STAR protocols · 2026
Protocol for purifying and sequencing cell subpopulations based on RNA FISH signal in planaria.
СтатьяНазвание и аннотация: Перевод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
McKinney Mary Cathleen, Morrison Jason A, Mann Frederick G, Vuu Dung M, Brewster Carolyn E, Hall Kate E, Benham-Pyle Blair W, Sánchez Alvarado Alejandro
Аннотация
Isolation and characterization of rare cell types in non-model organisms present a challenge. Here, we provide a protocol to purify specific cells from planaria for downstream RNA sequencing. We employ a one-step dissociation and fixation method that avoids RNA-degrading formaldehyde. We label cells using RNA fluorescence in situ hybridization (RNA FISH) and flow sort to enrich sequencing reads from cells of interest for deeper biological insight. For complete details on the use and execution of this protocol, please refer to Mann et al.1.