Eukaryotic cells are able to mount several genetically complex cellular responses to DNA damage. The yeast Saccharomyces cerevisiae is a genetically well characterized organism that is also amenable to molecular and biochemical studies. Hence, this organism has provided a useful and informative model for dissecting the biochemistry and molecular biology of DNA repair in eukaryotes.
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gastrointestinal histoplasmosis is a rare manifestation of this fungal infection, typically identified in immunocompromised patients, such as those with HIV/AIDS. Here, we report a case of disseminated histoplasmosis with gastrointestinal involvement in a Hepatitis C-infected patient. The fungal agent was confirmed to be Histoplasma capsulatum by a DNA probe assay performed on a bone marrow sample. We propose that this fungal disease should be kept on the differential of patients infected with the Hepatitis C virus, as it has been reported to have numerous damaging effects on the adaptive immu
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This observational autopsy-based case series characterized the tissue distribution of Histoplasma capsulatum in deceased people living with HIV (PLHIV) using minimally invasive tissue sampling (MITS). This study included 59 deceased PLHIV admitted to a tertiary referral hospital in the Brazilian Amazon between October 2020 and June 2022. Tissue and body fluid samples were analyzed using fungal culture, histopathology, conventional polymerase chain reaction (PCR), and quantitative PCR (qPCR). H. capsulatum was detected in 27 of 59 (45.8%) patients, including nine (33.3%) with multi-organ detect
СтатьяНаблюдательное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Four primer systems, amplifying fragments of the gene coding for the small ribosomal subunit (18S rRNA) were characterised with pure cultures of 65 medically relevant fungal species plus two mushrooms. A primer cocktail (TR1/CA1-TR2/AF2) amplified 59 of 67 fungal species; the universal fungal primer 1 (UF1) in combination with the eukaryotic primers S3 or EU1 amplified 64 and 65 of 67 fungal species, respectively. The design of an additional primer (RZY1) enabled the amplification of the missing members of the zygomycetes. The primer systems amplified all the medically relevant fungi tested. T
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Precise DNA replication is essential for maintaining genomic stability, ensuring cellular homeostasis and faithful genetic transmission. Nevertheless, intrinsic and extrinsic factors frequently compromise replication fidelity, leading to replication stress-induced genomic instability, a potential contributor to pathogen virulence. In the fungal pathogen Candida albicans, the global transcriptomic adaptations underpinning the replication stress response and their potential contributions to fungal pathogenicity remain poorly understood. This study employed genome-wide RNA sequencing to map trans
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: The diagnosis of invasive fungal diseases (IFDs) is time consuming and lacks sensitivity. In this research a rapid and easy to use immunochromatography-based DNA biosensor system was developed to detect Candida and Aspergillus pathogens at genus level, while specifically detecting Candida glabrata, Candida krusei and Aspergillus terreus. This system combines multiplex PCR with a lateral flow assay (LFA) dipstick.
METHODS: Three separate multiplexed PCR reactions were designed together with a testing algorithm, using biotin, digoxigenin and Tamra fluorophore-labelled fungal interna
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cladosporium sphaerospermum is one of the most widely distributed allergens causing serious problems in patients with respiratory tract disease. We report the 26,644,473-bp draft genome sequence and gene annotation of C. sphaerospermum UM843. Analysis of the genome sequence led to the finding of genes associated with C. sphaerospermum's melanin biosynthesis, allergens, and antifungal drug resistance.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hypsizygus marmoreus (bunashimeji in Japanese) is a major cultivated edible mushroom in Japan. Characterizing its mating incompatibility factors in natural populations is essential for improving breeding efficiency. In this study, 71 wild isolates of H. marmoreus collected from different regions in Japan were analyzed to determine the composition and distribution of incompatibility factors. Mating tests using tester monokaryotic strains identified 82 cases of monokaryons that were carrying different alleles at both the A and B mating locus, whereas another 60 factors were shared among isolates
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Identifying genes important for fitness in Candida albicans advances our understanding of this important pathogen of humans. Here, we present a functional genomics approach for assessing fitness through the quantification of strain-specific barcodes. We describe steps for library preparation, propagation of strains, genomic DNA extraction, amplification of barcodes, and sequencing. We then detail the computational analysis of data to determine effect size and statistical significance. For complete details on the use and execution of this protocol, please refer to Xiong et al.1.
