DOI 10.1016/j.ijmmb.2022.07.008
Эпидемиологическая, клиническая и генетическая характеристика скруба тифа у пациентов с острым фебриальным заболеванием в Дели.
Аннотация
ЦЕЛЬ
" Скруб тифа " ( " ST " ) является зоонотической болезнью, вызванной О. цуцугамуши, одной из основных причин острого фебрилального заболевания (АФИ) в Индии. Необходимо изучить распространенность и факторы риска в различных регионах Индии.
МЕТОДЫ
Было проведено исследование для оценки распространенности и изучения факторов риска, связанных с СТ, у пациентов с острым фебриальным заболеванием (АФИ). Все пациенты прошли курс серологии на антитела IgM до Orientia tsutsugamushi (In Bios International Inc., Syteel, WA) согласно протоколу производителей. После этого реакция Polymerase Chain (PCR) (на основе зеленого SYBR в реальном времени, ориентированного на ген криогена и обычного ПЦР, ориентированного на конкретные антигенные гены типа 56 кДа) была выполнена на основе хранящихся образцов сыворотки.
Результаты
В течение учебного периода было принято 473 пациента. Из этих 56 (11,8%) пациентов по серологии IgM были положительной. Обычный PCR, ориентированный на 56 кДа конкретный антигенный ген O. tsutsugamushi, был положительным у шести пациентов, в то время как PCR на основе Ot groEL SYBR был положительным в пяти. ПЦР был положительным у пациентов, которые продемонстрировали более высокий уровень УД в ЭЛИСА. PCR-положительные ампликоны были отправлены на секвенирование Sanger и подтверждены как O. tsutsugamushi. Средний возраст пациентов составлял 49 ± 18,3 года, а на мужчин приходилось больше пациентов (67,9%, n = 38 лет). Патономонный эшар присутствовал у 7 пациентов (12,5%). Филогенетический анализ показал, что последовательности сгруппированы близко к штамму Уалейна-20 и штамму Карпа, как Linh DT. В нашем исследовании всем пациентам ввели доксициклин. Смертность была зарегистрирована у 8,9% пациентов.
ВЫВОДЫ
В случае пациентов с острым фебриальным заболеванием ST следует рассматривать в качестве дифференциального диагноза, особенно в постмонсональный сезон. Наряду с серологией сыворотка может также использоваться в качестве образца для ПЦР в внутриклеточном бактерии, таком как О. Цутсугамуши.
Название и аннотация на языке оригинала
Epidemiological, clinical and genetic characterization of scrub typhus in patients presenting with acute febrile illness in New Delhi.
PURPOSE: Scrub typhus (ST) is a zoonotic disease, caused by O. tsutsugamushi is a major cause of acute febrile illness (AFI) in India. There is a need to study the prevalence and risk factors in various regions of India.
METHODS
A study to estimate the prevalence and study the risk factors of ST in patients presenting with acute febrile illness (AFI) was performed. All patients underwent serology for IgM antibodies to Orientia tsutsugamushi (In Bios International Inc, Seattle, WA) as per the manufacturers' protocol. Following this, Polymerase Chain reaction (PCR) (real time SYBR green based targeting groEL gene and conventional PCR targeting 56 kDa type specific antigen gene) was performed from stored serum samples.
RESULTS
During the study period, 473 patients were admitted. Of these 56 (11.8%) patients were ST positive by IgM serology. The conventional PCR targeting 56 kDa type specific antigen gene of O. tsutsugamushi was positive in six patients while Ot groEL SYBR green based PCR) was positive in five. PCR was positive in patients who had demonstrated a higher OD value in ELISA. Conventional PCR positive amplicons were sent for Sanger sequencing and confirmed to be O. tsutsugamushi. The mean age of the patients was 49 ± 18.3 years and males constituted a higher number of patients (67.9%, n = 38). The pathognomonic eschar was present in 7 (12.5%) patients. Phylogenetic analysis revealed that sequences clustered close to Kato-like Hualein-20 strain and Karp-like Linh DT strains. All patients were administered doxycycline in our study. Mortality was recorded in 8.9% of the patients.
CONCLUSIONS
In patients presenting with acute febrile illness, ST should be considered as a differential diagnosis, especially in post-monsoon season. Along with serology, serum can also be used as sample for PCR in an intracellular bacterium like O. tsutsugamushi.
Предметные рубрики MeSH
Подготовка и перевод публикации
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Тип публикации указан по данным источника. Уровень доказательности автоматически не присваивается.