Chlamydia trachomatis serovar A is a re-emerging worldwide health problem that causes the ocular trachoma, the leading cause of avoidable blindness. The disease continues to spread due to reinfection and failure to develop long-lasting immunity. This study aimed to develop an in silico novel multi-epitope that can induce long-term immune protection against C. trachomatis serovar A. Researchers harvested the protein sequences of serovar A and queried for virulence-related factors. The predictions of epitopes for CTLs, HTLs, and B cells using immunoinformatics tools, and tested for its ability t
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Endothelial sialomucin CD34 functions as an L-selectin ligand mediating lymphocyte extravasation only when properly glycosylated to express a sulfated carbohydrate epitope, 6-sulfo sialyl Lewis x (6-sulfo SLe(x)). It is thought that multivalent 6-sulfo SLe(x) expression promotes high-affinity binding to L-selectin by enhancing avidity. However, the reported low amount of 6-sulfo SLe(x) in total human CD34 is inconsistent with this model and prompted us to re-evaluate CD34 glycosylation. We separated CD34 into 2 glycoforms, the L-selectin-binding and nonbinding glycoforms, L-B-CD34 and L-NB-CD3
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rotavirus, a primary contributor to severe cases of infantile gastroenteritis on a global scale, results in significant morbidity and mortality in the under-five population, particularly in middle to low-income countries, including India. WHO-approved live-attenuated vaccines are linked to a heightened susceptibility to intussusception and exhibit low efficacy, primarily attributed to the high genetic diversity of rotavirus, varying over time and across different geographic regions. Herein, molecular data on Indian rotavirus A (RVA) has been reviewed through phylogenetic analysis, revealing G1
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The lack of an approved vaccine against Nipah virus (NiV), a highly fatal zoonotic pathogen causing severe neurological and respiratory disease, remains a major global health challenge. Therefore, it is of interest to design a multi-epitope vaccine targeting the NiV phosphoprotein (UniProt ID: Q9IK91). Conserved B-cell, cytotoxic T-lymphocyte (CTL) and helper T-lymphocyte (HTL) epitopes were identified and selected based on antigenicity, immunogenicity and safety. The resulting vaccine construct was evaluated through structural modeling, TLR4 docking, codon optimization and immune simulation a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Viral nervous necrosis (VNN) poses a significant threat to the aquaculture industry, causing substantial losses and economic burdens. The disease, attributed to nervous necrosis viruses within the Betanodavirus genus, is particularly pervasive in the Mediterranean region, affecting various fish species across all production stages with mortality rates reaching 100%. Developing effective preventive measures against VNN is imperative. In this study, we employed rigorous immunoinformatics techniques to design a novel multi-epitope vaccine targeting VNN. Five RNA-directed RNA polymerases, crucial
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Clostridium perfringens is the primary causative agent of enterotoxemia in yaks, resulting in substantial economic losses on the Qinghai-Tibet Plateau. Conventional vaccines exhibit limited protective breadth and suboptimal efficacy, highlighting the need for innovative strategies. Here, we aimed to construct a novel vaccine candidate incorporating epitopes from multiple prevalent toxinotypes (A, C, E) of C. perfringens affecting yaks, using immunoinformatics approach.
METHODS: A hierarchical immunoinformatics pipeline was implemented, encompassing subtractive genomics to identi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Brucella spp., the causative agent of zoonotic brucellosis, poses a significant threat to both animal husbandry and human health. Given the limitations of current antibiotic treatments for human brucellosis, there is an urgent need to develop effective human vaccines. Using reverse vaccinology and bioinformatics approaches, we designed a multi-epitope vaccine (MEV) specifically targeting the CcmA, ccmC, and BepC membrane proteins, with the aim of providing robust protection against human infection.We screened 11 CTL, 9 HTL, 2 conformational B cell epitopes, and 9 linear B cell epitopes, linked
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Moraxella catarrhalis (M. catarrhalis) is a Gram-negative bacterium that can cause serious respiratory tract infections and middle ear infections in children and adults. M. catarrhalis has demonstrated an increasing rate of antibiotic resistance in the last few years, thus development of an effective vaccine is a major health priority. We report here a novel designed multitope vaccine based on the mapped epitopes of the vaccine candidates filtered out of the whole proteome of M. catarrhalis. After analysis of 1615 proteins using a reverse vaccinology approach, only two proteins (outer membrane
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Apoptosis has been proposed to influence the initiation and diversification of autoimmunity to the Ro (SSA)/La (SSB) ribonucleoprotein (RNP) particle and serve as a target for autoantibody-mediated tissue injury. We have developed a new approach to B cell epitope mapping which identifies "apotopes," defined as epitopes expressed on the surface of apoptotic cells. Preliminary studies support a role for apotopes as diagnostic markers in systemic lupus erythematosus (SLE) and primary Sjögren's syndrome. For example, apotopes within the NH(2)-terminal and central regions of La react with the major
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Lymphocytic choriomeningitis virus (LCMV) infects many individuals worldwide and causes severe infection in the immunosuppressant recipient, spontaneous abortion, and congenital disabilities in infants.
OBJECTIVES: There is no specific vaccine or therapeutics available to protect against LCMV infection; thus, there is a need to design a potential vaccine to combat the virus by developing immunity in the population. Herein, we attempted to design a potent multi-epitope vaccine for LCMV using immunoinformatics methods.
METHODS: The whole proteome of the virus was screened and mappe
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Systemic lupus erythematosus (SLE) is a prototypic systemic autoimmune disease characterised by loss of tolerance, widespread immune dysregulation, and production of diverse autoantibodies (typically directed against nuclear components). A central mechanism underlying this diversification of autoantibodies is epitope spreading, where immune responses directed against primary antigen-derived epitope progressively evolve to recognise additional epitopes, thereby perpetuating autoimmune pathology. Evidence from murine models and longitudinal human studies demonstrate that autoreactive B cells are
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The bluetongue virus (BTV), transmitted by biting midges, poses a significant threat to livestock globally. This orbivirus induces bluetongue disease, leading to substantial economic losses in the agricultural sector. The current control measures have limitations, necessitating the development of novel, efficient vaccines. In this study, an immunoinformatics approach is employed to design a multi-epitope subunit vaccine for Ovis aries targeting six BTV serotypes. Focusing on the VP2 capsid protein, the vaccine incorporates B-cell, helper-T lymphocytes (HTL), and cytotoxic T-cell lymphocytes (C
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The novel coronavirus disease (COVID-19), which is caused by severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2), has led to the ongoing 2019-2020 pandemic. SARS-CoV-2 is a positive-sense single-stranded RNA coronavirus. Effective countermeasures against SARS-CoV-2 infection require the design and development of specific and effective vaccine candidates.
OBJECTIVE: To address the urgent need for a SARS-CoV-2 vaccine, in the present study, we designed and validated one cytotoxic T lymphocyte (CTL) and one helper T lymphocyte (HTL) multi-epitope vaccine (MEV) against SARS-C
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cryptococcus neoformans is a widely distributed opportunistic pathogenic fungus. While C. neoformans commonly infects immunocompromised individuals, it can also affect those who are immunocompetent. Transmission of C. neoformans primarily occurs through the respiratory tract, leading to the development of meningitis. The mortality rate of Cryptococcal meningitis is high, and treatment options are limited. Cryptococcus neoformans infections pose a significant public health threat and currently lack targeted and effective response strategies. This study aimed to screen T lymphocyte (cytotoxic T
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The objective is to analyse the physicochemical properties, spatial structure and protein-protein interactions (PPIs) of L7/L12 protein using bioinformatics methods and predict their B- and T-cell epitopes to lay a theoretical foundation for developing a novel multiepitope vaccine (MEV). The National Center for Biotechnology Information (NCBI) database was searched for the amino acid sequences of L7/L12 from Brucella melitensis. In addition, the online softwares, ProtParam and ProtScale, were used to predict the physicochemical properties: NetPhos3.1 and CD-search to predict the phosphorylatio
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Serogroup B of Neisseria meningitidis is the main cause of mortality due to meningococcal meningitis. Despite of many investigations, there is still no effective vaccine to prevent this serious infection. Therefore, this study was conducted to design a multi-epitope based vaccine through immunoinformatics approaches. The T CD4+ and TCD8+ cells along with IFN-γ inducing epitopes were selected from TspA, FHbp, NspA, TbpB, PilQ and NspA antigens form serogroup B of Neisseria meningitidis. Furthermore, to induce strong helper T lymphocytes (HTLs) responses, Pan HLA DR-binding epitope (PADRE) was u
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Toxoplasma gondii is an obligate intracellular protozoan parasite with a broad range of hosts, and it causes severe toxoplasmasis in both humans and animals. It is well known that the progression and severity of a disease depend on the immunological status of the host. Immunological studies on antigens indicate that antigens do not exert their functions through the entire protein molecule, but instead, specific epitopes are responsible for the immune response. Protein antigens not only contain epitope structures used by B, T, cytotoxic T lymphocyte (CTL), and NK cells to mediate immunological
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The adaptable nature of Escherichia coli, shifting from benign to virulent forms, poses a major healthcare challenge due to rising multidrug resistance and hypervirulence. In this study, using an in silico reverse vaccinology approach, we designed a multiepitope mRNA vaccine candidate targeting the Shiga toxin 1 (Stx1) of Shiga toxin-producing E. coli (STEC). Two cytotoxic T-Lymphocyte (CTL), three Helper T-Lymphocyte (HTL), and two Linear B-Lymphocyte (LBL) epitopes were identified and selected through stringent computational filtering based on high antigenicity, non-allergenicity, and non-to
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
During the current era of the COVID-19 pandemic, the dissemination of Mucorales has been reported globally, with elevated rates of infection in India, and because of the high rate of mortality and morbidity, designing an effective vaccine against mucormycosis is a major health priority, especially for immunocompromised patients. In the current study, we studied shared Mucorales proteins, which have been reported as virulence factors, and after analysis of several virulent proteins for their antigenicity and subcellular localization, we selected spore coat (CotH) and serine protease (SP) protei
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We have previously argued that the antigen receptors of T and B lymphocytes evolved to be sufficiently specific to avoid massive deletion of clonotypes by negative selection. Their optimal 'specificity' level, i.e., probability of binding any particular epitope, was shown to be inversely related to the number of self-antigens that the cells have to be tolerant to. Experiments have demonstrated that T lymphocytes also become more specific during negative selection in the thymus, because cells expressing the most crossreactive receptors have the highest likelihood of binding a self-antigen, and
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования