m+Medelevator.RU
← Поиск публикаций
Multiple sclerosis and related disorders · 2025

Автоматизированная сегментация множественных склерозов от 3D-FLEAR MRI с использованием R2AUNet: Глубокий подход к обучению с повторяющимися остаточными механизмами и механизмами внимания.

СтатьяНазвание и аннотация: Машинный перевод · не проверен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…

История · было → стало

Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.

Andishgar Aref, Rismani Maziyar, Mohammadi Zahra, Bazmi Sina, Fathian Mehrnaz, Shafaei Mahdi Esmaeili, Tajali Mahsa, Khazforoosh Sahar, Sajjadi Leila, Goodarzi Elham, Sookhaklari Mohammadamin, Hooshmandi Sedighe, Jahromi Alireza Torabi, Poursadeghfard Maryam

Аннотация

Множественный склероз (MS) — прогрессивное неврологическое расстройство, отмеченное демилиническими повреждениями в центральной нервной системе. Хотя МРТ имеет важное значение для диагностирования MS, сегментация ручного повреждения занимает много времени и подвержена колебаниям. В этом исследовании разработан автоматизированный подход к глубокому обучению (DL) для сегментации MS-повреждения с использованием 3D-FLAIR MRI. МЕТОД: Была разработана модель R2AUNet DL, включающая повторяющиеся остаточные блоки и ворота внимания в рамках 3D U-Net. Набор данных включал 112 сканированных МРТ с 95 пациентов MS, собранных в период с 2019 по 2023 год в системе архивных и коммуникационных систем < < Шираз > > (PACS). У всех пациентов был подтвержден диагноз MS, основанный на клинических оценках и критериях McDonald 2017 года, при этом ручные сегменты поражения от экспертов-невралогов были наземной правдой. Эта модель была подготовлена с использованием оптимизированного трубопровода для предварительной обработки (выведение мозга, корректировка поля отклонения, нормализация интенсивности и извлечение 3D патча). Для оценки эффективности использовались коэффициент сходства (ДСК), специфичность, чувствительность, значение F1 и точность. ОЦЕНКА: Предлагаемая модель достигла DSC 0,768 на испытательном комплекте с точностью 0,998, чувствительностью 0,765 и точностью 0,825, демонстрирующей прочные сегментационные характеристики. Качественный анализ подтвердил способность модели точно разграничивать повреждения при одновременном сокращении ложных положительных результатов. ЗАКЛЮЧЕНИЕ: R2AUNet представляет собой надежное и автоматизированное решение для сегментации поражения MS от 3D-FLEAR MRI, обеспечивающее высокую точность и эффективность. Это исследование показывает, что автоматизированная модель DL может обеспечить точную сегментацию MS с использованием только 3D-FLEAR MRI, устраняя потребность в нескольких последовательностях MRI. Это упрощает сбор данных, снижает вычислительную сложность и повышает доступность, особенно в условиях ограниченности ресурсов.
Оригинал публикации

Automated multiple sclerosis lesion segmentation from 3D-FLAIR MRI using R2AUNet: A deep learning approach with recurrent residual and attention mechanisms.

BACKGROUND: Multiple sclerosis (MS) is a progressive neurological disorder marked by demyelinating lesions in the central nervous system. While MRI is essential for MS diagnosis, manual lesion segmentation is time-consuming and prone to variability. This study develops an automated deep learning (DL) approach for MS lesion segmentation using 3D-FLAIR MRI.

METHOD: The R2AUNet DL model, incorporating recurrent residual blocks and attention gates within a 3D U-Net framework, was developed. The dataset included 112 MRI scans from 95 MS patients, collected between 2019 and 2023 at Shiraz Picture Archiving and Communication System (PACS). All patients had a confirmed MS diagnosis based on clinical assessments and the 2017 McDonald criteria, with manual lesion segmentations from expert neurologists as ground truth. The model was trained using an optimized preprocessing pipeline (brain extraction, bias field correction, intensity normalization, and 3D patch extraction). Dice Similarity Coefficient (DSC), specificity, sensitivity, F1-score, and precision were used to evaluate performance.

RESULT: The proposed model achieved a DSC of 0.768 on the test set, with an accuracy of 0.998, sensitivity of 0.765, and precision of 0.825, demonstrating robust segmentation performance. Qualitative analysis confirmed the model's ability to accurately delineate lesions while reducing false positives.

CONCLUSION: R2AUNet provides a reliable and automated solution for MS lesion segmentation from 3D-FLAIR MRI, offering high accuracy and efficiency. This study demonstrates that an automated DL model can achieve accurate MS lesion segmentation using only 3D-FLAIR MRI, eliminating the need for multiple MRI sequences. This simplifies data acquisition, reduces computational complexity, and improves accessibility, particularly in resource-limited settings.

Предметные рубрики MeSH

ИП Урсолов Владлен Сергеевич

ИНН 500118482352 · ОГРНИП 314500117700049

Реквизиты и контакты