Интегрированное многоомикальное исследование молекулярных сетей окислительного стресса, вызывающее множественный склероз.

Окисляющий стресс (ОС) является ключевым патофизиологическим механизмом при множественном склерозе (MS). Однако основные механизмы, с помощью которых ОС сработала НР, остаются неизвестными. Для выявления потенциальных причинно-следственных целей в 1216 генах, связанных с ОС, был применен метод, основанный на обобщенных данных, на менделийской случайности (МСР). Учитывая, что гены могут выполнять свои биологические функции с помощью различных уровней ОМИК, использовались мультимики SMR, интегрирующие выражение, метилацию и белковую количественную loci (eQTL, mQTL и PQTL) связанных с OS генов из крови и мозговых тканей. Для изучения потенциальных механизмов регулирования изменения риска QTL в НР было проведено испытание Байесовской совместной локализации. Чтобы проверить достоверность наших результатов, мы подтвердили эти выводы в группе Финнген. Кроме того, были интегрированы уровни данных QTL, результаты совместной локализации и результаты групп воспроизводства, а потенциальные целевые гены были подразделены на три уровня. В результате три гена (BACH2, TRAF3 и MAPK3) были определены в качестве потенциальных источников MS в крови, а четыре гена (HMGCL, TSFM, TRAF3 и HLA-B) были определены в качестве потенциальных источников MS в мозговой ткани. Кроме того, HMGCL и TSFM из мозговой ткани были подкреплены доказательствами первого уровня, связанными с MS, и были подтверждены с помощью экспериментов in vitro. Это исследование не только способствовало фундаментальным исследованиям ОС в РС, но и способствовало выявлению потенциальных целевых показателей для клинического вмешательства в РС.