Wastewater-based epidemiology (WBE) for population-level surveillance of antimicrobial resistance (AMR) is gaining significant traction, but the impact of wastewater sampling methods on results is unclear. In this study, we characterized taxonomic and resistome differences between single-timepoint-grab and 24 h composites of wastewater influent from a large UK-based wastewater treatment work [WWTW (population equivalent: 223 435)]. We autosampled hourly influent grab samples (n=72) over three consecutive weekdays, and prepared additional 24 h composites (n=3) from respective grabs. For taxonom
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Microorganisms belonging to root and soil provide a wide range of services and benefits to the plant by promoting plant growth and controlling phytopathogens. This study aimed to isolate endophytic bacteria from the root nodules of chickpea (Cicer arietinum L.) and determine their potential in improving plant growth. A total of nineteen different bacterial morphotypes were isolated from root nodules of chickpea and characterized in vitro for plant growth promotion abilities. All bacterial isolates were able to produce indole acetic acid at varying levels, out of which MCA19 was screened as the
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
There is limited information is known about the composition difference of the gut microbiota in patients with constipation and healthy controls. Here, the faecal 16S rRNA fastq sequence data of microbiota from the publicly available American Gut Project (AGP) were analysed. The tendency score matching (PSM) method was used to match in a 1:1 manner to control for confounding factors age, gender, body mass index (BMI), and country. A total of 524 participants including 262 patients with constipation and 262 healthy controls were included in this analysis. The richness and evenness of the gut mic
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Аннотация не предоставлена источником. Откройте карточку для перехода к публикации.
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Staphylocystis clydesengeri n. sp. is described from shrews Sorex vagrans in Montana and Washington, United States. It differs from the only previously known North American representative of the genus, S. schilleri, in having more numerous (37-42 vs. 22-30) and larger (39-44 microm vs. 27-30 microm) rostellar hooks. The two species also differ in several other important characters such as relative length of the cirrus pouch, position of gonads and shape of mature proglottides. Morphological differentiation of the new species from all previously known Palearctic species of Staphylocystis from S
СтатьяПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We report a case of tularemia in a common marmoset (Callithrix jacchus) diagnosed by determination of the isolate's 16S ribosomal RNA (rRNA) gene sequence. Pathological examination of the animal revealed a multifocal acute necrotizing hepatitis, interstitial nephritis, splenitis, and lymphangitis of the mandibular, retropharyngeal, and cervical and mesenteric lymph nodes. Moreover, multiple foci of acute necrosis were found in the epithelium of the jejunum and the interstitium of the lung. Bacteriological investigations revealed a septicemia. The isolated infectious agent was uncommon, not rou
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Knowledge of novel and revised bacterial taxonomy facilitates routine operations in the medical microbiology laboratory and communication with important stakeholders. Notable new gram-positive taxa accepted in 2024 include the clinically significant Staphylococcus brunensis sp. nov., as well as Streptococcus suis subsp. hashimotonensis subsp. nov., which can be delineated from other Streptococcus suis subsp. by possession of the Lancefield group A antigen. Four novel Enterobacterales species are discussed, plus a novel eighth family Gallaecimonadaceae. One of these, Providencia huashanensis sp
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Antibiotic tolerance is associated with failure of antibiotic treatment and accelerates the development of antimicrobial resistance. The molecular mechanisms underlying antimicrobial tolerance remain poorly understood. Tolerant bacteria can slow metabolism by extending the lag phase without altering antimicrobial susceptibility. We recently induced ceftriaxone (CRO) tolerance in the Neisseria gonorrhoeae reference strain WHO P. In the current study, we characterized the transcriptomic profiles of these CRO-tolerant phenotypes. To induce tolerance, WHO P strains were grown under 3-h
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nucleolar essential protein 1 (Nep1; also known as ribosomal RNA small subunit methyltransferase Nep1) is a crucial factor in forming small ribosomal subunits in eukaryotes and archaea. Nep1 possesses an S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent SpoU-TrmD (SPOUT) ribosomal RNA (rRNA) methyltransferase (MTase) fold and catalyzes pseudouridine (Ψ) methylation at specific sites of the small subunit (SSU) rRNA. Mutations in Nep1 proteins result in a severe developmental disorder in humans and reduced growth in yeast, suggesting its role in ribosome biogenesis. In this study, the crystal structures o
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RNA is involved in fundamental biological functions when bacterial pathogens replicate. Identifying and studying small molecules that can interact with bacterial RNA and interrupt cellular activities is a promising path for drug design. Aminoglycoside (AMG) antibiotics, prominent natural products that recognize RNA specifically, exert their biological functions by binding to prokaryotic ribosomal RNA and interfering with protein translation, ultimately resulting in bacterial cell death. The decoding site, a small internal loop within the 16S rRNA, is the molecular target for the AMG antibiotic
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: To perform a pilot study to characterize the effect of clinical parameters on the ocular surface microbiome (OSM) in children and adults using 16s ribosomal RNA sequencing.
METHODS: Prospective, cross-sectional study using 16s sequencing to evaluate the OSM. Comparisons were made in bacterial composition by 1) age, 2) gender, 3) sampling location of the ocular and periocular surfaces, and 4) topical drop use. 16s sequencing was performed using Illumina MiSeq 250 and analyzed using Qiime.
