MedElevator
Войти в исследования DOI 10.1016/j.jviromet.2019.113713
Быстрое выявление вируса бешенства енотов с использованием обратной реакции полимеразы в режиме реального времени.
Аннотация
Вариант вируса бешенства (RRV), связанный с ензоотизмом, является энзоотическим по всему восточному побережью Соединенных Штатов с частыми вторжениями в Канаду. Многие агентства по рациональному использованию дикой природы активно участвуют в программах контроля, направленных на ликвидацию этого заболевания, и быстрое выявление случаев бешенства енотов имеет решающее значение для успеха этих операций. В этом докладе документируется разработка обратной транскрипции PCR в режиме реального времени (RT-qPCR), которая конкретно идентифицирует этот вариант вируса бешенства (RRV RT-qPCR) и которая может быть легко умножена на стандартный вирус бешенства RT-qPCR для использования в качестве инструмента печати. Используя большой набор образцов бешеного вируса, типичный для различных вариантов, циркулирующих по всему миру, но с уделением особого внимания тем из них, которые происходят в Америке, RRV RT-qPCR была на 100% чувствительной и 99,31% специфической. Для дальнейшего применения этих анализов в диагностических целях было показано, что добавление RT-qPCR, нацеленное на β-actin mRNA, которая служит внутренним контролем амплификации, в тройном формате дает весьма сопоставимые результаты с использованием подмножества нашей вирусной коллекции. Использование этих анализов для раннего и точного выявления этого вирусного варианта поможет оптимизировать использование ресурсов, необходимых для борьбы с этим заболеванием.
Название и аннотация на языке оригинала
Rapid identification of the raccoon rabies virus variant using a real-time reverse-transcriptase polymerase chain reaction.
The raccoon-associated variant of rabies virus (RRV) is enzootic throughout the eastern seaboard of the United States with frequent incursions into Canada. Many wildlife management agencies are actively engaged in control programmes targeting elimination of this disease and rapid identification of raccoon rabies cases is crucial to the success of these operations. This report documents the development of a reverse transcriptase real-time PCR (RT-qPCR) that specifically identifies this rabies virus variant (RRV RT-qPCR) and which can be readily multiplexed with a generic rabies virus RT-qPCR for use as a typing tool. Using a large collection of rabies virus samples representative of the variants circulating around the world, but with a focus on those occurring in the Americas, the RRV RT-qPCR was 100% sensitive and 99.31% specific. To further apply these assays for diagnostic purposes, addition of an RT-qPCR targeting the host β-actin mRNA, which serves as an internal amplification control, in a triplex format was shown to yield highly comparable results using a subset of our viral collection. Use of these assays for early and accurate identification of this viral variant will help to optimize the utilization of resources required for control of this disease.
Предметные рубрики MeSH
Подготовка и перевод публикации
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Тип публикации указан по данным источника. Уровень доказательности автоматически не присваивается.