Уникальные публикации PubMed, Europe PMC и Crossref, сохранённые в библиотеке. Одна статья учитывается один раз, даже если получена из нескольких источников. Личные исследования и документы команд не публикуются.
Идёт проверка счётчикаДоступно в поиске—
Публикации, уже подготовленные для быстрого поиска. Остальная библиотека подключается в фоне.
Переведено на русский—
Готовые переводы среди доступных в поиске публикаций. Автоматический медицинский перевод и проверка специалистом учитываются отдельно.
Полные тексты—
Найденные полные тексты среди доступных в поиске публикаций. Доступность определяется первоисточником и условиями использования.
Оригиналов на русском—
Русскоязычные оригиналы доступны без ожидания перевода. Ниже — языки остальных оригиналов; для них готовится медицинский перевод на русский.
Пополняем библиотеку по диагнозам—Проверяем состояние обновлений
Для каждого диагноза из справочника МКБ-10 ищем связанные публикации в научных базах и добавляем их в библиотеку. Числа ниже — диагнозы, а не статьи.
Если сбор прервался, тема требует повторной попытки. Уже сохранённые статьи остаются в библиотеке.
Нажмите на показатель для подробностей. Показатели поиска обновляются автоматически; размер всей библиотеки сверяется отдельно. Время последней проверки указано явно.
Результаты поиска
19135 публикаций
Поиск: 337 мс
Публикации на разных языках · PubMed, Europe PMC и данные издателей через Crossref · 5637 с найденным полным текстом
Accurate cell type annotation is fundamentally critical for single-cell sequencing (scRNA-seq) data analysis to provide insightful knowledge of tissue-specific cell heterogeneity and cell state transition tracking. Cell type annotation is usually conducted by comparative analysis with known data (i.e., reference) - which contains a presumably accurate representation of cell types. However, this assumption is often problematic, as factors such as human errors in wet-lab experiments and methodological limitations can introduce annotation errors in the reference dataset. As current pipelines for
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Primary Sjögren's syndrome (pSS) is a chronic autoimmune disorder. Dysregulated interferon-gamma (IFN-γ) signalling is implicated in pSS pathogenesis, yet the underlying mechanisms remain elusive. This study aimed to identify key IFN-γ-associated diagnostic genes and delineate their roles in immune dysregulation using peripheral blood transcriptomic and single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) data. Publicly available Gene Expression Omnibus (GEO) datasets were used, and the bioinformatics findings were further supported by reverse transcription-quantitative PCR (RT-qPCR) validation. Peripheral
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Accurately inferring cell-type-specific gene regulatory networks (GRNs) is crucial for understanding cellular heterogeneity, lineage determination, and disease progression mechanisms. Although single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) enables high-resolution expression profiling, its inherent sparsity and high noise levels pose challenges to reliable GRN reconstruction. To address these issues, we propose cell type-specific gene regulatory network (CTN), a regulatory inference framework based on bilateral self-representation matrix decomposition, which integrates bulk RNA-seq data with scRNA-seq
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Glioblastoma, IDH-wildtype, is the most common and malignant adult-type diffuse glioma. It is characterized by extensive heterogeneity and poor prognosis. Recent single-cell RNA-sequencing studies have revealed distinct transcriptional programs that define cellular states such as astrocyte-like, mesenchymal-like, neural-progenitor-cell-like, and oligodendrocyte-progenitor-cell-like. However, their spatial context remains unclear because of the limitations of single-cell and spot-based spatial transcriptomics. In the present study, we applied a single-cell molecular classification of glioblasto
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) data has been widely used for cell trajectory inference, with the assumption that cells with similar expression profiles share the same differentiation state. However, the inferred trajectory may not reveal clonal differentiation heterogeneity among T cell clones. Single-cell T cell receptor sequencing (scTCR-seq) data provides invaluable insights into the clonal relationship among cells, yet it lacks functional characteristics. Therefore, scRNA-seq and scTCR-seq data complement each other in improving trajectory inference, where a reliable computational
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Sepsis is a life-threatening organ dysfunction caused by a dysregulated immune response to infection. Ammonia-induced cell death (AICD) is a novel form of cell death, and its association with sepsis remains unclear. This study aims to identify key genes involved in AICD in pediatric sepsis.
