Молекулярное исследование в Q Fever: обнаружение на основе ПКР ожогов Коксиеллы из ретроспективного исследования клинических образов в больнице третьей инстанции Северной Индии.
Аннотация
Q лихорадка, вызванная Coxiella signetii, является недостаточно диагностированной зоонотической болезнью, имеющей значительные последствия для здоровья населения. Серологические тесты остаются диагностическим краеугольным камнем, но зачастую не дают результатов при ранней инфекции. В этом исследовании изучается полезность цепной реакции полимеразы (ПХР), ориентированной на ген IS1111 для молекулярного обнаружения C. sergetii в клинических образцах человека в условиях ограниченных ресурсов.
МЕТОДЫ
Было проведено ретроспективное исследование на основе ПЦР на 243 архивных клинических образцах, собранных у пациентов с фебрилом в 11 округах Северной Индии. ДНК была извлечена и подвергнута обычному ПЦР, направленному на последовательность ввода IS1111. Пробы, положительные для C. sergetii, были дополнительно оценены на предмет наличия примеси рикетсиальных патогенов с использованием ПЦР в режиме реального времени. Для определения генетических связей на положительных образцах был проведен анализ последовательности и филогенетического анализа.
Результаты
ДНК C. signetii была обнаружена в 4 из 243 образцов (1,64%). Половина положительных случаев приходилась на пациентов в возрастной группе от 1 до 15 лет, а у двоих были примеси от Ориции цуцугамуши. В одном случае были обнаружены следы пятнистой лихорадки группы рикетсия. Клинические характеристики включали лихорадку (100%), миальгию (75%) и сыпь (25%). Филогенетический анализ показал, что изолирующие элементы сгруппированы с исходным штаммом Z3055, что указывает на тесную генетическую связь с известными зоонотическими штаммами.
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
ПЦР, ориентированный на IS1111, является ценным диагностическим инструментом для раннего обнаружения C. sergetii, особенно в тех случаях, когда серологические испытания задерживаются или отсутствуют. Обнаружение у педиатрических пациентов и примитивная связь с другими рикетсиаами подчеркивают необходимость более широкого диагностического рассмотрения лихорадки Q в случае эндемических заболеваний фебрилов.
Название и аннотация на языке оригинала
Molecular Insights into Q Fever: PCR-Based Detection of Coxiella burnetii from Clinical Specimens-A Retrospective Study from a Tertiary Care Hospital of North India.
BACKGROUND
Q fever, caused by Coxiella burnetii, is an underdiagnosed zoonotic disease with significant public health implications. Serological tests remain the diagnostic cornerstone but often fail in early infection. This study investigates the utility of polymerase chain reaction (PCR) targeting the IS1111 gene for molecular detection of C. burnetii in human clinical samples from a resource-limited setting.
METHODS
A retrospective PCR-based study was conducted on 243 archived clinical specimens collected from febrile patients across 11 districts of North India. DNA was extracted and subjected to conventional PCR targeting the IS1111 insertion sequence. Samples positive for C. burnetii were further evaluated for coinfection with rickettsial pathogens using real-time and nested PCRs. Sequencing and phylogenetic analysis were performed on positive samples to determine genetic relationships.
RESULTS
C. burnetii DNA was detected in 4 of 243 samples (1.64%). Half the positive cases belonged to the patients in 1-15 year age group, and two had coinfections with Orientia tsutsugamushi. One case showed coinfection with spotted fever group rickettsia. Clinical features included fever (100%), myalgia (75%), and rash (25%). Phylogenetic analysis revealed that the isolates clustered with the Z3055 reference strain, indicating a close genetic relationship to known zoonotic strains.
CONCLUSION
PCR targeting IS1111 is a valuable diagnostic tool for early detection of C. burnetii, particularly in settings where serological testing is delayed or unavailable. Detection in pediatric patients and coinfection with other rickettsiae underscore the need for broader diagnostic consideration of Q fever in endemic febrile illnesses.
Предметные рубрики MeSH
Подготовка и перевод публикации
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Тип публикации указан по данным источника. Уровень доказательности автоматически не присваивается.