MedElevator Войти в исследования
← Поиск публикаций

DOI 10.1111/tmi.14083

Медицинская библиотека · Tropical medicine & international health : TM & IH · 2024

Такман Аррей Карта в режиме реального времени цепная реакция полимеразы для обнаружения патогенов в целой крови фебрильных стационаров в северной части Танзании, 2016 - 2019 годы.

Ngocho James S, Liu Jie, Kalengo Nathaniel H, Kipengele Asia H, Maro Athanasia, Mujage Buliga, Senyael Ndealilia, Gratz Jean, Kilonzo Kajiru G, Kinabo Grace, Lwezaula Bingileki F, Lyamuya Furaha, Marandu Annette, Mbwasi Ronald, Mmbaga Blandina T, Mosha Calvin, Carugati Manuela, Madut Deng B, Bonnewell John P, Maze Michael J, Maro Venance P, Crump John A, Houpt Eric R, Rubach Matthew P

СтатьяМашинный перевод · не проверен

Аннотация

СПРАВОЧНАЯ ИНФОРМАЦИЯ: Острое желудочное заболевание является общей причиной для получения медицинской помощи в странах с низким и средним уровнем дохода. Мы описываем диагностическую полезность карты TackMan Array (TAC) в режиме реального времени цепной реакции полимеразы (PCR) для обнаружения патогенов у педиатрических и взрослых стационарных больных с фебрилевым заболеванием.

МЕТОДЫ

В рамках этого перспективного когортного исследования мы проверили медицинские приемы на тимпаническую температуру ≥38,0°C или лихорадку в течение 72 часов и использовали PCR для обнаружения патогенов, включая бактерии, вирусы, грибы и протозоа, в 697 участников. Мы сравнили результаты ПЦР с обычными диагностическими методами и расценили обнаружение ПЦР как причину лихорадки, за исключением плазмодиевых спы и спа Шистосомы. Участники тестов ПЦР отбирались последовательно после окончания обучения.

Результаты

Из 1132 участников группы 697 (61,6%) были проверены ПЦР. Средний возраст (IQR) — 29,6 (4,6-46,4) лет. Триста семьдесят восемь (54,2%) — мужчины. Метод ПЦР улучшил выявление заболеваний, увеличив диагностическую производительность с 73 (10,5%) традиционными методами до 124 (17,8%) из 697 участников. Обнаружение ПЦР включало четыре вирусных патогена: денге (n = 1), энтеровирус (n = 7), корь (n = 1) и вирус Рифт-Вэлли (RVFV) (n = 3). Сорок шесть бактериальных патогенов были обнаружены в 44 (6,3%) участниках, включая крепостные бактерии, такие, как бартонелла сприп. (n = 2), Brusella spp. (n = 3), Coxiella signetii (n = 2), Leptospira spp. (n = 1), M. Turban (n = 7) и Rickettsia spp. (n = 9).

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

PCR-кадр усовершенствовал процесс обнаружения патогенов в стационарах фебрилов, обеспечив клинически осуществимые результаты для быстродействующих бактерий и эпидемиологически значимые результаты, такие как обнаружение RVFV, в сочетании с обычными методами.

Для цитирования: Ngocho James S, Liu Jie, Kalengo Nathaniel H, Kipengele Asia H, Maro Athanasia, Mujage Buliga, Senyael Ndealilia, Gratz Jean, Kilonzo Kajiru G, Kinabo Grace, Lwezaula Bingileki F, Lyamuya Furaha, Marandu Annette, Mbwasi Ronald, Mmbaga Blandina T, Mosha Calvin, Carugati Manuela, Madut Deng B, Bonnewell John P, Maze Michael J, Maro Venance P, Crump John A, Houpt Eric R, Rubach Matthew P. TaqMan Array Card real-time polymerase chain reaction panel to detect pathogens in whole blood of febrile inpatients in northern Tanzania, 2016-2019.. Tropical medicine & international health : TM & IH. 2024. DOI: 10.1111/tmi.14083.
Название и аннотация на языке оригинала

TaqMan Array Card real-time polymerase chain reaction panel to detect pathogens in whole blood of febrile inpatients in northern Tanzania, 2016-2019.

BACKGROUND

Acute febrile illness is a common reason for seeking healthcare in low- and middle-income countries. We describe the diagnostic utility of a TaqMan Array Card (TAC) real-time polymerase chain reaction (PCR) panel for pathogen detection in paediatric and adult inpatients admitted with febrile illness.

METHODS

In this prospective cohort study, we screened medical admissions for a tympanic temperature ≥38.0°C or reported fever within 72 h and used a PCR panel to detect pathogens, including bacteria, viruses, fungi and protozoa, in 697 participants. We compared PCR results to conventional diagnostic methods and considered PCR detections as the cause of fever, except for Plasmodium spp. and Schistosoma spp. Participants for PCR testing was consecutively selected from the end of enrolment.

RESULTS

Of 1132 participants enrolled in the cohort, 697 (61.6%) were tested by PCR. Median (IQR) age was 29.6 (4.6-46.4) years. Three hundred seventy-eight (54.2%) were male. The PCR method improved illness identification, increasing diagnostic yield from 73 (10.5%) by conventional methods to 124 (17.8%) of 697 participants. PCR detections included four viral pathogens: dengue (n = 1), enterovirus (n = 7), measles (n = 1) and Rift Valley Fever Virus (RVFV) (n = 3). Forty-six bacterial pathogens were detected in 44 (6.3%) participants, including fastidious bacteria such as Bartonella spp. (n = 2), Brucella spp. (n = 3), Coxiella burnetii (n = 2), Leptospira spp. (n = 1), M. tuberculosis (n = 7) and Rickettsia spp. (n = 9).

CONCLUSION

The PCR panel improved pathogen detection in febrile inpatients, providing clinically actionable results for fastidious bacteria and epidemiologically relevant findings like RVFV detections, when combined with conventional methods.

Предметные рубрики MeSH

Подготовка и перевод публикации
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…

История · было → стало

Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.

Тип публикации указан по данным источника. Уровень доказательности автоматически не присваивается.