internal probe labeled with a reporter dye at its 5' end and a quencher dye at its 3' end during PCR. The real-time t(11;14) PCR assay was established using DNA from a case of MCL with the t(11;14), amplifiable using conventional PCR and primers specific for the major translocation cluster (MTC) region of the bcl-1 locus and the immu
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
One of the problems raised by the use of the attenuated oral poliovirus vaccine (OPV) Sabin strains is the genetic instability of the attenuated phenotype upon multiplication in vivo. Nucleotide sites critical for attenuation were identified for each of the three poliovirus serotypes. One important position lies in the 5' non-coding region of the genome of each of the three OPV strains, at nucleotide 480 in type 1, 481 in type 2 and 472 in type 3. Point mutations at these positions were usually selected upon multiplication in vivo as substitutions of the vaccine-type residue. The reversion was
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A multiplex real-time reverse transcriptase PCR has been developed for the rapid detection and identification of eight medically important flaviviruses from laboratory-reared, virus-infected mosquito pools. The method used involves the gene-specific amplification of yellow fever virus (YFV), Japanese encephalitis virus (JEV), West Nile virus (WNV), St. Louis encephalitis virus (SLEV), and dengue virus (DENV) serotypes 1 to 4 (DENV-1 to DENV-4, respectively) by use of the flavivirus consensus amplimers located at the RNA-dependent RNA polymerase domain of nonstructural protein 5. Virus-specific
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Highly precise diagnostics and forensic assays can be developed through a combination of evolutionary analysis and the exhaustive examination of genomic sequences. In Bacillus anthracis, whole-genome sequencing efforts revealed ca. 3,500 single-nucleotide polymorphisms (SNPs) among eight different strains and evolutionary analysis provides the identification of canonical SNPs. We have previously shown that SNPs are highly evolutionarily stable, and the clonal nature of B. anthracis makes them ideal signatures for subtyping this pathogen. Here we identified SNPs that define the lineage of B. an
СтатьяПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Specific bacteria are believed to play an important role in chronic periodontitis, yet the significance of their relative numbers in initiation and progress of the disease is still unclear. We report here the development of a sensitive, quantitative PCR technique for enumerating Actinobacillus actinomycetemcomitans (Aa), Porphyromonas gingivalis (Pg), Prevotella intermedia (Pi), Dialister pneumosintes (Dp) and Micromonas micros (Mm) as well as total eubacteria in subgingival plaque samples from subjects with periodontitis. Quantification was performed with specific 16S rRNA target sequences wi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Yellow fever virus quantitation is performed routinely by cultivation of virus containing samples using susceptible cells. Counting of the resulting plaques provides a marker for the number of infectious particles present in the sample. This assay usually takes up to 5 days before results are obtained and must be carried out under L2 or L3 laboratory conditions, depending on the yellow fever virus strain used. For clinical diagnosis of yellow fever virus infections the cell culture-based approach takes too long and is of limited practical relevance. Recently, due to its considerable sensitivit
Сравнительное исследованиеОценочное исследованиеСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) is a serious threat to global development. Rapid and accurate diagnosis is critical for containing the pandemic and treating patients in time. As the gold standard for SARS-CoV-2 diagnosis, the qualitative reverse transcription-PCR (RT-qPCR) test has long been criticized for its long detection time. In this study, we optimized the primers and probes targeting SARS-CoV-2 ORF1ab and N gene designed by the Chinese Center for Disease Control and Preventions (CDC) to increase their Tm values to meet the optimal elongation temperature of T
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Microorganisms dwell in diverse plant niches as non-axenic biotic components that are beneficial as well pathogenic for the host. They improve nutrients-uptake, stress tolerance, phytohormone synthesis, and strengthening the defense system through phyllosphere, rhizosphere, and endosphere. The negative consequences of the microbial communities are largely in the form of diseases characterized by certain symptoms such as gall, cankers, rots etc. Uncultivable and unspecified nature of different phytomicrobiomes communities is a challenge in the management of plant disease, a leading cause for th
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Characterization of mutations of the PKD1 gene has been limited by the fact that three-fourths of this gene at its 5' end is homologous to sequences of at least three other genes on the same chromosome. We have therefore developed a method of long reverse transcription PCR for selective amplification of the entire coding sequence of the PKD1 gene from its mRNA. A PCR primer specific to the sequence in the 3' unique region of the PKD1 gene was synthesized for use coupled with a primer binding to sequence in the homologous region at a distance of about 13.6 kb apart. The commercial availability
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this study, we developed a nucleic acid-sensing platform in which a simple, dry-reagent-based nucleic acid amplification assay is combined with a portable multiplex electrochemical genosensor. Preparation of an amplification reaction mix targeting multiple DNA regions of interest is greatly simplified because the lyophilized reagents need only be reconstituted with ultrapure water before the DNA sample is added. The presence of single or multiple target DNAs causes the corresponding single-stranded DNA (ssDNA) amplicons to be generated and tagged with a fluorescein label. The fluorescein-la
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mycoplasma genitalium is an established cause of male nongonococcal urethritis, in particular in cases with recurrent disease and in those negative for Chlamydia trachomatis. In women M. genitalium causes cervicitis and there is increasing evidence that it is causing pelvic inflammatory disease (PID). Nucleic acid amplification tests are currently the only available methods for detection, but no commercially available tests have been thoroughly evaluated. Here we describe a TaqMan-based PCR test for detection of the infection and a conventional PCR that serves as a confirmatory assay with the
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Starting in 1999, the West Nile virus (WNV) epidemic represents the largest outbreak of arboviral encephalitis ever recorded in the U.S. The effective means to determine an infection are detection of viral nucleic acid and/or viral specific immunoglobulin, IgM and/or IgG.
OBJECTIVE: To develop a highly sensitive and specific TaqMan RT-PCR assay for the detection and quantification of WNV RNA of lineage 1 and lineage 2.
STUDY DESIGN: A TaqMan RT-PCR primer-probe was designed to perfectly match target sequences of all sequenced WNV strains and isolates, which added a layer of prote
Оценочное исследованиеСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Porcine circovirus type 2 (PCV2) has been linked to several disease syndromes during the last decade. In this context, postweaning multisystemic wasting syndrome (PMWS) has emerged as a significant disease. As most pig herds are infected with PCV2, the determination of viral load in animals may be useful in discriminating between healthy and PMWS pigs. A TaqMan-based real-time PCR for quantitation of PCV2 in serum/plasma and tissue samples was established. A standard curve was created from serial dilutions of a plasmid encoding ORF2 (cap gene) of PCV2 and used to estimate the number of viral D
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chlamydia pneumoniae is an important respiratory pathogen recently associated with atherosclerosis and several other chronic diseases. Detection of C. pneumoniae is inconsistent, and standardized PCR assays are needed. Two real-time PCR assays specific for C. pneumoniae were developed by using the fluorescent dye-labeled TaqMan probe-based system. Oligonucleotide primers and probes were designed to target two variable domains of the ompA gene, VD2 and VD4. The limit of detection for each of the two PCR assays was 0.001 inclusion-forming unit. Thirty-nine C. pneumoniae isolates obtained from wi
Сравнительное исследованиеОценочное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human parvovirus B19 infections are common in the general population, and infection during pregnancy may cause hydrops fetalis and fetal death. To initiate adequate treatment, accurate laboratory diagnosis is essential. The most sensitive tests are nested PCR systems, but these assays provide semiquantitative results at best. A parvovirus B19 DNA assay was developed based on the real time TaqMan PCR. This method was calibrated on the basis of serial plasmid dilutions and tested with an international parvovirus B19 standard. The assay was capable of quantifying parvovirus B19 DNA from one to ab
Оценочное исследованиеСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Polymerase chain reaction (PCR) is a sensitive and rapid method for the diagnosis of canine Leishmania infection and can be performed on a variety of biological samples, including peripheral blood, lymph node, bone marrow and skin. Standard PCR requires electrophoretic analysis of the amplification products and is usually not suitable for quantification of the template DNA (unless competitor-based or other methods are developed), being of reduced usefulness when accurate monitoring of target DNA is required. Quantitative real-time PCR allows the continuous monitoring of the accumulation of PCR
Аннотация на английскомСтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Recently, polyomaviruses KI and WU were identified in the airways of patients with acute respiratory symptoms. The epidemiology and pathogenesis of these two viruses are not fully understood, and the development of molecular assays, such as Real Time PCR, was useful for examining their biology and role in different clinical syndromes. The evaluation of different target regions for the amplification of polyomaviruses KI and WU, comparing published primer/probe sets and sets designed in the laboratory is described and was used for testing 175 clinical specimens (84 stools and 91 tonsils). The re
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: COBAS TaqMan assay is a new HIV assay for measuring plasma viral load (VL). A significant number of patients with undetectable plasma VL on Amplicor assay were reported to have detectable VL with TaqMan in the study centre.
PURPOSE: The aim of the present study was to investigate the significance of detectable VL counts with TaqMan assay amongst patients who have had undetectable plasma VL with COBAS Amplicor assay.
METHOD: Observational study on patients who have had undetectable (<less than 50 copies/mL) plasma VL with COBAS Amplicor version 1.5 assay but detectable plasma VL w
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Polymerase chain reaction has been used to detect increased levels of EBV DNA in salivary gland (SG) biopsies and PBL from patients with Sjogren's syndrome (SS). These results suggest that EBV, which has a normal site of latency in a small number of SG epithelial cells, may be reactivated in SS patients and provide a target for immune attack. The great sensitivity of polymerase chain reaction (PCR) and the ability to analyze very small tissue biopsies (37) make this technique well suited for clinical diagnosis. Specific methods to prevent artefactual contamination of tissue biopsy DNA with vir
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
G-quadruplex (G4) structures have emerged as critical regulatory elements in viral genomes and represent potential targets for antiviral intervention. In this study, we identified and characterized G4 structures in the unique long (UL) region of the Pseudorabies virus (PRV) genome, highlighting their role as novel antiviral targets. Bioinformatic analysis revealed two guanine-rich regions (R1 and R2) that form stable G4 structures, as confirmed by fluorescence assays, circular dichroism (CD) spectroscopy, and immunofluorescence staining. Notably, these G4 structures exhibit a tandem repeat arr
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования