Proximity labeling (PL) is a powerful method for mapping protein-protein interaction networks. Advances in labeling enzymes, especially TurboID, have broadened its use across biological systems. TurboID is particularly advantageous for in vivo applications due to its robustness, non-toxicity, and ease of use. This enzyme promiscuously biotinylates nearby biomolecules, including proteins and nucleic acids, within an approximately 10 nm range in the presence of biotin. We applied this method to investigate the interactome of Zucchini (Zuc), a key factor in piwi-interacting RNA (piRNA) biogenesis
СтатьяVideo-Audio MediaПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Long terminal repeat (LTR) retrotransposons belong to the transposable elements (TEs), autonomously replicating genetic elements that integrate into the host's genome. Among animals, Drosophila melanogaster serves as an important model organism for TE research and contains several LTR retrotransposons, including the Ty1-copia family, which is evolutionarily related to retroviruses and forms virus-like particles (VLPs). In this study, we use cryo-focused ion beam (FIB) milling and lift-out approaches to visualize copia VLPs in ovarian cells and intact egg chambers, resolving the in situ copia c
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Germ granules are membrane-less organelles essential for small RNA biogenesis and germline development. Among the conserved properties of germ granules is their association with the nuclear membrane. Recent studies demonstrated that LOTUS domain proteins, EGGD-1 and EGGD-2 (also known as MIP-1 and MIP-2 respectively), promote the formation of perinuclear germ granules in C. elegans. This finding presents a unique opportunity to evaluate the significance of perinuclear localization of germ granules. Here we show that loss of eggd-1 causes the coalescence of germ granules and formation of abnorm
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PIWI-interacting RNAs (piRNAs) are abundantly expressed during cardiac hypertrophy. However, their functions and molecular mechanisms remain unknown. Here, we identified a cardiac-hypertrophy-associated piRNA (CHAPIR) that promotes pathological hypertrophy and cardiac remodelling by targeting METTL3-mediated N6-methyladenosine (m6A) methylation of Parp10 mRNA transcripts. CHAPIR deletion markedly attenuates cardiac hypertrophy and restores heart function, while administration of a CHAPIR mimic enhances the pathological hypertrophic response in pressure-overloaded mice. Mechanistically, CHAPIR-
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Breast cancer (BC) remains a leading cause of cancer-related mortality globally, driven by its molecular heterogeneity and complex tumor biology. Early and accurate detection is critical for improving patient survival and guiding targeted therapies. Noncoding RNAs (ncRNAs), particularly circular RNAs (circRNAs), small nucleolar RNAs (snoRNAs), and PIWI-interacting RNAs (piRNAs), have emerged as key regulators in cancer progression and as potential biomarkers. However, the sheer volume of omics data and literature poses challenges in extracting actionable insights. Recent advances in large lang
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Piwi-interacting small RNAs (piRNA) play a key role in controlling the activity of transposable elements (TEs) in the animal germline. In diverse arthropod species, including the pathogen vectors mosquitoes, the piRNA pathway is also active in nongonadal somatic tissues, where its targets and functions are less clear. Here, we studied the features of small RNA production in head and thorax tissues of an uninfected laboratory strain of Anopheles coluzzii focusing on the 24-32-nt-long RNAs. Small RNAs derived from repetitive elements constitute a minor fraction while most small RNAs process from
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The PIWI-interacting RNA (piRNA) pathway is essential for transposable element (TE) silencing in animal gonads. While the transcriptional regulation of piRNA pathway components in germ cells has been documented in mice and flies, their control in somatic cells of Drosophila ovaries remains unresolved. Here, we demonstrate that Traffic jam (Tj), the Drosophila ortholog of large Maf transcription factors in mammals, is a master regulator of the somatic piRNA pathway. Tj binds to regulatory regions of somatic piRNA factors and the major piRNA cluster flamenco, which carries a Tj-bound enhancer do
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Small non-coding RNAs (sncRNAs) have been shown to play pivotal roles in spatiotemporal-specific gene regulation that is linked to many different biological functions. PIWI-interacting RNAs (piRNAs), typically 25-34-nucleotide long, are originally identified and thought to be restricted in germline cells. However, recent studies suggest that piRNAs associate with neuronal PIWI proteins, contributing to neuronal development and function. Here, we identify a cohort of piRNA-like sncRNAs (piLRNAs) in rat sciatic nerve axoplasm and directly contrast temporal changes of piLRNA levels in the nerve f
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Congenital craniofacial abnormalities are congenital anomalies of variable expressivity and severity with a recognizable set of abnormalities, which are derived from five identifiable primordial structures. They can occur unilaterally or bilaterally and include various malformations such as cleft lip with/without palate, craniosynostosis, and craniofacial microsomia. To date, the molecular etiology of craniofacial abnormalities is largely unknown. Noncoding RNAs (ncRNAs), including microRNAs, long ncRNAs, circular RNAs and PIWI-interacting RNAs, function as major regulators of cellular epigene
Систематический обзорСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hepatitis C virus (HCV) and human immunodeficiency virus (HIV) hijack the host exosomal machinery as an additional mechanism of infection and evasion of the immune system, modifying the small RNA (smRNA) cargo during infection. We characterized the surface epitopes of extracellular vesicles (EVs) from plasma HIV/HCV-coinfected patients and their smRNA cargo profile, by comparing different isolation procedures. Six EVs isolation procedures were compared: ultracentrifugation, and five different polyethylene glycol-based methods (commercial, combined with a column purification step and two custom
