Environmental research · 2019
Quenching by sodium thiosulfate does not influence 16S rRNA gene sequencing profiles of reclaimed water from three sites in the Mid-Atlantic, United States.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАНазвание и аннотация: Перевод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Allard Sarah M, Solaiman Sultana, Callahan Mary Theresa, Bui Anthony, Craddock Hillary, Haymaker Joseph, Foust Derek, Duncan Rico, Smyth Eoghan, Mongodin Emmanuel F, Hashem Fawzy, May Eric, Micallef Shirley A, Sapkota Amy R
Аннотация
A quenching agent is commonly added to chlorinated, reclaimed water during sample collection to prevent chlorine-mediated die-off of viable microbiota. However, the effect of quenching on downstream 16S rRNA-based bacterial community analyses is unclear. We conducted a side-by-side comparison of 16S rRNA sequencing data from reclaimed water samples quenched with sodium thiosulfate and non-quenched samples. Our data showed that 16 S rRNA processing and sequencing methods, and resulting bacterial profiles, were not negatively impacted by quenching.