MedElevator
Войти в исследования Длительный прорыв человеческого аденовируса A31 (HAdV-A31) Заражение педиатрической гематопоэтической трансплантации стволовой клетки с целым геномомом, свидетельствующим о международных связях.
Аннотация
В конце 2014 - 2015 годов в больнице < < Шиккидз > > (SK) в Торонто (Канада) было отмечено резкое увеличение числа случаев заражения гематопоиетической трансплантации стволовых клеток человека аденовирусом A31 (HadV-A31). В ответ на это был проведен усиленный лабораторный мониторинг всех аденовирусных инфекций. Положительные пробы прошли через генотипию, вирусную культуру и, в отдельных случаях, последовательность целых генов (РГС). Образцы HADV-A31/DNA, полученные из четырех международных центров HSCT, также прошли WGS. В период вспышки SK (27 октября 2014 года — 31 октября 2018 года) 17/20 HADV-A31 изолировало от 0 до 8 мутации между ближайшими соседями. Наблюдение до и после вспышки выявило еще шесть случаев HADV-A31 HSCT; три из четырех последовательных случаев были сгруппированы в клинок вспышки. Две вспышки SK были идентичны последовательности двух пациентов во время вспышки в Англии. Три последовательности невырыва SK также имели высокую последовательность сходства с штаммами из трех международных центров. Экологические ПЦР-тесты в отделении HSCT показали значительное загрязнение аденовирусом. Несмотря на интенсивные усилия по борьбе с инфекциями, мы наблюдали повторное появление инфекции с штаммом вспышки. В случае HADV-A31 было отмечено более сильное, но не смертельное заражение по сравнению с другими генотипами, за исключением HADV-C1. Наши выводы в значительной степени указывают на носокомиальное распространение HADV-A31 в течение 10 лет на единице HSCT и демонстрируют ценность WGS в определении и картировании вспышки. Тесные связи между нагрузками в различных странах предполагают международное распространение, хотя этот механизм не определен. Эта крупная, продолжительная вспышка подчеркивает первостепенную роль HADV-A31 в возникновении неразрешимых вспышек серьезных заболеваний в педиатрическом возрасте во всем мире.
Название и аннотация на языке оригинала
A Prolonged Outbreak of Human Adenovirus A31 (HAdV-A31) Infection on a Pediatric Hematopoietic Stem Cell Transplantation Ward with Whole Genome Sequencing Evidence of International Linkages.
A surge in hematopoietic stem cell transplantation (HSCT) human adenovirus A31 (HAdV-A31) infections was initially observed in late 2014/2015 at SickKids (SK) Hospital, Toronto, Canada. In response, enhanced laboratory monitoring for all adenovirus infections was conducted. Positive samples underwent genotyping, viral culture, and, in selected cases, whole-genome sequencing (WGS). HAdV-A31 specimens/DNA obtained from four international pediatric HSCT centers also underwent WGS. During the SK outbreak period (27 October 2014 to 31 October 2018), 17/20 HAdV-A31 isolates formed a distinct clade with 0 to 8 mutations between the closest neighbors. Surveillance before and after the outbreak detected six additional HAdV-A31 HSCT cases; three of the four sequenced cases clustered within the outbreak clade. Two SK outbreak isolates were identical to sequences from two patients in an outbreak in England. Three SK non-outbreak sequences also had high sequence similarity to strains from three international centers. Environmental PCR testing of the HSCT ward showed significant adenovirus contamination. Despite intense infection control efforts, we observed re-occurrence of infection with the outbreak strain. Severe but nonfatal infection was observed more commonly with HAdV-A31 compared to other genotypes, except HAdV-C1. Our findings strongly implicate nosocomial spread of HAdV-A31 over 10 years on a HSCT unit and demonstrate the value of WGS in defining and mapping the outbreak. Close linkages among strains in different countries suggest international dissemination, though the mechanism is undetermined. This large, extended outbreak emphasizes the pre-eminent role of HAdV-A31 in causing intractable pediatric HSCT outbreaks of severe illness worldwide.
Предметные рубрики MeSH
Подготовка и перевод публикации
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Тип публикации указан по данным источника. Уровень доказательности автоматически не присваивается.