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: It is well established and accepted that fungi are a major contributing factor in nail dystrophy. It has also been recognized that bacteria play a crucial role in onycholysis. However, the bacteria and fungi that can be grown on culture media in the laboratory are only a small fraction of the total diversity that exists in nature. Contemporary studies have revealed that fungi and bacteria often form physically and metabolically interdependent consortia that harbor properties and pathogenicity distinct from those of their individual components. Metagenomic DNA "shotgun" sequencing h
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Multiple sclerosis (MS) is a chronic, inflammatory disease of the central nervous system, whose causes are still unknown. We have proposed that MS, as well as some ophthalmologic diseases, are associated with fungal infection. In the present study, we closely monitored a patient with MS over a three-year period. Antibodies against different Candida spp. were detected in peripheral blood serum, although the titer of these antibodies fluctuated. The presence of fungal macromolecules, such as proteins, polysaccharides, and DNA, was also tested. In several sera samples, antigens related to C. fama
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A fungal ball of a maxillary sinus sometimes includes dental treatment-related foreign material because the sinus is close to the root of the upper teeth. We present a case of right maxillary sinus fungal ball with a gutta-percha point, a dental root canal filler. X-ray analysis of the foreign material in the paraffin section of the fungal ball successfully detected zinc, sulfur, and barium, all of which were constituents of the gutta-percha point. The gutta-percha point might have facilitated the formation of the fungal ball through disruption of the sinus-clearing mechanism. Another interest
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Velvet regulators, characterized by a conserved velvet domain, function as central hubs that coordinately govern fungal development, secondary metabolism, stress adaptation, and pathogenicity. The velvet domain is organized into an N-terminal DNA-binding region of approximately 30 amino acids and a C-terminal dimerization region of approximately 100 amino acids. In this study, Aspergillus nidulans VelB was used as a paradigm to systematically dissect the velvet DNA-binding region. The three arginine residues R71, R80, and R81 in the N-terminal velvet domain that are indispensable for VelB func
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The ascomycete Aspergillus niger is widely used in the biotechnology, for instance in producing most of the world's citric acid. It is also known as a major food and feed contaminant. While generation of gene knockouts for functional genomics has become feasible in ku70 mutants, analyzing gene functions or metabolic pathways remains a laborious task. An unbiased transposon-based mutagenesis approach may aid this process of analyzing gene functions by providing mutant libraries in a short time. The Vader transposon is a non-autonomous DNA-transposon, which is activated by the homologous tan1-tr
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Corneal infections, particularly fungal keratitis due to rare fungal species, pose a diagnostic and therapeutic challenge because of difficulty in identification and varying susceptibility profiles. In this study, we report the first case of fungal keratitis because of Exophiala phaeomuriformis.
METHODS: We report the clinical findings and microbial identification techniques of a case of fungal keratitis due to E. phaeomuriformis. An 84-year-old woman presented with redness, pain, and itching in the left eye for 2 weeks. Slit-lamp biomicroscopy revealed one broken suture from previou
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BackgroundThe human respiratory tract hosts a complex microbial ecosystem. The host immune status plays an important role in regulating the microbial composition at different body sites, including the nasal cavity.ObjectiveThis study investigated the effects of immune disorders on nasal microbial colonization and explored Aspergillus detection methods in immunodeficient hosts.MethodsNasal swabs from healthy volunteers, patients with allergic airway disease, and immunodeficient patients were analyzed using 16S rRNA bacterial and ITS2 fungal microbiome analyses. Aspergillus colonization in immun
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: To compare diagnostic performances and accuracy of non-invasive specimens and bronchoalveolar lavage fluid (BALF) for diagnosing Pneumocystis pneumonia (PCP) in immunocompromised pneumonia patients.
METHODS: A prospective study of 112 immunocompromised patients to evaluate P. jirovecii fungal loads in paired sputum and BALF from the same patients. Patients were classified as definite PCP, probable PCP, and non-PCP based on criteria blinded to qPCR results. Optimal diagnostic cut-offs were derived, and agreement between specimen types was analyzed.
RESULTS: A BALF fungal load thre
СтатьяСравнительное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In a previous study, an isolate identified as Akanthomyces sensu lato, obtained from the citrus blackfly Aleurocanthus woglumi in Brazil, was shown to be pathogenic towards its host. Phylogenetic evidence indicated that this isolate belongs to a new taxon. This study aimed to describe this new taxon based on both morphological and molecular phylogenetic markers, to assess its potential for the biological control of the conehead termite (Nasutitermes corniger) and the citrus orthezia (Praelongorthezia praelonga) and to evaluate substrates for the mass production of this fungus. Phylogenetic ana
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The genus Lanmaoa is a globally distributed, economically important group of mushroom-forming fungi in the family Boletaceae containing edible and psychoactive species. Despite the growing interest in its hallucinogenic properties, the fundamental systematics of this genus remains poorly resolved due to limited taxon sampling and limited genetic characterization. This study combines a comprehensive sampling of all Lanmaoa species, including 21 type specimens, with whole genome sequencing of 53 specimens. A phylogeny of Lanmaoa is generated based upon an alignment of 1515 single-copy orthologs
СтатьяПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Cryphonectriaceae (Diaporthales, Ascomycota) accommodates numerous important fungal pathogens that cause branch and stem canker diseases on woody plants worldwide. These include, for example, Cryphonectria (Cry.) parasitica, the causal agent of chestnut blight, which caused the near eradication of the American chestnut (Castanea dentata) in North America. The profound ecological and economic impact of Cry. parasitica has prompted considerable research interest in the diversity, biology, and pathogenicity of other species in the Cryphonectriaceae globally. During a 2023 disease survey in No
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования