Scientific data · 2026
First chromosome scale genome of Acrocomia aculeata.
СтатьяDatasetПоддержка исследования: вне правительства СШАНазвание и аннотация: Перевод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Scaketti Matheus, Garcia Caroline Bertocco, Rabelo-Araujo João Victor da Silva, de Carvalho Igor Araujo Santos, Ludwig Thiago Deomar, Martins Kauanne Karolline Moreno, Riaño-Pachón Diego Mauricio, Neto Durval Dourado, Labate Carlos Alberto, Vicentini Renato, Pinheiro José Baldin, Vianna Suelen Alves, Colombo Carlos Augusto, Díaz-Hernández Brenda Gabriela, Morales-Marroquín Jonathan, Zucchi Maria Imaculada
Аннотация
Acrocomia aculeata (macaúba) is an oil-producing palm with high potential for sustainable bioenergy in tropical regions. We present the first chromosome-scale, haplotype-resolved genome assembly for the species and the genus, generated with Oxford Nanopore, PacBio HiFi, and Hi-C sequencing. The assembly spans 1.94 Gbp organized into 15 pseudochromosomes (N50 = 143.43 Mbp; QV = 76.4), with two fully phased haplotypes (Hap1: 1.93 Gbp; Hap2: 1.92 Gbp) resolved at chromosome scale. Genome completeness reached 98.9% complete BUSCOs for predicted proteins and > 90% k-mer completeness. Repetitive elements comprise 73-77% of the genome, with LTR retrotransposons accounting for ~55%. The LTR Assembly Index (LAI = 25.11) confirms gold-standard quality, sustained across both haplotypes. Annotation predicted 28,367 protein-coding genes with structural consistency across haplotypes and similarity to other palm genomes. Comparative analyses revealed strong chromosomal collinearity with closely related species. This reference genome supports evolutionary genomics, conservation, and molecular breeding of macaúba.