m+Medelevator.RU
← Поиск публикаций
Cytokine · 2025

Сочетание одноклеточного анализа и менделийской случайности для разъяснения молекулярных механизмов фибронектиновых генов в множестве склероза.

СтатьяНазвание и аннотация: Машинный перевод · не проверен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…

История · было → стало

Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.

Zhao Na, Maimaiti Mayinuer, Li Hongyan

Аннотация

Множественный склероз (MS) — это аутоиммунное заболевание, вызывающее аутоиммунное демиелиноз, и связь между генами, связанными с фибронектином (FRGs), и MS неясна. Мы стремились прояснить молекулярный механизм и причинно-следственную связь ФРГ в РС с помощью одноклеточных ячеек, сочетающих анализ менделийской случайности (MR). Типы клеток, выявленные в ходе одноклеточного анализа с помощью набора данных GSE193770, были разбиты на группы с высоким и низким уровнем экспрессии на основе уровней FRG. Согласно дифференциально выраженным генам ключевых клеток, MR использовалась для получения ключевых генов и их причинно-следственных связей. Кроме того, был проведен анализ иммунной инфильтрации и функционального обогащения для изучения значимости ключевых генов, причем RT-qPCR подтвердил их выражение. Было выявлено шесть типов клеток, при этом ключевыми были клетки естественного убийцы (НК). Четыре ключевых гена были обнаружены в MR: CAT, RGS10, S100A10 и CD247. Единообразное ДР показало, что КПП и RGS10 являются защитными факторами, а S100A10 и CD247 были факторами риска. Множественный MR далее подчеркнул значение CD247. Подтверждение экспресс-проверки с использованием набора данных GSE41850 и RT-qPCR подтвердилось в выражений КПП и CD247 в образцах MS, а также в перевыражении S100A10. Анализ иммунной инфильтрации показал значительную позитивную корреляцию между CD247 и Tregs, оставив в памяти CD4 клетки T и T фолликулярные вспомогательные клетки, в то время как КПП продемонстрировал значительную негативную корреляцию с активированными и отдыхающими ячейками NK. В этом исследовании изучалась причинно-следственная связь между ключевыми генами CAT, RGS10, S100A10, CD247 и MS Progress, а также открывались новые перспективы применения FRG для лечения и прогнозирования MS.
Оригинал публикации

Combining single-cell analysis and Mendelian randomization to elucidate the molecular mechanisms of fibronectin-related genes in multiple sclerosis.

Multiple sclerosis (MS) is an inflammatory demyelinating autoimmune disease, and the association between the fibronectin-related genes (FRGs) and MS is unclear. We aimed to clarify the molecular mechanism and causality of FRGs in MS by single-cell combining Mendelian randomization (MR) analysis. The cell types identified by single-cell analysis with GSE193770 dataset were sorted into high- and low-expression groups based on FRG levels. According to differentially expressed genes from key cells, MR was employed to obtain key genes and their causal relationships. Additionally, immune infiltration analysis and functional enrichment were performed to explore the significance of key genes, with RT-qPCR validating their expression. Six cell types were identified, with natural killer (NK) cells being pivotal. Four key genes were revealed from MR: CAT, RGS10, S100A10, and CD247. Univariable MR showed CAT and RGS10 as protective factors, while S100A10 and CD247 were risk factors. Multivariable MR further emphasized CD247's significance. Expression validation using the GSE41850 dataset and RT-qPCR confirmed underexpression of CAT and CD247 in MS samples, and overexpression of S100A10. Immune infiltration analysis showed significant positive correlations between CD247 and Tregs, resting CD4 memory T cells, and T follicular helper cells, while CAT showed significant negative correlations with activated and resting NK cells. This study explored the causal relationship between the key genes CAT, RGS10, S100A10, and CD247 and MS progression and provided novel perspectives into the application of FRGs for the treatment and prognosis of MS.

Предметные рубрики MeSH

ИП Урсолов Владлен Сергеевич

ИНН 500118482352 · ОГРНИП 314500117700049

Реквизиты и контакты