m+Medelevator.RU
← Поиск публикаций
International journal of molecular sciences · 2025

GPX1 и RCN1 как новые эндоплазмические ретикулумные биомаркеры, связанные со стрессом, в многоклерозном мозге и их участие в APP-CD74 Pathway: A Integrated Study Commining Machine Learning и Multi-Omics.

DatasetСтатьяНазвание и аннотация: Машинный перевод · не проверен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…

История · было → стало

Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.

Qiao Zhixin, Wang Yanping, Ma Xiaoru, Zhang Xiyu, Wu Junfeng, Li Anqi, Wang Chao, Xiu Xin, Zhang Sifan, Lang Xiujuan, Liu Xijun, Sun Bo, Li Hulun, Liu Yumei

Аннотация

В ходе этого исследования были выявлены 13 связанных с эндоплазмическим ретикулумным стрессом (ERS) биомаркеров, связанных с множественным склерозом (MS), на основе комплексного анализа биоинформатики (включая анализ взвешенной генной сети совместного самовыражения и алгоритмы машинного обучения) и секвенирования в одной клетке в сочетании с проверкой в экспериментальной модели мыши аутоиммунной энцефаломиелита (EAE). Среди них GPX1, RCN1 и UBE2D3 показали высокое диагностическое значение (AUC > 0,7, p < 0,05), и диагностический потенциал GPX1 и RCN1 был подтвержден в модели животных. Исследование показало, что клетки памяти B, плазменные клетки, нейтрофилы и макрофаги M1 значительно возросли у пациентов с MS, в то время как наивные клетки B и активированные клетки NK сократились. Консенсусное объединение на основе ключевых генов, связанных с ERS, разделило пациентов MS на два подтипа. Секвенирование одноклеточных клеток показало, что микроглии и перициты являются типами клеток с наивысшим выражением ключевых генов, связанных с ERS, и что траектория APP-CD74 была усилена в мозговых тканях пациентов с MS. Анализ менделий случайности показал, что GPX1 играет защитную роль в MS. Эти выводы показывают механизмы биомаркировок, связанных с ERS, в MS и определяют потенциальные целевые показатели для диагностики и лечения.
Оригинал публикации

GPX1 and RCN1 as New Endoplasmic Reticulum Stress-Related Biomarkers in Multiple Sclerosis Brain Tissue and Their Involvement in the APP-CD74 Pathway: An Integrated Study Combining Machine Learning and Multi-Omics.

This study identified 13 endoplasmic reticulum stress (ERS)-related biomarkers associated with multiple sclerosis (MS) through integrated bioinformatics analysis (including weighted gene co-expression network analysis and machine learning algorithms) and single-cell sequencing, combined with validation in an experimental autoimmune encephalomyelitis (EAE) mouse model. Among them, GPX1, RCN1, and UBE2D3 exhibited high diagnostic value (AUC > 0.7, p < 0.05), and the diagnostic potential of GPX1 and RCN1 was confirmed in the animal model. The study found that memory B cells, plasma cells, neutrophils, and M1 macrophages were significantly increased in MS patients, while naive B cells and activated NK cells decreased. Consensus clustering based on key ERS-related genes divided MS patients into two subtypes. Single-cell sequencing showed that microglia and pericytes were the cell types with the highest expression of key ERS-related genes, and the APP-CD74 pathway was enhanced in the brain tissue of MS patients. Mendelian randomization analysis suggested that GPX1 plays a protective role in MS. These findings reveal the mechanisms of ERS-related biomarkers in MS and provide potential targets for diagnosis and treatment.

Предметные рубрики MeSH

ИП Урсолов Владлен Сергеевич

ИНН 500118482352 · ОГРНИП 314500117700049

Реквизиты и контакты