Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) · 2023
Profiling Dynamic Changes in DNA Accessibility During Axon Regeneration After Optic Nerve Crush in Adult Zebrafish.
СтатьяНазвание и аннотация: Перевод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dhara Sumona P, Udvadia Ava J
Аннотация
A time-course series utilizing assay for transposase-accessible chromatin with high-throughput sequencing (ATAC-seq) can be used to detect changes in accessibility of DNA regulatory elements such as promoters and enhancers over the course of regeneration. This chapter describes methods for preparing ATAC-seq libraries from isolated zebrafish retinal ganglion cells (RGCs) following optic nerve crush at selected post-injury time points. These methods have been used for identifying dynamic changes in DNA accessibility that govern successful optic nerve regeneration in zebrafish. This method may be adapted to identify changes in DNA accessibility that accompany other types of insults to RGCs or to identify changes that occur over the course of development.