RESULTS: Thirty patients (15 children [mean 3.7 years], 15 adults [mean 60.4 years]) were sample
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ribosomal RNA (rRNA) methylation is conserved across biology, yet the effect of rRNA methylation on ribosome function is poorly understood. In this work, we identify a biological function for the rRNA 2'-O-methylcytidine methyltransferase TlyA, conserved between Bacillus subtilis and Mycobacterium tuberculosis (Mtb). The tlyA deletion in B. subtilis confers a cold sensitive phenotype and resistance to aminoglycoside and cyclic polypeptide antibiotics. We show that ∆tlyA cells have ribosome assembly defects characterized by accumulation of the 50S subunit. Using a genetic approach, we tested th
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A novel, fast-growing spirochaete was isolated from the hard tick Hyalomma aegyptium (family Ixodidae, subfamily Metastriata) using Barbour-Stoenner-Kelly (BSK) II medium. Tick samples were taken during the summer of 2000 from the Istanbul area in northwestern Turkey. Sixty-seven of 153 adults (44%) and 72 of 185 nymphs (39%) were infected with the novel spirochaete, whereas none of the 20 larvae examined were infected. The optimal growth temperature of the spirochaete in BSK II medium was 34-37 degrees C, and it could grow at 39 degrees C. Doubling times at 34 and 37 degrees C were 5.3 and 5.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The morphology of Onchocerca lupi, responsible for canine ocular onchocercosis, is unique within the genus. Earlier analyses of the 5S ribosomal RNA gene spacer region sequence of the parasite and the 16S ribosomal RNA gene sequence of its Wolbachia endosymbiotic bacteria (Rickettsiales) supported the morphological and biological arguments that O. lupi is a distinct species. However, the exact phylogenetic position of O. lupi and its endosymbiont could not be unambiguously determined. Herein we report analyses based on the mitochondrial cytochrome oxidase I (COI) gene of the filarial species a
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Wastewater pollution of water resources takes a heavy toll on humans and on the environment. In highly polluted water bodies, self-purification is impaired, as the capacity of the riverine microbes to regenerate the ecosystem is overwhelmed. To date, information on the composition, dynamics and functions of the microbial communities in highly sewage-impacted rivers is limited, in particular in arid and semi-arid environments. In this year-long study of the highly sewage-impacted Al-Nar/Kidron stream in the Barr al-Khalil/Judean Desert east of Jerusalem, we show, using 16S and 18S rRNA gene-bas
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The present paper deals with the post-mortem diagnostics of onchocerciasis and the molecular detection of causative agents of this disease in wild ruminant ungulates (Cervus elaphus, Dama dama and Capreolus capreolus). The animals were shot in hunting seasons 2017 and 2018, in two regions of the Eastern Slovakia. The total number of examined skins was fifty-eight. The presence of subcutaneous nodules was confirmed in 27.59% (95% CI 16-39) of animals. All positive skins belonged to red deer individuals (47.06%; 95% CI 30-64). The nodules were present mainly in the back area and in the lumbar ar
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The effect of pneumococcal vaccination is widely variable when measured by nasopharyngeal carriage of vaccine and non-vaccine targets. The aim of this study was to compare the carriage rates and metabolic activity of Streptococcus pneumoniae, Staphylococcus aureus, Haemophilus influenzae and Moraxella catarrhalis among children who were or were not vaccinated with PCV10.
METHODS: We included children with acute respiratory infection aged 6-23months from a cross-sectional study (CHIADO-IVAS). Nasopharyngeal aspirates were collected and respiratory pathogens were quantified by nCoun
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bats are considered reservoirs of several emerging zoonotic pathogens. Previous studies on blood parasites such as Anaplasmataceae, hemoplasmas, piroplasmids, and Hepatozoon spp. in South American bats have revealed high genetic diversity. This study investigated the molecular occurrence of these agents in 278 bats of 32 species captured in the state of Acre in the Western Brazilian Amazon. Spleen DNA samples were screened by PCR for different pathogens and tested negative for Anaplasma spp., Ehrlichia spp., Neorickettsia spp., piroplasmids, and Hepatozoon spp. However, 84 of the 208 samples (
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: The recent identification of antigens or nucleic acids of infectious agents in the joints of patients with reactive arthritis has raised questions about whether chlamydial or other infectious agent nucleic acids are also present in normal joints. We had the opportunity to study synovium from 30 asymptomatic volunteer subjects by use of polymerase chain reaction (PCR) for attempted identification of Chlamydia and other infectious agents.
METHODS: All subjects had blind needle synovial biopsies with the Parker-Pearson needle. DNA was extracted and PCR performed using primers for Chla
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We report a case of an immunosuppressed 67-year-old woman who presented with fever of unknown origin. Further investigation revealed multiple left renal and perinephric abscesses. These were managed with percutaneous drainage and broad-spectrum antibiotics; however, no clinical improvement resulted. No organism was identifiable on standard microscopy and culture of all drain, blood and urine samples taken. Left nephrectomy with right urinary diversion was performed for sepsis management and to protect the patient's right kidney. Eventually, Ureaplasma species' RNA was detected in the patient's
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.