METHOD: Obtain batch transcriptome (bulk RNA) and single-cell transcriptome (scRNA) data of pediatric sepsis from the Gene Expression Omnibus (GEO) database. Screen for differentially expressed genes (DEGs) and key module genes of weighted gene co-expression networks in the bulk RNA data, and t
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Colorectal cancer (CRC) exhibits substantial molecular heterogeneity, yet detailed single-cell transcriptomic data from Japanese patients remain limited. Here, we performed single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) on tumor tissues and adjacent normal tissues from four Japanese CRC patients to characterize malignant cell populations. We identified a common cancer-associated cell cluster observed across all four cases, characterized by high expression of the long noncoding RNA KCNQ1 opposite strand/antisense transcript 1 (KCNQ1OT1). Further analysis revealed a marked decrease in Ras Association Do
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) enables high-resolution profiling of individual cells. However, inferring temporal relationships among cells remains a challenge. Here, we present real-time course analysis (RTCA), a simple direct phylogenetic signal framework that reconstructs cell lineages from somatic variants detected across cells using variants derived from nuclear-encoded transcripts in scRNA-seq data. Our simulations demonstrate that only a modest increase in informative variant sites is sufficient to maintain accurate tree reconstruction, even with a tenfold increase in the number
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Ischemic stroke remains a leading cause of mortality and long-term disability worldwide, with complex and heterogeneous pathophysiological processes. Single-cell and single-nucleus RNA sequencing (sc/snRNA-seq) has been increasingly applied to investigate cellular heterogeneity at high resolutions.
METHODS: We systematically searched PubMed, Web of Science, and Embase to identify studies that applied sc/snRNA-seq in ischemic stroke research. Based on the retrieved literature, we summarized the bioinformatic analytical methods and application strategies reported in these studies, f
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tumors are embedded within complex microenvironments composed of malignant, immune and stromal cells, yet how coordinated cellular organization shapes tumor biology across cancers remains incompletely understood. Here we integrate single-cell transcriptomic profiles from over two million cells spanning 19 human epithelial cancers to construct a comprehensive pan-cancer atlas of tumor microenvironment (TME) organization. We identify cell subsets selectively enriched in tumors compared with normal tissues and show that their relative abundance is associated with clinical outcomes. By clustering
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
ObjectiveColon cancer ranks among the most prevalent malignancies globally. Despite advances in therapy, patients' prognosis remains poor, particularly in advanced stages. Programed cell death (PCD), including over 20 patterns, plays a pivotal role in colon cancer progression. However, a systematic analysis of the PCD regulatory network in colon cancer is lacking.MethodsWe comprehensively analyzed various PCD patterns in colon cancer using bulk transcriptomic and single-cell transcriptomic data from GEO and TCGA databases. Multiple machine learning algorithms were used to identify Key PCD patt
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In donkey reproduction, the extended reproductive cycle is a pivotal factor contributing to the low reproductive rate. Gonadal development represents a highly complex biological process that involves sex determination and subsequent progression toward ovarian maturation. Currently, the mechanisms underlying ovarian development in donkeys remain poorly understood. To address this gap, we constructed single-cell transcriptome maps of the gonads of donkey embryos during pregnancy at four and eight weeks, thereby identifying the major cell types involved. During development, the morphology of the
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tumor cell heterogeneity and interactions with the immune microenvironment play a key role in the progression and therapeutic efficacy of natural killer/T-cell lymphoma (NKTCL). We perform single-cell RNA sequencing analysis of 63 samples, integrating spatial transcriptomics, bulk transcriptomics, proteomics, and metabolomics to dissect inter- and intra-tumoral heterogeneity. Four meta-programs (MP) are identified, including MP1 (immune-responsive), MP2 (proliferative), MP3 (inflammatory), and MP4 (metabolic), each linked to distinct molecular and immune features. MP1 exhibits an immune-exhaus
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Gastric cancer remains a major global health burden with high incidence and mortality. Despite therapeutic advances, long-term survival remains unsatisfactory. Reliable biomarkers to predict therapeutic efficacy and clinical outcomes are urgently needed. This study aimed to elucidate the heterogeneity of gastric cancer using an integrative bioinformatics approach that combines single-cell RNA-sequencing (scRNA-seq) and bulk RNA-seq data. METHODS: scRNA-seq datasets were obtained from the GEO database, and bulk RNA-seq data were obtained from the TCGA. Cell communication, pseudo
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Survival analysis is fundamental to cancer research. Advances in technology have enabled an increasing number of cohort-level cancer studies to incorporate single-cell sequencing alongside clinical survival data. However, no effective strategy currently exists for directly modeling survival outcomes from single-cell data. To address this gap, we present scSurvival, an attention-based multiple-instance Cox regression framework that models each tumor sample as an ensemble of cells to predict survival outcomes at both the patient and single-cell levels. To handle high dimensionality,
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Psoriasis is a chronic inflammatory skin disease characterized by dysregulated immune responses and keratinocyte (KC) hyperproliferation. Although therapeutic strategies have advanced considerably, achieving durable long-term remission remains challenging. R-loops are three-stranded nucleic acid structures involved in genomic stability and inflammatory regulation in multiple diseases; however, their role in psoriasis remains poorly understood.
OBJECTIVE: To investigate the involvement of R-loops in psoriasis, develop an R-loop-related diagnostic signature, and identify key molecul
СтатьяВалидационное исследованиеПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Single-cell RNA sequencing is a powerful approach for characterising cellular heterogeneity and elucidating transcriptional programs that drive tumour plasticity, therapeutic resistance, and disease progression. In this study, we present a single-cell transcriptomic dataset comprising 41 patient-derived cell cultures (PDCs) established from pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC). The dataset was generated using Evercode™ technology, which is based on Split Pool Ligation-based Transcriptome sequencing (SPLiT-seq). This scalable method enables high-throughput profiling across multiple samples w
СтатьяDatasetПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Diabetic retinopathy (DR) is one of the most common microvascular complications of diabetes and can lead to severe visual impairment. Based on disease severity, DR is classified into no clinically apparent diabetic retinopathy (NDR), non-proliferative diabetic retinopathy (NPDR), and proliferative diabetic retinopathy (PDR). Although nearly all retinal cell types are involved in DR progression, the dominant cell populations and their pathophysiological changes at each stage remain unclear. By integrating bulk and single-cell transcriptomic data from human and mouse retinas, this study revealed
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Diabetic cardiomyopathy (DCM) is a diabetes-related myocardial disorder causing fibrosis, hypertrophy, and progressive diastolic and systolic dysfunction. This study aims to explore how metabolic, inflammatory, and fibrotic mechanisms in non-cardiomyocytes drive DCM to reveal new therapeutic targets.
METHODS: Single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) was performed to investigate the role of non-cardiomyocytes in DCM, enabling the identification of cell types, gene expression dynamics, and intercellular communication networks in patients with type 2 diabetes. The scRNA-seq data were o
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To enhance the understanding of cellular heterogeneity within the pediatric thyroid, single-nuclei RNA sequencing was used to recover 38,069 non-pathogenic cells from thyroid tissue of three female pediatric/young adult patients. The recovered cells were analyzed using the SWANS (Single Entity Workflow ANalysiS pipeline (version 1.0). Analysis revealed seven major cell types: thyrocytes, endothelial cells, fibroblasts, C cells, T cells, B cells, and myeloid cells. Thyrocytes were the most prominent and heterogeneous cell type. Initially, two dominant thyrocyte subsets were identified based on
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.