Biophysical journal · 1990
Tryptophan-47 rotational isomerization in variant-3 scorpion neurotoxin. A combination thermodynamic perturbation and umbrella sampling study.
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАНазвание и аннотация: Перевод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Haydock C, Sharp J C, Prendergast F G
Аннотация
A combination thermodynamic perturbation and umbrella sampling study predicts two free energy wells for the rotational isomerization of the variant-3 scorpion neurotoxin tryptophan-47 indole side chain. One well has the indole side chain in the crystallographic orientation; the other has the indole rotated approximately 220 degrees to form a new conformation with a relative free energy of 3 +/- 2 kcal/mol. The activation barrier is 8.5 kcal/mol from the crystallographic well, from which transition state theory predicts a rate of escape of 2 x 10(5) s-1. Correlations in the displacements of side chains neighboring tryptophan-47 and the isomerization reaction coordinate last up to 20 ps. Favorable conditions of experimental verification are discussed.