Перспективная идентификация гЭМ-В во время вспышки 2005 года.

Enteroviruses (EVs) представляют собой основные этиологические агенты эпидемий вирусного менингита, и особенно серотипы, связанные с видом человека энтеровируса B. Генетическая опечатка по последовательности определенной части генома PCR оказалась полезной для идентификации ЭМ и является более быстрой, чем стандартные тесты на серонейтрализацию. Вместе с тем в ходе обычной практики в клинической диагностической лаборатории не сообщалось о перспективном генотификации. Для усиления и последовательности последовательности кодирования VP1 серотипов HEV-B был разработан анализ генетического печатания с использованием двух наборов демпферов. Идентификация проводилась путем сопоставления последовательности с последовательности ЭМ в GenBank с использованием поискового инструмента BLAST и была подтверждена филогенетическим анализом. Этот метод использовался для выявления в перспективе 48 энтеровирусов, изолированных у пациентов с энтеровирусным менингитом (n = 41) или другими клиническими проявлениями (n = 7), принятых в университетскую больницу Клермонт-Ферран (Франция) в 2005 году. Этот анализ также использовался для ретроспективного печатания ЭМ, изолированных в образцах цереброспинной жидкости 25 пациентов, попавших в педиатрическую больницу Троусео в Париже (Франция) в период с февраля по август 2005 года. Как в перспективном, так и в ретроспективном исследовании менингита наиболее частым серотипом был эховирус 30 (E30), за которым последовали в понижающем порядке E18, E13, cexsackievirus B5, B3, E6, E4, E7, E11, E33 и cexsackievirus A9. У пациентов с другими проявлениями коксакевирус B3, B5 и E3 были выявлены дважды, и E2 один раз. В E30 инфицированных пациентов девять различных родословных были продемонстрированы филогенетическим анализом. Генетическая печать позволила в перспективе, эффективно и оперативно выявлять все ЭМ-изоляции, связанные со вспышкой 2005 года. Молекулярное печатание в сочетании с филогенетическим анализом будет надежным средством подтверждения появления новых ЭМ и представляет интерес как для отдельных пациентов, так и для общественного здравоохранения.