Сравнительная гибридизация генома свидетельствует о значительных различиях между клиническими изолированиями борелия бурдорфери sensu stricto с различными патогенными свойствами.
Аннотация
Клинические и мумринические исследования показывают, что существует дифференциальная патогенность различных генотипов Борелия Бурдорфери, спирошетарного агента болезни Лайма. Сравнительная гибридизация генома использовалась для изучения взаимосвязи между различными генотипами. Хромосомы всех изученных изолированных были очень сохранены (>93%) как в плане последовательности, так и в геновом порядке. Плазменные последовательности были значительно более разнообразными. Плазмиды Ip54, Cp26 и Cp32 присутствовали во всех испытанных изолирующих устройствах, и их последовательности и геновый порядок были сохранены. Большинство линейных плазмидов демонстрировали вариацию как с точки зрения присутствия между различными изолированными слоями, так и с точки зрения последовательности и генетического порядка. Данные в значительной степени свидетельствуют о том, что все клинические изолирования B. burgdorferi содержат линейные плазмиды, связанные друг с другом, однако структура этих репликонов может существенно варьироваться от изоляции до изоляции. Эти изменения включают исключения и предполагаемые изменения структуры, которые могут привести к появлению уникальных плазменных элементов во многих изолированных частях. Существует тесная взаимосвязь между полными профилями гибридизации генома и другими методами печатания, что, в свою очередь, также связано с различиями в патогенности. Поскольку хромосомные и круговые плазмидные части генома значительно менее отличаются друг от друга, основные различия в содержании открытых считывающих кадров и геномном разнообразии между изолирующими элементами связаны с линейным плазмидом.
Название и аннотация на языке оригинала
Comparative genome hybridization reveals substantial variation among clinical isolates of Borrelia burgdorferi sensu stricto with different pathogenic properties.
Clinical and murine studies suggest that there is a differential pathogenicity of different genotypes of Borrelia burgdorferi, the spirochetal agent of Lyme disease. Comparative genome hybridization was used to explore the relationship between different genotypes. The chromosomes of all studied isolates were highly conserved (>93%) with respect to both sequence and gene order. Plasmid sequences were substantially more diverse. Plasmids lp54, cp26, and cp32 were present in all tested isolates, and their sequences and gene order were conserved. The majority of linear plasmids showed variation both in terms of presence among different isolates and in terms of sequence and gene order. The data strongly imply that all B. burgdorferi clinical isolates contain linear plasmids related to each other, but the structure of these replicons may vary substantially from isolate to isolate. These alterations include deletions and presumed rearrangements that are likely to result in unique plasmid elements in many isolates. There is a strong correlation between complete genome hybridization profiles and other typing methods, which, in turn, also correlate to differences in pathogenicity. Because there is substantially less variation in the chromosomal and circular plasmid portions of the genome, the major differences in open reading frame content and genomic diversity among isolates are linear plasmid driven.
Предметные рубрики MeSH
Подготовка и перевод публикации
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Тип публикации указан по данным источника. Уровень доказательности автоматически не присваивается.