Обнаружение и количественная оценка спирошеток Лайма с использованием чувствительных и специальных молекулярных зондов.
Аннотация
Болезнь Лайма, вызванная Боррелией Бурдорфери, затрагивает большое число людей как в США, так и в Европе. Мышь является естественным носителем этого спирошета и широко используется в качестве модели системы для изучения патогенеза Лайма. Поскольку проявления заболеваний часто зависят от нагрузки на спироше в той или иной ткани, крайне важно точно измерить количество бактерий в зараженных тканях. Нынешние методы либо не учитывают чувствительность и специфичность (SYBR Green), либо требуют независимого анализа образцов параллельно с квантитацией хостовой и бактериальной ДНК (TaqMan). Мы разработали новый, основанный на молекулярном маяке удобный мультиплексный количественный анализ PCR в реальном времени для выявления и обнаружения небольшого количества B. burborferi в зараженных мышиных тканях. Мы показываем здесь, что молекулярные маяки являются эффективными, чувствительными и конкретными зондами для обнаружения и оценки большого числа B. burgdorferi в присутствии ДНК мыши. В наших оценках, спирошетная река и мышиные нидогенные гены были обнаружены одновременно с использованием молекулярных маяков, помеченных различными фторофорами. Кроме того, мы подтвердили применение этих зондов путем количественной оценки штамма диких типов и bgp-дефективного мутанта B. Burgdorferi. Мутант, дефективный bgp, показывает десятикратное снижение уровня спирошеток, содержащихся в различных тканях.
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
Высокая чувствительность и специфичность молекулярных маяков делают их высшими зондами для обнаружения небольших количеств B. burgdorferi. Кроме того, использование молекулярных маяков может быть расширено для одновременного обнаружения и количественной оценки многочисленных патогенов в зараженных хостах, включая людей, и в векторах артроподов.
Название и аннотация на языке оригинала
Detection and quantification of Lyme spirochetes using sensitive and specific molecular beacon probes.
BACKGROUND
Lyme disease, caused by Borrelia burgdorferi, affects a large number of people in both the USA and Europe. The mouse is a natural host for this spirochete and is widely used as a model system to study Lyme pathogenesis mechanisms. Since disease manifestations often depend upon the spirochete burden in a particular tissue, it is critical to accurately measure the bacterial number in infected tissues. The current methods either lack sensitivity and specificity (SYBR Green), or require independent analysis of samples in parallel to quantitate host and bacterial DNA (TaqMan). We have developed a novel molecular beacon-based convenient multiplex real-time quantitative PCR assay to identify and detect small numbers of B. burgdorferi in infected mouse tissues.
RESULTS
We show here that molecular beacons are effective, sensitive and specific probes for detecting and estimating wide-ranging numbers of B. burgdorferi in the presence of mouse DNA. In our assays, the spirochete recA and the mouse nidogen gene amplicons were detected simultaneously using molecular beacons labeled with different fluorophores. We further validated the application of these probes by quantifying the wild-type strain and bgp-defective mutant of B. burgdorferi. The bgp-defective mutant shows a ten-fold reduction in the level of spirochetes present in various tissues.
CONCLUSION
The high sensitivity and specificity of molecular beacons makes them superior probes for the detection of small numbers of B. burgdorferi. Furthermore, the use of molecular beacons can be expanded for the simultaneous detection and quantification of multiple pathogens in the infected hosts, including humans, and in the arthropod vectors.
Предметные рубрики MeSH
Подготовка и перевод публикации
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Тип публикации указан по данным источника. Уровень доказательности автоматически не присваивается.