Молекулярная эпидемиология и эволюция европейского бат-лиссавируса 2.

Случаи бешенства в Европе связаны главным образом с двумя лиссавирусами, а именно с европейскими лиссавирусами бата 1 (EBLV-1) и европейскими лиссавирусами бата 2 (EBLV-2). До смерти работника летучих мышей в Финляндии в 1985 году было зарегистрировано очень мало случаев бешенства летучих мышей. В результате усиленного наблюдения в течение двух последующих лет (1986-1987 годы) было выявлено 263 случая (более одной пятой от всех зарегистрированных случаев на сегодняшний день). В период с 1977 по 2016 год было зарегистрировано 1183 случая бешенства летучих мышей, причем подавляющее большинство (>97%) приходится на EBLV-1. В отличие от этого, было зарегистрировано лишь 39 подозрительных случаев применения EBLV-2, 34 из которых были подтверждены путем печатания вируса и в настоящее время ограничены двумя видами летучих мышей: Myotis daubentonii и Myotis dasycneme. Ограниченное число случаев EBLV-2 в Европе побудило к созданию сети европейских эталонных лабораторий для сбора всех имеющихся вирусов и данных. Несмотря на относительно небольшое число случаев EBLV-2, большое количество аномальных данных было опубликовано в научной литературе, которую мы здесь изучили и прояснили. В ходе этого обзора были проанализированы 29 полных последовательности геномов EBLV-2, с тем чтобы углубить наше понимание разнообразия и молекулярной эволюции EBLV-2 в Европе. Анализ 29 полных последовательности геномов EBLV-2 четко подтверждает географические связи со всеми последовательности EBLV-2, сгруппированными на страновом уровне, независимо от изученного гена. Кроме того, на местном уровне было отмечено дальнейшее географическое объединение. Среди видов EBLV-2 отмечаются высокие уровни однородности с нуклеотидными свойствами от 95,5 до 100% и аминокислотными свойствами от 98,7% до 100%, несмотря на широкое распространение изоляции как в географическом, так и в хронологическом плане. Средняя скорость замещения EBLV-2 по пяти конченным генам составила 1,65 х 10-5, и эволюционный анализ часов подтверждает медленную эволюцию EBLV-2 как между странами Европы, так и внутри них. Кроме того, это подтверждается первым подробным анализом EBLV-2 в рамках геномического анализа, в ходе которого была обнаружена относительно высокая однородность последовательности в геномах трех изолирующих EBLV-2, полученных в течение нескольких лет (2007, 2008 и 2014 годы) от M. daubentonii на том же месте (Стоксейский замок, Шропшир, Соединенное Королевство).