MedElevator Войти в исследования
← Поиск публикаций

DOI 10.1186/s13059-019-1801-5

Медицинская библиотека · Genome biology · 2019

DESE: estimating driver tissues by selective expression of genes associated with complex diseases or traits.

Jiang Lin, Xue Chao, Dai Sheng, Chen Shangzhen, Chen Peikai, Sham Pak Chung, Wang Haijun, Li Miaoxin

СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАВалидационное исследованиеПеревод в очереди

Аннотация

The driver tissues or cell types in which susceptibility genes initiate diseases remain elusive. We develop a unified framework to detect the causal tissues of complex diseases or traits according to selective expression of disease-associated genes in genome-wide association studies (GWASs). This framework consists of three components which run iteratively to produce a converged prioritization list of driver tissues. Additionally, this framework also outputs a list of prioritized genes as a byproduct. We apply the framework to six representative complex diseases or traits with GWAS summary statistics, which leads to the estimation of the lung as an associated tissue of rheumatoid arthritis.

Для цитирования: Jiang Lin, Xue Chao, Dai Sheng, Chen Shangzhen, Chen Peikai, Sham Pak Chung, Wang Haijun, Li Miaoxin. DESE: estimating driver tissues by selective expression of genes associated with complex diseases or traits.. Genome biology. 2019. DOI: 10.1186/s13059-019-1801-5.

Предметные рубрики MeSH

Подготовка и перевод публикации
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…

История · было → стало

Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.

Тип публикации указан по данным источника. Уровень доказательности автоматически не присваивается.