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cadmium (Cd) is a harmful environmental pollutant that disrupts public health, including respiratory, digestive, and reproductive systems. In this study, male rats were exposed to CdCl2 at a dose of 3 mg/kg by oral for 28 days to investigate the impact on spermatogenesis. Testis tissue samples were collected after sacrifice, and piRNA expression levels were measured using piRNA microarray and qPCR. PiRNAs, specialized molecules involved in spermatogenesis, were examined. CdCl2 exposure led to disrupted piRNA expression, particularly in piRNA-DQ759395 in rats. This piRNA was found to have a bin
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PIWI-interacting RNAs (piRNAs) are crucial for silencing transposable elements, germ cell development, and gametogenesis. Triploid Pacific oysters (Crassostrea gigas) are vital in the oyster aquaculture industry due to reduced fertility and rapid growth. This study integrates piRNA and mRNA expression analyses to elucidate their potential contributions to the sterility of triploid C. gigas. Bioinformatics analysis reveals a distinct U-bias at the 5' terminal of oyster piRNAs. The abundance of piRNA clusters is reduced in triploid gonads compared to diploid gonads, particularly in sterile gonad
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nowadays, nonalcoholic fatty liver disease (NAFLD) represents the most common cause of chronic liver disorder worldwide. From the clinical point of view, it evolves from steatosis to nonalcoholic steatohepatitis, which can lead to cirrhosis and finally to hepatocellular carcinoma. The mechanisms involved in its progression to more pathological stages and NAFLD pathogenesis are not completely understood. The research concerning NAFLD has become urgent and important because the age of NAFLD diagnosis is progressively decreasing, and its relationship with cancer risk is already well known. Becaus
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Urinary bladder cancer (UBC) is the ninth most common cancer worldwide. Despite the reliance of UBC therapy on definite pathological grading and classifications, the clinical response among patients varies widely. The molecular basis of this type of cancer appeals to considerable research; hence, new diagnostic and therapeutic options are introduced. Convenient keywords were searched in Google Scholar, PubMed, the Egyptian Knowledge Bank (EKB), and Web of Science. The recent era of UBC research is concerned with non-coding RNAs (ncRNAs), predominantly, microRNAs (miRNAs) and long non-coding RN
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Di-(2-ethylhexyl) phthalate (DEHP), a widely used plasticizer, could cause male reproductive toxicity by disrupting spermatogenesis. Piwi-interacting RNAs (piRNAs) are a small non-coding RNAs specifically highly expressed in the germline and interact with PIWI proteins to regulate spermatogenesis. Accumulating studies have confirmed that environmental poisons could induce male reproductive injury via altering piRNA expression. However, it remains unclear whether DEHP causes male reproductive dysfunction by perturbing piRNA expression levels. In this study, we conducted piRNA microarray express
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Objective biomarkers for the fatal neurodegenerative disease amyotrophic lateral sclerosis or motor neuron disease (ALS/MND) are critical for diagnosis, drug development, clinical trials, and insight into disease pathology. Key candidates for biomarkers present in biofluids include non-coding RNA (ncRNA) transcripts including microRNA, piwi-interacting RNA and transfer RNA. To determine if the central nervous system was the source of the dysregulated ncRNA biomarkers we previously observed in serum, we sought to identify dysregulated ncRNA candidates in cerebrospinal fluid (CSF)
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Respiratory syncytial virus (RSV) is a leading cause of acute lower respiratory tract infections with significant morbidity and mortality in young children, the elderly and immunocompromised hosts. Despite its clinical burden, no effective RSV vaccine or therapy exists for infants, only prophylactic treatment. Small non-coding RNAs have emerged as important regulators of host-pathogen interactions. PIWI-interacting RNAs (piRNAs) are a distinct class of small non-coding RNAs known for maintaining the genome complexity and integrity in gonadal cells. However, there is growing evidence of their r
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Piwi-interacting RNA (piRNA) is a type of non-coding small RNA that is highly expressed in mammalian testis. PiRNA has been implicated in various human diseases, but the experimental validation of piRNA-disease associations is costly and time-consuming. In this article, a novel computational method for predicting piRNA-disease associations using a multi-channel graph variational autoencoder (MC-GVAE) is proposed. This method integrates four types of similarity networks for piRNAs and diseases, which are derived from piRNA sequences, disease semantics, piRNA Gaussian Interaction Profile (GIP) k
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Skin aging is characterized by progressive decline in dermal fibroblast function, marked by reduced extracellular matrix (ECM) synthesis, accelerated ECM degradation, diminished repair capacity, and activation of the senescence-associated secretory phenotype (SASP). Recent studies demonstrate that non-coding RNAs (ncRNAs), including microRNAs (miRNAs), long non-coding RNAs (lncRNAs), and circular RNAs (circRNAs), critically regulate this process through two primary mechanisms. First, ncRNAs exert direct regulation, including miRNA-mediated RNA-RNA targeting and lncRNA/circRNA-mediated direct b
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Epigenetic modifications that arise during plant and animal development, such as DNA and histone modification, are mostly reset during gamete formation, but some are inherited from the germline including those marking imprinted genes1. Small RNAs guide these epigenetic modifications, and some are also inherited by the next generation2,3. In C. elegans, these inherited small RNAs have poly (UG) tails4, but how inherited small RNAs are distinguished in other animals and plants is unknown. Pseudouridine (Ψ) is the most abundant RNA modification but has not been explored in small RNAs. Here, we de
ПрепринтСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.