MedElevator
Войти в исследования DOI 10.1016/j.meegid.2021.105007
Эпидемиология эпидемии эстетического аденовируса из исторических образцов фекалий в Бразилии (1998-2005 годы): период доротавирусной вакцины.
Аннотация
Человеческий аденовирус (HAdV) признается в качестве частой причины острого гастроэнтерита, и внутренности могут сохраняться в замороженных фекалиях в течение длительных периодов времени. Цель настоящего исследования состояла в том, чтобы изучить генотипическое разнообразие в архивных фекальных образцах, хранившихся в период с 1998 по 2005 год, с тем чтобы понять естественную историю HADV у пациентов, страдающих диареей в Бразилии, до введения ротавирусной вакцины. В общей сложности 3346 образцов были испытаны на HADV с использованием обычного ПЦР. Генотипы были определены по последовательности. HADV был обнаружен в 6,8 % (228/3346). Позитивность выше у детей ≤ 5 лет и у мужчин (p < 0,05). HADV чаще всего наблюдалось в зимние и весенние сезоны (p < 0,05). HadV-F41 был самым распространенным генотипом (59,2%; 135/228), за которым следовали HADV-F40 (16,2%; 37/228), HADV-C1 (5,2%; 12/228), HADV-C2 (5,2%; 12/228), HADV-C5 (3,1%; 7/228), HADV-A12 (1,3%; 3/228), HADV-E4 (0,9%2;/228), HadV-B3 (0,9%2;/228) и HadV-B21 (0,4%1; 228). В 7,6 % (17 228) можно было определить только вид D. Трюмы HADV-E4 были phylogenetic проанализированы и классифицированы как род (a)-подобные PG II. Уровень распространения HADV оставался стабильным среди населения Бразилии, независимо от введения ротавирусной вакцины. Преобладающие генотипы HADV, обнаруженные с течением времени, не изменились, что свидетельствует о большом разнообразии циркуляционных штаммов в стране на протяжении десятилетий. Из-за того, что на протяжении всей истории в Бразилии отсутствовала система наблюдения за геономией HADV, эпидемиология HadV-E4 практически неизвестна в стране. Настоящее исследование в значительной степени способствовало пониманию естественной истории ВИЧ-инфекции среди пациентов, страдающих диареей в Бразилии. Приобретенные данные имеют важное значение для клинической диагностики, особенно для исследований по изучению распространенности вирусов и молекулярной эпидемиологии архивных клинических образцов.
Название и аннотация на языке оригинала
Enteric adenovirus epidemiology from historical fecal samples in Brazil (1998-2005): Pre-rotavirus vaccine era.
Human adenovirus (HAdV) is recognized as frequent cause of acute gastroenteritis and enteric viruses can be preserved in frozen stored feces for long periods of times. The purpose of the present study was to investigate enteric HAdV genotypic diversity in archival fecal specimens stored from 1998 to 2005 in order to understand the natural history of HAdV in diarrheal patients in Brazil before rotavirus vaccine introduction. A total of 3346 specimens were tested for HAdV using conventional PCR. Genotypes were identified by sequencing. HAdV was detected in 6.8% (228/3346). Positivity was higher in children ≤ 5 years and males (p < 0.05). HAdV was most frequently observed during winter and spring seasons (p < 0.05). HAdV-F41 was the most prevalent genotype (59.2%;135/228), followed by HAdV-F40 (16.2%;37/228), HAdV-C1 (5.2%;12/228), HAdV-C2 (5.2%;12/228), HAdV-C5 (3.1%;7/228), HAdV-A12 (1.3%;3/228), HAdV-E4 (0.9%;2/228), HAdV-B3 (0.9%;2/228) and HAdV-B21 (0.4%;1/228). In 7.6% (17/228) only species D could be defined. HAdV-E4 strains were phylogenetic analyzed and classified as lineage (a)-like PG II. HAdV prevalence remained stable in Brazilian population, regardless rotavirus vaccine introduction. The predominant HAdV genotypes detected did not change over time, highlighting a high diversity of circulating strains in the country throughout decades. Due to the historical lack of HAdV genotyping surveillance in Brazil, HAdV-E4 epidemiology is virtually unknown in the country. The present study contributed significantly to the understanding of the natural history of HAdV in diarrheal patients in Brazil. The acquired data are important for clinical diagnosis, particularly for studies investigating enteric viruses' prevalence and molecular epidemiology of archival clinical specimens.
Предметные рубрики MeSH
Подготовка и перевод публикации
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Тип публикации указан по данным источника. Уровень доказательности автоматически не присваивается.