MedElevator
Войти в исследования Геномические изменения в японском энцефалите японского генотипа I и сравнение с вирулентным родительским штаммом.
Аннотация
Генотип I японский энцефалит (JEV) штамм SCYA201201 ранее был изолирован от мозговых тканей оторванных поросенок. В этом исследовании мы получили деформированный штамм SCYA201201-0901 путем серийного пропуска штамма SCYA201201-1 в клетках почек сирийских детей-хомяков в сочетании с многократными чистками на табличках и отбором вирулентности у мышей. Мы изучили генетические изменения, связанные с смягчением, сравнивая все геномы SCYA201201-0901 и SCYA201201-1. Сравнение последовательности выявило 14 общих заменителей аминокислот в области кодирования с двумя нуклеотидовыми мутациями в 5-футовом регионе (UTR) и еще три в 3-UTR, которые отличаются между смягченными и вирулентными штаммами. Кроме того, после смягчения последствий было обнаружено в общей сложности 13 тихих нуклеотидных мутаций. Эти заменители, как отдельные, так и комбинированные, могут быть связаны с смягченным фенотипом штамма SCYA201201-0901 у мышей. Эта информация будет способствовать пониманию нами смягчения и молекулярной основы вирулентности в штаммах генотипа I, таких, как SCYA201201-0901, а также поможет разработать более безопасные вакцины JEV.
Название и аннотация на языке оригинала
Genomic changes in an attenuated genotype I Japanese encephalitis virus and comparison with virulent parental strain.
Genotype I Japanese encephalitis virus (JEV) strain SCYA201201 was previously isolated from brain tissues of aborted piglets. In this study, we obtained an attenuated SCYA201201-0901 strain by serial passage of strain SCYA201201-1 in Syrian baby hamster kidney cells, combined with multiple plaque purifications and selection for virulence in mice. We investigated the genetic changes associated with attenuation by comparing the entire genomes of SCYA201201-0901 and SCYA201201-1. Sequence comparisons identified 14 common amino acid substitutions in the coding region, with two nucleotide point mutations in the 5'-untranslated region (UTR) and another three in the 3'-UTR, which differed between the attenuated and virulent strains. In addition, a total of 13 silent nucleotide mutations were found after attenuation. These substitutions, alone or in combination, may be responsible for the attenuated phenotype of the SCYA201201-0901 strain in mice. This information will contribute to our understanding of attenuation and of the molecular basis of virulence in genotype I strains such as SCYA201201-0901, as well as aiding the development of safer JEV vaccines.
Предметные рубрики MeSH
Подготовка и перевод публикации
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Тип публикации указан по данным источника. Уровень доказательности автоматически не присваивается.