Молекулярное эволюционное понимание связи между вирусом Марбурга и резервуаром летучих мышей.

Летучие мыши, часто молчаливые носители смертоносных патогенов, служат естественными резервуарами для многочисленных вирусов, способных преодолевать барьеры видового происхождения с разрушительными последствиями. Среди них Rousettus aegyptiacus (R. aegyptiacus) появился в качестве ключевого вида в понимании вирусных побочных эффектов. Эта фруктовая летучая мышь носит вирус Марбурга (MARV), подкрепляющий его воспроизведение и случайную передачу людям, где он вызывает смертельное кровоизлияние. Однако поразительный парадокс сохраняется, в то время как инфекция МАРВ является смертельной у людей, Р. агиптиакус остается асимптомой. Следуя этому контрасту, наше исследование изучает модели использования кодона для выявления эволюционных механизмов, лежащих в основе вирусной адаптации и терпимости. Отнюдь не будучи пассивным носителем, Р. агиптиак представляет собой прозорливую модель антивирусных исследований. Наш анализ выявил различные модели использования кодона в MARV, что указывает на то, что эволюционная увязка с предпочтениями носителя кодона. MARV продемонстрировал низкую необъективность кодона, что говорит о широкой совместимости с переводческим аппаратом носителя. Кроме того, анализ COA и PR2 показал, что экологические факторы определяют выбор кодона как в вирусе, так и в носителе. Анализ изменений в РНК выявил частые переходы от цитосина к тирену, что подразумевает сохранение мутного давления или редактирование при ведущей роли принимающей стороны. Изменения в значениях КОДИ свидетельствуют о деоптимизированном использовании кодона.